Gen
COL1A2
collagen type I alpha 2 chain
- HGNC 2198↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000164692↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 1278↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 7q21.3
- Koordinater
- Kromosom 7: 94 394 895–94 431 227 (GRCh38)
- Eksoner
- 52 eksoner over 36,3 kb
- Protein
- 1 366 aminosyrer
- Tidligere symboler
- OI4
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000297268.11NM_000089.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/col1a2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes COL1A2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ehlers-Danlos syndrom
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Osteogenesis imperfecta
En gruppe arvelige bindevevssykdommer som gir skjøre bein som brekker lett, ofte med blå skleraer, hørselstap og tannproblemer.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Syklisk intravenøs behandling med bisfosfonater (pamidronat, zoledronat); ortopedisk marknagling av lange knokler; fysioterapi; denosumab (i klinisk bruk ved OI hos barn); romosozumab (under utvikling); hørselskontroll; tannbehandling ved dentinogenesis imperfecta
Slik er COL1A2 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 5,1 kb av genets 36,3 kb, og 4 101 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av COL1A2
474
posisjoner i COL1A2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 36,3 kb av COL1A2, inkludert introner, ikke bare de 5,1 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainDeler 2 tilstander
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Deler 1 tilstand
- AEBP1AE binding protein 1Deler 1 tilstand
- ANO5anoctamin 5Deler 1 tilstand
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Deler 1 tilstand
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Deler 1 tilstand
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Deler 1 tilstand
- BMP1bone morphogenetic protein 1Deler 1 tilstand
- C1Rcomplement C1rDeler 1 tilstand
- C1Scomplement C1sDeler 1 tilstand
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Deler 1 tilstand
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til COL1A2
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene COL1A2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Bell-shaped thorax
- Crumpled long bones
- Double-Jointed
- Multiple fractures present at birth
- Multiple rib fractures
- Small chest
- Thin ribs
- Abnormal formation of the hip
Vis 31 egenskaper til
- Hypermobility of all joints
- Multiple joint dislocation
- Recurrent fractures
- Funnel chest
- Generalized decreased muscle tone
- Hernia
- Increased mobility of outermost hinge joint
- Increased susceptibility to fractures
- Joint dislocation
- Low muscle tone
- Popcorn calcification
- Scoliosis
- Kyphoscoliosis
- Multiple shoulder dislocation
- Osteopenia
- Tendon rupture
- Tendon thickening
- Thoracolumbar scoliosis
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Biconcave flattened vertebrae
- Biconcave vertebral bodies
- Bowing of limbs due to multiple fractures
- Broad long bones
- Flattened vertebrae
- Hunched back
- Joint subluxation
- Low solidness and mass of the bones
- Osteoporosis
- Prominent swayback
- Severe generalized osteoporosis
- Slender long bone
Abnormality of limbs
- Hip dislocation
- Limb undergrowth
- Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
- Congenital bilateral hip dislocation
- Abnormal feet structure
- Absent phalangeal crease
- Back knee
- Bunion
Vis 12 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). COL1A2-genet: collagen type I alpha 2 chain. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/col1a2
Dante Labs. COL1A2-genet: collagen type I alpha 2 chain [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/col1a2
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker