Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

CCDC88A

coiled-coil and HOOK domain protein 88A

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
2p16.1
Koordinaatit
Kromosomi 2: 55 287 842–55 419 856 (GRCh38)
Eksonit
33 eksonia 132 kb:n alueella
Proteiini
1 871 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FLJ10392, APE, GIV, HkRP1, GRDN
Aiemmat symbolit
KIAA1212
MANE Select -transkripti
ENST00000436346.7NM_001365480.1
Lokustyyppi
Protein-coding
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä CCDC88A. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

CCDC88A-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 2, jossa hakasulke osoittaa CCDC88A-geenin sijainnin. CCDC88A ja 9 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 2, välillä 54 853 849–55 853 848.Kromosomi 22p16.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.355 Mb55,2 Mb55,4 Mb55,6 Mb55,8 MbEML6: 54 723 499–54 972 025, juoste eteenpäinEML6RTN4: 54 971 931–55 112 621, juoste taaksepäinRTN4CLHC1: 55 172 547–55 232 563, juoste taaksepäinCLHC1RPS27A: 55 229 447–55 236 649, juoste eteenpäinRPS27AMTIF2: 55 236 218–55 270 263, juoste taaksepäinMTIF2CCDC88A: 55 287 842–55 419 856, juoste taaksepäinCCDC88ACFAP36: 55 519 559–55 545 501, juoste eteenpäinCFAP36PPP4R3B: 55 547 292–55 618 880, juoste taaksepäinPPP4R3BPNPT1: 55 634 061–55 693 863, juoste taaksepäinPNPT1EFEMP1: 55 810 992–55 924 271, juoste taaksepäinEFEMP1CCDC88A-kaavio: 33 eksonia kromosomin 2 juosteella, taaksepäinEkson 33: 55 287 842–55 291 164, 3 323 emästäEkson 32: 55 291 676–55 291 775, 100 emästäEkson 31: 55 295 597–55 296 056, 460 emästäEkson 30: 55 296 258–55 296 523, 266 emästäEkson 29: 55 299 839–55 299 919, 81 emästäEkson 28: 55 301 206–55 301 277, 72 emästäEkson 27: 55 301 872–55 302 072, 201 emästäEkson 26: 55 303 069–55 303 152, 84 emästäEkson 25: 55 308 809–55 309 023, 215 emästäEkson 24: 55 309 162–55 309 254, 93 emästäEkson 23: 55 312 434–55 312 579, 146 emästäEkson 22: 55 315 928–55 316 114, 187 emästäEkson 21: 55 317 206–55 317 349, 144 emästäEkson 20: 55 317 564–55 317 841, 278 emästäEkson 19: 55 318 843–55 319 004, 162 emästäEkson 18: 55 322 528–55 322 692, 165 emästäEkson 17: 55 328 294–55 328 435, 142 emästäEkson 16: 55 332 566–55 332 693, 128 emästäEkson 15: 55 334 094–55 335 164, 1 071 emästäEkson 14: 55 336 681–55 336 818, 138 emästäEkson 13: 55 339 464–55 339 648, 185 emästäEkson 12: 55 343 648–55 343 792, 145 emästäEkson 11: 55 344 368–55 344 514, 147 emästäEkson 10: 55 346 175–55 346 333, 159 emästäEkson 9: 55 349 518–55 349 599, 82 emästäEkson 8: 55 355 579–55 355 751, 173 emästäEkson 7: 55 362 308–55 362 448, 141 emästäEkson 6: 55 363 950–55 364 033, 84 emästäEkson 5: 55 372 452–55 372 510, 59 emästäEkson 4: 55 374 814–55 374 883, 70 emästäEkson 3: 55 388 778–55 388 886, 109 emästäEkson 2: 55 418 816–55 418 916, 101 emästäEkson 1: 55 419 017–55 419 856, 840 emästä333025201510515′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 9,8 kb geenin 132 kb:stä; 5 616 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Geeniin CCDC88A liittyvät piirteet

Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CCDC88A voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.

Ulkoiset linkit

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). CCDC88A-geeni: coiled-coil and HOOK domain protein 88A. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ccdc88a

Vancouver

Dante Labs. CCDC88A-geeni: coiled-coil and HOOK domain protein 88A [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ccdc88a

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test