Gen
PUF60
poly(U) binding splicing factor 60
- HGNC 17042↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000179950↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 22827↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 8q24.3
- Coördinaten
- Chromosoom 8: 143.816.344–143.829.315 (GRCh38)
- Exons
- 12 exons over 13 kb
- Eiwit
- 559 aminozuren
- Ook bekend als
- FIR, SIAHBP1, RoBPI
- MANE Select-transcript
- ENST00000526683.6NM_078480.3
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/puf60.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees PUF60 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Intellectuele beperking
Een van 233 genen die hiermee verband houden
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Opbouw van PUF60
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,9 kb van de 13 kb van het gen; 1.680 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van PUF60
62
posities in PUF60 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 13 kb van PUF60, inclusief intronen, en niet alleen de 1,9 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deelt 1 aandoening
- ADKadenosine kinaseDeelt 1 aandoening
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeelt 1 aandoening
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deelt 1 aandoening
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deelt 1 aandoening
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ANK3ankyrin 3Deelt 1 aandoening
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deelt 1 aandoening
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deelt 1 aandoening
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deelt 1 aandoening
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deelt 1 aandoening
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan PUF60
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die PUF60 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Broad nasal tip
- Cleft palate
- Long philtrum
- Prominent forehead
- Receding chin
- Nasal tip, upturned
- Square face
Toon 25 kenmerken meer
- Thin red part of the upper lip
- Branchial cyst
- Eye folds
- Full cheeks
- Narrow forehead
- Short neck
- Small retruded chin
- Smooth philtrum
- Wide nasal bridge
- Almond shaped eyes
- Bell's palsy
- Big lower jaw
- Cerebellopontine angle arachnoid cyst
- Cleft of gum ridge
- Decreased size of half of the face
- Development of small head that was not present at birth
- Extra tooth
- Highly arched eyebrow
- Little lower jaw
- Long eyelashes
- Oval face
- Short opening between the eyelids
- Thick eyebrow
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Short nose
Abnormality of limbs
- Abnormality of the hand
- Curvature of finger
- Curvature of little finger
- Pes valgus
- Short middle bone of the little finger
- Broad big toe
- Broad thumb
- Dislocated hip since birth
Toon 18 kenmerken meer
- Dropped arches
- Duplication of finger bones
- Extra thumb
- Hip dislocation
- Long fingers
- Long toe
- Overlapping toe
- Rocker bottom foot
- Short 5th finger
- Short big toe
- Short palm
- Short thighbone
- Single transverse palmar crease
- Smaller or shorter than typical limbs
- Talipes
- Webbed 2nd and 3rd toes
- Wide digital bones
- Curvature of digit
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- IQ between 34 and 49
- Autism spectrum disorder
- Communication delay
- Agenesis of corpus callosum
- Difficulty sleeping
Toon 13 kenmerken meer
- Echoing another person's speech
- Generalized brain degeneration
- Low frustration tolerance
- More active than typical
- Periventricular leukomalacia
- Poor eye contact
- Repetitive movements
- Spina bifida occulta
- Split spine
- Tic disorder
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Degeneration of cerebrum
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the kidney
- Absent kidney
- Absent kidney on one side
- Bilateral renal hypoplasia
- Horseshoe kidney
- Hypospadias
- Pelvic kidney
- Small kidneys
Toon 2 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). PUF60-gen: poly(U) binding splicing factor 60. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/puf60
Dante Labs. PUF60-gen: poly(U) binding splicing factor 60 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/puf60
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken