Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

TRIM28

tripartite motif containing 28

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
19q13.43
Koordinaadid
Kromosoom 19: 58 544 064–58 550 715 (GRCh38)
Eksonid
17 eksonit, ulatus 6,7 kb
Valk
835 aminohapet
Tuntud ka kui
TIF1B, KAP1, TF1B, RNF96, PPP1R157, KAP-1, TIF1-beta, TIF1beta
MANE Select transkript
ENST00000253024.10NM_005762.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

  • Neerukasvaja

    • Neeru primaarne või metastaatiline pahaloomuline kasvaja.

      • 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks

  • Kuseteede ja neerude kasvaja

    • Kuseteede süsteemi neoplasm

      Kuseteede süsteemi haarav healoomuline või pahaloomuline, esmane või metastaatiline neoplasm.

      • 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks

Kuidas TRIM28 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Kromosoom 19, millel on sulg kohal, kus asub TRIM28. TRIM28 ja sellele lähedal asuvad 25 geeni kromosoomil 19, vahemikus 58 047 390 kuni 59 047 389.Kromosoom 1919q13.43p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4358,2 Mb58,4 Mb58,6 Mb58,8 Mb59 MbZSCAN1: 58 034 002–58 054 631, otsene ahelZSCAN1ZNF135: 58 059 238–58 086 310, otsene ahelZNF135ZSCAN18: 58 083 318–58 118 427, pöördne ahelZSCAN18ZNF329: 58 126 248–58 155 110, pöördne ahelZNF329ZNF274: 58 183 029–58 215 964, otsene ahelZNF274ZNF544: 58 228 594–58 278 375, otsene ahelZNF544: 58 228 914–58 315 183, otsene ahelZNF8: 58 278 949–58 302 791, otsene ahelZNF8ERVK3-1: 58 305 347–58 316 812, otsene ahelERVK3-1ZSCAN22: 58 326 994–58 342 346, otsene ahelA1BG: 58 345 178–58 353 502, pöördne ahelA1BGZNF497: 58 354 357–58 362 848, pöördne ahelZNF837: 58 367 614–58 381 054, pöördne ahelZNF837RPS5: 58 380 570–58 394 810, otsene ahelRPS5RNF225: 58 395 656–58 397 079, otsene ahelRNF225ZNF584: 58 401 504–58 431 736, otsene ahelZNF584ZNF132: 58 432 814–58 440 172, pöördne ahelZNF324B: 58 450 369–58 459 868, otsene ahelZNF324BZNF324: 58 467 052–58 475 436, otsene ahelZNF324ZNF446: 58 474 017–58 483 992, otsene ahelZNF446SLC27A5: 58 479 512–58 512 413, pöördne ahelSLC27A5ZBTB45: 58 513 530–58 538 911, pöördne ahelTRIM28: 58 544 064–58 550 715, otsene ahelTRIM28CHMP2A: 58 551 452–58 555 129, pöördne ahelCHMP2AUBE2M: 58 555 709–58 558 986, pöördne ahelUBE2MMZF1: 58 561 915–58 573 603, pöördne ahelMZF1TRIM28 skeem: 17 eksonit kromosoomi 19 otsene ahelalEkson 14: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 58 544 064–58 545 097, 1034 alustEkson 2: 58 545 425–58 545 537, 113 alustEkson 3: 58 545 764–58 545 896, 133 alustEkson 4: 58 547 376–58 547 511, 136 alustEkson 5: 58 547 597–58 547 713, 117 alustEkson 6: 58 547 792–58 547 906, 115 alustEkson 7: 58 548 034–58 548 180, 147 alustEkson 8: 58 548 294–58 548 408, 115 alustEkson 9: 58 548 486–58 548 592, 107 alustEkson 10: 58 548 740–58 548 776, 37 alustEkson 11: 58 548 862–58 548 910, 49 alustEkson 12: 58 548 988–58 549 240, 253 alustEkson 13: 58 549 331–58 549 650, 320 alustEkson 14: 58 549 737–58 549 860, 124 alustEkson 15: 58 549 949–58 550 035, 87 alustEkson 16: 58 550 147–58 550 284, 138 alustEkson 17: 58 550 377–58 550 715, 339 alust1246810121416175′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,4 kb kogupikkusega 6,7 kb; neist 2508 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse TRIM28

4

kohad geenis TRIM28, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni TRIM28 6,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,4 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
  • ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). TRIM28 geen: tripartite motif containing 28. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/trim28

Vancouver

Dante Labs. TRIM28 geen: tripartite motif containing 28 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/trim28

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test