Gen
CTNS
cystinosin, lysosomal cystine transporter
- HGNC 2518↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000040531↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 1497↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 17p13.2
- Coordenadas
- Cromosoma 17: 3.636.760–3.663.103 (GRCh38)
- Exones
- 12 exones en 26,3 kb
- Proteína
- 367 aminoácidos
- Herencia
- Autosómica recesiva
- También conocido como
- CTNS-LSB, PQLC4, SLC66A4
- Transcrito MANE Select
- ENST00000046640.9NM_004937.3
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Genoma de referenciaGRCh38hg38
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Cistinosis
- Cistinosis (formas nefropática, juvenil y ocular)Autosómica recesiva
La cistinosis nefropática infantil provoca síndrome de Fanconi renal, retraso del crecimiento e insuficiencia renal progresiva; las formas juveniles comienzan más tarde, y la cistinosis ocular afecta únicamente a la córnea.
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 7 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Qué cambia al conocerlo
El tratamiento con cisteamina de por vida, iniciado de forma temprana, ralentiza el deterioro renal y protege otros órganos, y las gotas oculares de cisteamina disuelven los cristales de la córnea.
Agrupaciones más amplias
Enfermedad de depósito lisosomal
- Enfermedad por depósito lisosomal (otros tipos y tipos no especificados)
Uno de 59 genes relacionados con ello
Abarca las enfermedades por depósito lisosomal sin informe específico, como la enfermedad de Farber y otros trastornos relacionados con ASAH1, las deficiencias de prosaposina (PSAP), la deficiencia múltiple de sulfatasas, las mucopolisacaridosis tipos IX y X, y la enfermedad de Dorfman-Chanarin; la herencia varía según el subtipo, siendo lo más frecuente la autosómica recesiva.
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 7 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Herencia
- Autosómica recesiva
- Se necesita una copia alterada de cada progenitor. Con una sola, es portador y normalmente no presenta la afección; cuando ambos progenitores son portadores, cada hijo tiene una probabilidad de uno entre cuatro de heredar dos.
Estructura de CTNS
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 4,1 kb de los 26,3 kb del gen; 1104 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen CTNS
163
posiciones en CTNS donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
Un genoma completo cubre los 26,3 kb de CTNS, incluidos los intrones, y no solo los 4,1 kb de exones.
Genes vinculados a las mismas afecciones
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseComparte 1 afección
- AGAaspartylglucosaminidaseComparte 1 afección
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Comparte 1 afección
- ARSAarylsulfatase AComparte 1 afección
- ARSBarylsulfatase BComparte 1 afección
- ARSKarylsulfatase family member KComparte 1 afección
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Comparte 1 afección
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Comparte 1 afección
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninComparte 1 afección
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseComparte 1 afección
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinComparte 1 afección
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinComparte 1 afección
Rasgos asociados a CTNS
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que CTNS puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Laboratory abnormality
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Blood in urine
- Dehydration
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- High urine protein levels
- Low blood magnesium levels
- Low blood phosphate level
Mostrar 21 rasgos más
- Low blood potassium levels
- Low blood sodium levels
- Low-molecular-weight proteinuria
- Reduced blood urea nitrogen
- Abnormality of vitamin D metabolism
- Acidosis
- Electrolyte disorders
- Hyperchloremic metabolic acidosis
- Renal Fanconi syndrome
- Diabetes mellitus
- Metabolic acidosis
- Abnormal urine potassium concentration
- Deficient in vitamin D
- Elevated alkaline phosphatase of bone origin
- Elevated creatinine
- Low blood calcium levels
- Low blood uric acid levels
- Renal phosphate wasting
- Small amount of blood in urine
- Episodic metabolic acidosis
- Generalized aminoaciduria
Abnormality of the genitourinary system
- Kidney stone
- Medullary nephrocalcinosis
- Stage 5 chronic kidney disease
- Abnormal function of filtrating structures in kidney
- Abnormal tubulointerstitial morphology
- Increased urine output
- Proximal tubulopathy
- Renal failure
Mostrar 3 rasgos más
Abnormality of the musculoskeletal system
- Weak and soft bones
- Hypophosphatemic rickets
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Muscle tissue disease
- Abnormal shape of long bone
- Delayed bone maturation
- Muscle degeneration
- Oral motor hypotonia
Mostrar 1 rasgo más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen CTNS: cystinosin, lysosomal cystine transporter. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/ctns
Dante Labs. Gen CTNS: cystinosin, lysosomal cystine transporter [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/ctns
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