Geeni
EFEMP1
EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1
- HGNC 3218↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000115380↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 2202↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2p16.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 55 865 967–55 923 782 (GRCh38)
- Eksonit
- 12 eksonia 57,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 493 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- S1-5, FBLN3, MTLV
- Aiemmat symbolit
- DHRD, FBNL
- MANE Select -transkripti
- ENST00000355426.8NM_001039348.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue EFEMP1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Cutis laxa
Cutis laxa (CL) on perinnöllinen tai hankinnainen sidekudossairaus, jolle on tyypillistä ryppyinen, ylimääräinen ja roikkuva joustamaton iho. Siihen liittyy luuston ja kehityksen poikkeavuuksia sekä joissakin tapauksissa vakavaa elimistön laajuista oireilua. Perinnöllisestä CL:stä on kuvattu useita eri muotoja. Ne erotetaan periytymistavan sekä sisäelinten osallisuuden laajuuden, liitännäisten poikkeavuuksien ja taudin vakavuuden perusteella.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Glaukooma
Silmänsisäisen paineen nousu, joka johtuu kammanesteen ulosvirtauksen estymisestä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: kohtalainen
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Silmänpainetta alentavat tipat (prostaglandiinianalogit, beetasalpaajat); selektiivinen lasertrabekuloplastia; MIGS-leikkaus; trabekulotomia tai goniotomia synnynnäisessä glaukoomassa; sukulaisten geenitestaus kaskadimenetelmällä; silmänpaineen vuosittainen seuranta kantajille
Perinnölliset makuladystrofiat
- Doynen hunajakennoverkkokalvon dystrofiaAutosomaalinen dominantti
Dominoivasti periytyvä sairaus, jonka aiheuttavat muutokset EFEMP1-geenissä. Siinä esiintyy druseneita muistuttavia kertymiä, jotka voivat muistuttaa varhaisvaiheen ikäsidonnaista makulan rappeumaa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Säännölliset silmätarkastukset mahdollistavat komplikaatioiden varhaisen hoidon.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
EFEMP1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,7 kb geenin 57,8 kb:stä; 1 482 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä EFEMP1
6
EFEMP1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 57,8 kb geenistä EFEMP1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,7 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Yhteinen sairaus: 1
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Yhteinen sairaus: 1
- ATP6V1AATPase H+ transporting V1 subunit AYhteinen sairaus: 1
- ATP6V1E1ATPase H+ transporting V1 subunit E1Yhteinen sairaus: 1
- ATP7AATPase copper transporting alphaYhteinen sairaus: 1
- CYP1B1cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1Yhteinen sairaus: 1
- EFEMP2EGF-like fibulin extracellular matrix protein 2Yhteinen sairaus: 1
- ELNelastinYhteinen sairaus: 1
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Yhteinen sairaus: 1
- FBLN5fibulin 5Yhteinen sairaus: 1
- FOXC1forkhead box C1Yhteinen sairaus: 1
- GORABgolgin, RAB6 interactingYhteinen sairaus: 1
Geeniin EFEMP1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita EFEMP1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Astigmatism
- High eye pressure
- Macular drusen
- Open angle glaucoma
- Partial loss of field of vision
- Yellow/white macular lesion
- Macular dystrophy
- Reticular pigmentary degeneration
Näytä 30 piirrettä lisää
- Visual loss
- Abnormal anterior chamber morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Abnormality of the iris
- Damaged optic nerve
- Drooping upper eyelid
- Glaucomatous visual field defect
- Hyperautofluorescent macular lesion
- Hypoautofluorescent macular lesion
- Loss of peripheral vision
- Macular hyperpigmentation
- Metamorphopsia
- Optic nerve issue
- Perifoveal ring of hyperautofluorescence
- Severe near sightedness
- Visual impairment
- Yellowish cloudy center of lens
- Choroidal neovascularization
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Granular macular appearance
- Increased cup-to-disc ratio
- Macular atrophy
- Paracentral scotoma
- Peripapillary chorioretinal atrophy
- Serous retinal detachment
- Subretinal fluid
- Temporal optic disc pallor
- Blind spot located at fixation point
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Decreased clarity of vision
Abnormality of the digestive system
- Colonic diverticula
- Femoral hernia
- Gastric diverticulum
- Inguinal hernia
- Rectocele
- Rectum protrudes through anus
- Intestinal obstruction
- Ventral hernia
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). EFEMP1-geeni: EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/efemp1
Dante Labs. EFEMP1-geeni: EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/efemp1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa