Gen
CTNS
cystinosin, lysosomal cystine transporter
- HGNC 2518↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000040531↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 1497↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 17p13.2
- Souřadnice
- Chromozom 17: 3 636 760–3 663 103 (GRCh38)
- Exony
- 12 exonů na 26,3 kb
- Protein
- 367 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- CTNS-LSB, PQLC4, SLC66A4
- Transkript MANE Select
- ENST00000046640.9NM_004937.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si CTNS i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Cystinosis
- Cystinosis (nephropathic, juvenile and ocular forms)Autozomálně recesivní
Infantile nephropathic cystinosis causes renal Fanconi syndrome, poor growth and progressive kidney failure; juvenile forms start later, and ocular cystinosis affects only the cornea.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 7 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Lifelong cysteamine treatment, started early, slows kidney decline and protects other organs, and cysteamine eye drops dissolve corneal crystals.
Širší skupiny
Lysosomal Storage Disease
- Lysosomal storage disease (other and unspecified types)
Jeden z 59 genů spojených s touto vazbou
Covers lysosomal storage diseases without a dedicated report, such as Farber disease and other ASAH1-related disorders, prosaposin (PSAP) deficiencies, multiple sulfatase deficiency, mucopolysaccharidosis types IX and X, and Dorfman-Chanarin disease; inheritance varies by subtype, most often autosomal recessive.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 7 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je CTNS uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,1 kb z 26,3 kb genu; 1 104 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte CTNS
163
pozic v genu CTNS, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 26,3 kb genu CTNS, včetně intronů, nikoli jen 4,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- AGAaspartylglucosaminidaseSdílí 1 onemocnění
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Sdílí 1 onemocnění
- ARSAarylsulfatase ASdílí 1 onemocnění
- ARSBarylsulfatase BSdílí 1 onemocnění
- ARSKarylsulfatase family member KSdílí 1 onemocnění
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Sdílí 1 onemocnění
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Sdílí 1 onemocnění
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninSdílí 1 onemocnění
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseSdílí 1 onemocnění
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinSdílí 1 onemocnění
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s CTNS
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CTNS. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Laboratory abnormality
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Blood in urine
- Dehydration
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- High urine protein levels
- Low blood magnesium levels
- Low blood phosphate level
Zobrazit ještě 21 rysů
- Low blood potassium levels
- Low blood sodium levels
- Low-molecular-weight proteinuria
- Reduced blood urea nitrogen
- Abnormality of vitamin D metabolism
- Acidosis
- Electrolyte disorders
- Hyperchloremic metabolic acidosis
- Renal Fanconi syndrome
- Diabetes mellitus
- Metabolic acidosis
- Abnormal urine potassium concentration
- Deficient in vitamin D
- Elevated alkaline phosphatase of bone origin
- Elevated creatinine
- Low blood calcium levels
- Low blood uric acid levels
- Renal phosphate wasting
- Small amount of blood in urine
- Episodic metabolic acidosis
- Generalized aminoaciduria
Abnormality of the genitourinary system
- Kidney stone
- Medullary nephrocalcinosis
- Stage 5 chronic kidney disease
- Abnormal function of filtrating structures in kidney
- Abnormal tubulointerstitial morphology
- Increased urine output
- Proximal tubulopathy
- Renal failure
Zobrazit ještě 3 rysů
Abnormality of the musculoskeletal system
- Weak and soft bones
- Hypophosphatemic rickets
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Muscle tissue disease
- Abnormal shape of long bone
- Delayed bone maturation
- Muscle degeneration
- Oral motor hypotonia
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CTNS: cystinosin, lysosomal cystine transporter. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/ctns
Dante Labs. Gen CTNS: cystinosin, lysosomal cystine transporter [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/ctns
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů