Gen
OFD1
OFD1 centriole and centriolar satellite protein
- HGNC 2567↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000046651↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 8481↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- Xp22.2
- Koordinater
- Kromosom X: 13 734 748–13 769 357 (GRCh38)
- Exoner
- 23 exoner på 34,6 kb
- Protein
- 1 012 aminosyror
- Även känd som
- 71-7A, JBTS10
- Tidigare symboler
- CXorf5, RP23
- MANE Select-transkript
- ENST00000340096.11NM_003611.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs OFD1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Joubert-syndrom och relaterade sjukdomar
- Joubertsyndrom
En ciliopati som kännetecknas av en missbildning i lillhjärnan och hjärnstammen (tecknet "molar tooth"), med nedsatt muskelspänning, försenad utveckling och onormala ögonrörelser, ibland med påverkan på njurar, lever eller ögon.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Bredare grupperingar
Retinitis pigmentosa
En av 77 gener kopplade till den
En grupp ärftliga retinala dystrofier med progressiv förlust av först stavar och sedan tappar (fotoreceptorer), vilket orsakar nattblindhet och gradvis förlust av perifer syn.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Så är OFD1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,6 kb av genens 34,6 kb, och 3 039 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest OFD1
108
positioner i OFD1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
5 av dem (4,6 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (5 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalys täcker alla 34,6 kb av OFD1, med introner inräknade, inte bara de 3,6 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ARL3ARF like GTPase 3Delar 2 tillstånd
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ADelar 2 tillstånd
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Delar 1 tillstånd
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Delar 1 tillstånd
- AHI1Abelson helper integration site 1Delar 1 tillstånd
- AHRaryl hydrocarbon receptorDelar 1 tillstånd
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Delar 1 tillstånd
- ARL13BARF like GTPase 13BDelar 1 tillstånd
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDelar 1 tillstånd
- ARL6ARF like GTPase 6Delar 1 tillstånd
- ARMC9armadillo repeat containing 9Delar 1 tillstånd
- B9D1B9 domain containing 1Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till OFD1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som OFD1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Full lips
- Wide nasal bridge
- Abnormality of the face
- Accessory oral frenulum
- Bumpy tongue
- Central cleft upper lip
- Frontal bossing
- High palate
Visa ytterligare 49 egenskaper
- Wide gum ridges
- Abnormal dentition
- Abnormal oral frenulum morphology
- Abnormality of the skull
- Big calvaria
- Blockage of nose
- Broad nasal tip
- Chronic rhinitis
- Chronic sinus disease
- Cleft palate
- Cleft upper lip
- Decreased width of the skull
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Eye folds
- Facial asymmetry
- Failure of development of between one and six teeth
- Hamartoma of tongue
- Little lower jaw
- Long face
- Nasal polyposis
- Recurrent colds
- Tongue nodules
- Underdeveloped tissue around nostril
- Abnormal tooth enamel
- Abnormally small head
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Cheekbone underdevelopment
- Cleft of the mouth
- Cleft tongue
- Corners of eye widely separated
- Dandy-Walker malformation
- Encephalocele
- Highly arched eyebrow
- Lip pit
- Long, narrow head
- Midline notch of upper alveolar ridge
- Nasal tip, upturned
- Odontogenic neoplasm
- Open bite
- Prominent nasal bridge
- Tongue tied
- Absence of adult teeth
- Deep philtrum
- Dental cavities
- Enlarged cisterna magna
- Extra teeth
- Increased size of gum ridge
- Small retruded chin
- Thin dental enamel
Abnormality of the eye
- Absent foveal reflex
- Limited peripheral vision
- Marked vision impairment
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rod-cone dystrophy
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
Visa ytterligare 31 egenskaper
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Oculomotor apraxia
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Wide-set eyes
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Difficulties with night vision
- Eccentric visual fixation
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Inward turning cross eyed
- Loss of peripheral vision
- Mild myopia
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Cat eye
- Cross-eyed
- Decreased clarity of vision
- Drooping upper eyelid
- Photopsia
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Frequent temper tantrums
- Increased appetite
- Intellectual disability, severe
- Lack of coordination of movement
- Molar tooth sign on MRI
- Motor delay
Visa ytterligare 25 egenskaper
- Ataxia
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal gait
- Epilepsy
- Hypoplasia of olfactory tract
- Ventriculomegaly
- Abnormality of neuronal migration
- Agenesis of corpus callosum
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Cerebellar cyst
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Dystonia
- Hypothalamic hamartoma
- More grooves in brain
- Morphological central nervous system abnormality
- Myelomeningocele
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
- Abnormal cortical gyration
- Cavity within brain
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Gray matter heterotopia
- IQ less than 20
Abnormality of limbs
- Short fingers or toes
- Atypical position of finger
- Broad thumb
- Curvature of finger
- Curvature of little finger
- Duplication of bones of the toes
- Extra finger
- Extra little finger
Visa ytterligare 15 egenskaper
- Extra toe attached near the little toe
- Finger syndactyly
- Preaxial polydactyly
- Short finger
- Short toe
- Webbed fingers or toes
- Clubbing of fingers and toes
- Curvature of digit
- Extra thumb
- Fused ankle bones
- Mesoaxial polydactyly
- More than five fingers or toes on hands or feet
- Short second toe
- Y-shaped central long bones of hand
- Radial deviation of finger
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal sperm motility
- Bilateral cryptorchidism
- Male infertility
- Polycystic kidney dysplasia
- Abnormality of the genitourinary system
- Absent kidney
- Absent/small kidney
- Female infertility
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of the digestive system
- Tube feeding
- Feeding difficulties in infancy
- Inguinal hernia
- Abnormality of the pancreas
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Liver cysts
- Pancreatic cysts
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). OFD1-genen: OFD1 centriole and centriolar satellite protein. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ofd1
Dante Labs. OFD1-genen: OFD1 centriole and centriolar satellite protein [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ofd1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor