Gen
COL1A2
collagen type I alpha 2 chain
- HGNC 2198↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000164692↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 1278↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 7q21.3
- Souřadnice
- Chromozom 7: 94 394 895–94 431 227 (GRCh38)
- Exony
- 52 exonů na 36,3 kb
- Protein
- 1 366 aminokyselin
- Předchozí symboly
- OI4
- Transkript MANE Select
- ENST00000297268.11NM_000089.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si COL1A2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Ehlers-Danlos Syndrome
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Osteogenesis Imperfecta
A group of inherited connective tissue disorders causing fragile bones that break easily, often with blue sclerae, hearing loss and dental problems.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Cyclic IV bisphosphonates (pamidronate, zoledronate); orthopedic rodding of long bones; physical therapy; denosumab (in clinical use for pediatric OI); romosozumab (in development); hearing monitoring; dental management for dentinogenesis imperfecta
Jak je COL1A2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,1 kb z 36,3 kb genu; 4 101 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte COL1A2
474
pozic v genu COL1A2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 36,3 kb genu COL1A2, včetně intronů, nikoli jen 5,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainSdílí 2 onemocnění
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Sdílí 1 onemocnění
- AEBP1AE binding protein 1Sdílí 1 onemocnění
- ANO5anoctamin 5Sdílí 1 onemocnění
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Sdílí 1 onemocnění
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Sdílí 1 onemocnění
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Sdílí 1 onemocnění
- BMP1bone morphogenetic protein 1Sdílí 1 onemocnění
- C1Rcomplement C1rSdílí 1 onemocnění
- C1Scomplement C1sSdílí 1 onemocnění
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Sdílí 1 onemocnění
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s COL1A2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit COL1A2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Bell-shaped thorax
- Crumpled long bones
- Double-Jointed
- Multiple fractures present at birth
- Multiple rib fractures
- Small chest
- Thin ribs
- Abnormal formation of the hip
Zobrazit ještě 31 rysů
- Hypermobility of all joints
- Multiple joint dislocation
- Recurrent fractures
- Funnel chest
- Generalized decreased muscle tone
- Hernia
- Increased mobility of outermost hinge joint
- Increased susceptibility to fractures
- Joint dislocation
- Low muscle tone
- Popcorn calcification
- Scoliosis
- Kyphoscoliosis
- Multiple shoulder dislocation
- Osteopenia
- Tendon rupture
- Tendon thickening
- Thoracolumbar scoliosis
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Biconcave flattened vertebrae
- Biconcave vertebral bodies
- Bowing of limbs due to multiple fractures
- Broad long bones
- Flattened vertebrae
- Hunched back
- Joint subluxation
- Low solidness and mass of the bones
- Osteoporosis
- Prominent swayback
- Severe generalized osteoporosis
- Slender long bone
Abnormality of limbs
- Hip dislocation
- Limb undergrowth
- Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
- Congenital bilateral hip dislocation
- Abnormal feet structure
- Absent phalangeal crease
- Back knee
- Bunion
Zobrazit ještě 12 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen COL1A2: collagen type I alpha 2 chain. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/col1a2
Dante Labs. Gen COL1A2: collagen type I alpha 2 chain [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/col1a2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů