Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

JAGN1

jagunal vesicle mediated transporter 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
3p25.3
Koordinaadid
Kromosoom 3: 9 890 610–9 894 349 (GRCh38)
Eksonid
2 eksonit, ulatus 3,7 kb
Valk
183 aminohapet
Tuntud ka kui
GL009, FLJ14602
MANE Select transkript
ENST00000647897.1NM_032492.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanne

Kuidas JAGN1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 3, millel on sulg kohal, kus asub JAGN1. JAGN1 ja sellele lähedal asuvad 30 geeni kromosoomil 3, vahemikus 9 392 480 kuni 10 392 479.Kromosoom 33p25.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q299,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbSETD5: 9 397 609–9 479 240, otsene ahelSETD5LHFPL4: 9 498 361–9 553 862, pöördne ahelLHFPL4MTMR14: 9 649 307–9 702 394, otsene ahelMTMR14CPNE9: 9 703 691–9 729 908, otsene ahelCPNE9BRPF1: 9 731 726–9 748 019, otsene ahelBRPF1OGG1: 9 749 938–9 791 067, otsene ahelOGG1CAMK1: 9 757 341–9 770 606, pöördne ahelTADA3: 9 779 964–9 793 011, pöördne ahelARPC4: 9 792 484–9 807 704, otsene ahelARPC4ARPC4-TTLL3: 9 793 082–9 835 401, otsene ahelARPC4-TTLL3TTLL3: 9 808 086–9 856 087, otsene ahelTTLL3RPUSD3: 9 831 633–9 844 602, pöördne ahelRPUSD3CIDEC: 9 864 169–9 891 008, pöördne ahelCIDECJAGN1: 9 890 610–9 894 349, otsene ahelJAGN1IL17RE: 9 902 612–9 916 402, otsene ahelIL17REIL17RC: 9 917 040–9 933 630, otsene ahelIL17RC: 9 917 116–9 945 385, otsene ahelCRELD1: 9 933 791–9 945 413, otsene ahelPRRT3: 9 939 450–9 952 442, pöördne ahelEMC3: 9 957 217–10 011 202, pöördne ahelEMC3FANCD2: 10 026 370–10 101 937, otsene ahelFANCD2FANCD2OS: 10 081 317–10 108 290, pöördne ahelFANCD2OSBRK1: 10 115 590–10 135 082, otsene ahelBRK1VHL: 10 141 764–10 153 676, otsene ahelVHLIRAK2: 10 164 862–10 243 756, otsene ahelIRAK2TATDN2: 10 248 023–10 281 218, otsene ahelTATDN2: 10 249 042–10 249 366, otsene ahel: 10 249 372–10 285 796, otsene ahelGHRL: 10 285 666–10 292 959, pöördne ahelGHRLSEC13: 10 293 131–10 321 207, pöördne ahelSEC13ATP2B2: 10 324 023–10 708 060, pöördne ahelATP2B2JAGN1 skeem: 2 eksonit kromosoomi 3 otsene ahelalEkson 1: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 2: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 1: 9 890 610–9 890 811, 202 alustEkson 2: 9 892 915–9 894 349, 1435 alust125′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,6 kb kogupikkusega 3,7 kb; neist 552 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse JAGN1

8

kohad geenis JAGN1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni JAGN1 3,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,6 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
  • ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). JAGN1 geen: jagunal vesicle mediated transporter 1. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/jagn1

Vancouver

Dante Labs. JAGN1 geen: jagunal vesicle mediated transporter 1 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/jagn1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test