Gène
HADHA
hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha
- HGNC 4801↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000084754↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 3030↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 2p23.3
- Coordonnées
- Chromosome 2 : 26 190 635–26 244 632 (GRCh38)
- Exons
- 20 exons sur 54 kb
- Protéine
- 763 acides aminés
- Aussi appelé
- GBP, LCEH, LCHAD, MTPA
- Transcrit MANE Select
- ENST00000380649.8NM_000182.5
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Troubles de l'oxydation des acides gras et du cycle de la carnitine
- Déficit en protéine trifonctionnelle mitochondrialeAutosomique récessif
Causé par des variants des gènes HADHA ou HADHB, pouvant provoquer une hypoglycémie, des atteintes cardiaques et hépatiques, une destruction musculaire et, plus tard, des lésions nerveuses.
- 2 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La connaissance de cette maladie permet de suivre un régime pauvre en graisses à longue chaîne, complété par des suppléments en graisses à chaîne moyenne, ainsi que de disposer d'un plan d'urgence en cas de maladie.
- Troubles de l'oxydation des acides gras et de la cétogenèseAutosomique récessif
Groupe de défauts d'enzymes et de transporteurs, notamment les déficits en MCAD, VLCAD, LCHAD, SCAD et HADH, le déficit primaire en carnitine et le déficit en translocase carnitine-acylcarnitine, pouvant provoquer une hypoglycémie, une destruction musculaire ainsi que des atteintes cardiaques et hépatiques pendant les périodes de jeûne ou de maladie.
- ClinGen juge le lien définitif
- 5 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La connaissance de cette maladie permet d'éviter les jeûnes prolongés, de disposer d'un plan d'urgence en cas de maladie et, le cas échéant, d'ajuster l'apport en carnitine ou en graisses alimentaires, ce qui peut prévenir des épisodes mettant la vie en danger.
Regroupements plus larges
Cardiomyopathie hypertrophique
- Autosomique dominant
L'un des 62 gènes qui lui sont liés
Une affection dans laquelle le myocarde est hypertrophié sans cause évidente. L'hypertrophie est généralement asymétrique et peut être associée à une obstruction de la chambre de chasse ventriculaire.
- ClinGen juge le lien définitif
- 5 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Bêtabloquants, inhibiteurs calciques non-dihydropyridiniques, restriction d'activité physique, conseil génétique
Neuropathies périphériques héréditaires rares
- Neuropathie périphérique héréditaire
L'un des 233 gènes qui lui sont liés
Causée par des modifications dans l'un des nombreux gènes nécessaires au maintien en bon état des longues fibres nerveuses. Dans ce rapport, ces gènes comprennent IGHMBP2 et PLEKHG5, dont la transmission est récessive.
- ClinGen juge le lien définitif
- 5 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La kinésithérapie, les orthèses et l'ergothérapie aident à préserver la mobilité, avec une chirurgie des déformations du pied si nécessaire. Certaines formes nécessitent une surveillance respiratoire. Le conseil génétique oriente le dépistage familial selon le mode de transmission du gène concerné.
Structure de HADHA
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 2,9 kb sur les 54 kb du gène ; 2 292 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de HADHA
1Facile
Difficulté de séquençage de HADHA avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de HADHA se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.
Facteur aggravant : la part des exons de HADHA située dans chaque type de région difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel dans ces zones peut être manquant ou erroné. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 100.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Partagé avec le chrYLes régions pseudoautosomales et la région transposée du X, où les chrX et chrY portent la même séquence ou une séquence presque identique, si bien qu'une lecture issue de l'un peut être placée sur l'autre. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 60.0 %
- Couverture de la référenceLacunes dans l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 50.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et suites d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir en entier. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 30.0 %
- Teneur en GCFenêtres comportant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. À lui seul, un gène entièrement situé dans ce type de région obtiendrait un score de 20.3,5 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de HADHA située dans ce type de région difficile. Chaque type peut à lui seul rendre un gène difficile, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans l'un d'eux, 100 lorsque toutes les bases se trouvent dans des zones où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
222
positions dans HADHA où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se trouve dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 54 kb de HADHA dans leur totalité, introns compris, et pas seulement les 2,9 kb d'exons.
ClinVar pathogenic variants (242)
The HADHA variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogène 106
- Pathogène/probablement pathogène 41
- Probablement pathogène 95
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NM_000182.5(HADHA):c.2225_2228dup (p.Phe744fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.2146+1G>A (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.2132dup (p.Pro712fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1981_1999del (p.Leu661fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1967del (p.Ile655_Leu656insTer) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1921del (p.Glu641fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1811del (p.Gly604fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1793_1794del (p.His598fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1689+2T>G (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1678C>T (p.Arg560Ter) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1528G>C (p.Glu510Gln) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 3 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1336G>T (p.Glu446Ter) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1319dup (p.Ala441fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1195C>T (p.Arg399Ter) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.1152del (p.Gly384_Leu385insTer) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.944_956del (p.Gly315fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.871C>T (p.Arg291Ter) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.469C>T (p.Gln157Ter) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.315-1G>A (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.315-2A>T (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.274_278del (p.Ser92fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.180+3A>G (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.180+1G>A (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.157C>T (p.Arg53Ter) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_000182.5(HADHA):c.6_24dup (p.Ile9fs) (opens in a new tab) | long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
See all 242 with every other HADHA variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gènes liés aux mêmes affections
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- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Partage 1 affection
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Partage 1 affection
- ALPK3alpha kinase 3Partage 1 affection
Traits associés à HADHA
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que HADHA peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Laboratory abnormality
- Diminished acetyl-CoA C-acyltransferase activity in cultured fibroblasts
- Diminished long-chain-enoyl-CoA hydratase activity in cultured fibroblasts
- Elevated circulating fatty acylcarnitine concentration
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Hypoketotic hypoglycemia
- Low blood sugar
- Diffuse hepatic steatosis
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
Abnormality of the nervous system
- Absent reflexes
- Global developmental delay
- Lethargy
- Peripheral neuropathy
- Babinski sign
- Coma
- Epilepsy
- Intellectual disability
Afficher 5 traits supplémentaires
Abnormality of the eye
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Abnormal electroretinogram
- Outward facing eye ball
- Visual loss
- Abnormal chorioretinal morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
Afficher 4 traits supplémentaires
Abnormality of the musculoskeletal system
- Breakdown of skeletal muscle
- Low muscle tone
- Difficulty walking up stairs
- Muscle spasm
- Muscle weakness
- Progressive distal muscle weakness
- Skeletal myopathy
- Frequent falls
Afficher 3 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-19 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.19-9814e911.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène HADHA : hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hadha
Dante Labs. Gène HADHA : hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hadha
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