Gen
COL1A2
collagen type I alpha 2 chain
- HGNC 2198↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000164692↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 1278↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 7q21.3
- Koordinater
- Kromosom 7: 94 394 895–94 431 227 (GRCh38)
- Exoner
- 52 exoner på 36,3 kb
- Protein
- 1 366 aminosyror
- Tidigare symboler
- OI4
- MANE Select-transkript
- ENST00000297268.11NM_000089.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs COL1A2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ehlers-Danlos syndrom
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Osteogenesis imperfecta
En grupp ärftliga bindvävssjukdomar som orsakar sköra ben som lätt bryts, ofta med blå sklera, hörselnedsättning och tandproblem.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Cykliska intravenösa bisfosfonater (pamidronat, zoledronat); ortopedisk märgspikning av långa ben; fysioterapi; denosumab (används kliniskt vid OI hos barn); romosozumab (under utveckling); hörselkontroller; tandvård vid dentinogenesis imperfecta
Så är COL1A2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 5,1 kb av genens 36,3 kb, och 4 101 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest COL1A2
474
positioner i COL1A2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 36,3 kb av COL1A2, med introner inräknade, inte bara de 5,1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainDelar 2 tillstånd
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Delar 1 tillstånd
- AEBP1AE binding protein 1Delar 1 tillstånd
- ANO5anoctamin 5Delar 1 tillstånd
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Delar 1 tillstånd
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Delar 1 tillstånd
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Delar 1 tillstånd
- BMP1bone morphogenetic protein 1Delar 1 tillstånd
- C1Rcomplement C1rDelar 1 tillstånd
- C1Scomplement C1sDelar 1 tillstånd
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Delar 1 tillstånd
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till COL1A2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som COL1A2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Bell-shaped thorax
- Crumpled long bones
- Double-Jointed
- Multiple fractures present at birth
- Multiple rib fractures
- Small chest
- Thin ribs
- Abnormal formation of the hip
Visa ytterligare 31 egenskaper
- Hypermobility of all joints
- Multiple joint dislocation
- Recurrent fractures
- Funnel chest
- Generalized decreased muscle tone
- Hernia
- Increased mobility of outermost hinge joint
- Increased susceptibility to fractures
- Joint dislocation
- Low muscle tone
- Popcorn calcification
- Scoliosis
- Kyphoscoliosis
- Multiple shoulder dislocation
- Osteopenia
- Tendon rupture
- Tendon thickening
- Thoracolumbar scoliosis
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Biconcave flattened vertebrae
- Biconcave vertebral bodies
- Bowing of limbs due to multiple fractures
- Broad long bones
- Flattened vertebrae
- Hunched back
- Joint subluxation
- Low solidness and mass of the bones
- Osteoporosis
- Prominent swayback
- Severe generalized osteoporosis
- Slender long bone
Abnormality of limbs
- Hip dislocation
- Limb undergrowth
- Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
- Congenital bilateral hip dislocation
- Abnormal feet structure
- Absent phalangeal crease
- Back knee
- Bunion
Visa ytterligare 12 egenskaper
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal heart valve morphology
- Mitral regurgitation
- Aortic regurgitation
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Tricuspid regurgitation
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arterial rupture
- Left ventricular hypertrophy
Visa ytterligare 4 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). COL1A2-genen: collagen type I alpha 2 chain. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/col1a2
Dante Labs. COL1A2-genen: collagen type I alpha 2 chain [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/col1a2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor