Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

TRAPPC2

trafficking protein particle complex subunit 2

Sammanfattning

Cytogenetisk position
Xp22.2
Koordinater
Kromosom X: 13 712 245–13 734 620 (GRCh38)
Exoner
6 exoner på 22,4 kb
Protein
140 aminosyror
Även känd som
TRS20, SEDT, MIP-2A, ZNF547L, hYP38334
Tidigare symboler
SEDL
MANE Select-transkript
ENST00000380579.6NM_001011658.4
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser TRAPPC2 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är TRAPPC2 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom X, med en parentes där TRAPPC2 finns. TRAPPC2 och 7 gener i närheten på kromosom X, från 13 223 433 till 14 223 432.Kromosom XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2813,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbATXN3L: 13 318 647–13 320 053, bakåt-strängATXN3LEGFL6: 13 569 575–13 633 575, framåt-strängEGFL6TCEANC: 13 653 078–13 681 964, framåt-strängTCEANCRAB9A: 13 689 117–13 712 064, framåt-strängRAB9ATRAPPC2: 13 712 245–13 734 620, bakåt-strängTRAPPC2OFD1: 13 734 667–13 777 955, framåt-strängOFD1GPM6B: 13 770 691–13 938 838, bakåt-strängGPM6BGEMIN8: 13 998 099–14 029 928, bakåt-strängGEMIN8Diagram över TRAPPC2: 6 exoner på bakåt-strängen av kromosom XExon 6: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 5: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 4: 4 kända sjukdomsorsakande ställenExon 3: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 6: 13 712 245–13 714 505, 2 261 baserExon 5: 13 716 004–13 716 089, 86 baserExon 4: 13 716 534–13 716 678, 145 baserExon 3: 13 719 871–13 719 982, 112 baserExon 2: 13 734 044–13 734 185, 142 baserExon 1: 13 734 525–13 734 620, 96 baser6543215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 2,8 kb av genens 22,4 kb, och 423 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest TRAPPC2

10

positioner i TRAPPC2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

2 av dem (20 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.

  • Low mappability (1 ställe)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 ställe)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

En helgenomsanalys täcker alla 22,4 kb av TRAPPC2, med introner inräknade, inte bara de 2,8 kb exoner.

Egenskaper kopplade till TRAPPC2

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som TRAPPC2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Abnormality of the musculoskeletal system

Visa ytterligare 28 egenskaper

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). TRAPPC2-genen: trafficking protein particle complex subunit 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/trappc2

Vancouver

Dante Labs. TRAPPC2-genen: trafficking protein particle complex subunit 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/trappc2

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test