Geeni
PNPT1
polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1
- HGNC 23166↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000138035↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 87178↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2p16.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 55 634 061–55 693 844 (GRCh38)
- Eksonit
- 28 eksonia 59,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 783 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- PNPase, OLD35, old-35
- Aiemmat symbolit
- DFNB70
- MANE Select -transkripti
- ENST00000447944.7NM_033109.5
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pnpt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue PNPT1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Primaarinen mitokondriosairaus
- Yhdistetty oksidatiivisen fosforylaation puutos
Sairauksia, joita yleensä aiheuttavat mitokondrioiden proteiinituotantoon osallistuvat tumagenomin geenit. Ne vähentävät useiden hengitysketjun kompleksien toimintaa samanaikaisesti ja aiheuttavat usein vakavan monielinsairauden lapsuudessa.
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tieto voi lopettaa diagnoosin etsimisen ja ohjata seurantaa ja tukihoitoa.
Laajemmat ryhmät
Kuulonalenema ja kuurous
- Oireeton geneettinen kuulonalenema
Yksi 97 siihen liittyvästä geenistä
Perinnöllinen kuulonalenema ilman muita lääketieteellisiä oireita. Siihen kuuluvat yleiset resessiiviset muodot, joita aiheuttavat GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ja monet muut geenit, sekä dominantit, X-kromosomiin liittyvät ja mitokondriaaliset muodot.
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Geneettisen syyn tunteminen voi ohjata kuulotukea ja sisäkorvaistutteen valintaa, auttaa arvioimaan osallistumismahdollisuutta geenihoitokokeisiin (esimerkiksi OTOF) ja tukea perheneuvontaa.
Leighin oireyhtymä
Yksi 69 siihen liittyvästä geenistä
Etenevä neurologinen sairaus, jolle ovat tunnusomaisia tietyt neuropatologiset piirteet, joissa aivorungon ja tyvitumakkeiden vauriot esiintyvät yhdessä.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: kohtalainen
PNPT1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,5 kb geenin 59,8 kb:stä; 2 352 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: PNPT1
29
PNPT1-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 59,8 kb geenistä PNPT1, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 4,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Yhteisiä sairauksia: 3
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteisiä sairauksia: 2
- FARS2phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteisiä sairauksia: 2
- GFM1G elongation factor mitochondrial 1Yhteisiä sairauksia: 2
- GFM2GTP dependent ribosome recycling factor mitochondrial 2Yhteisiä sairauksia: 2
- GTPBP3GTP binding protein 3, mitochondrialYhteisiä sairauksia: 2
- MRPS34mitochondrial ribosomal protein S34Yhteisiä sairauksia: 2
- MTFMTmitochondrial methionyl-tRNA formyltransferaseYhteisiä sairauksia: 2
- MTRFRmitochondrial translation release factor in rescueYhteisiä sairauksia: 2
- TSFMTs translation elongation factor, mitochondrialYhteisiä sairauksia: 2
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialYhteinen sairaus: 1
- ACTG1actin gamma 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin PNPT1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PNPT1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Choreoathetosis
- Decreased nerve conduction velocity
- Decreased number of peripheral myelinated nerve fibers
- Decreased reflex response
- Dystonia
- Encephalopathy
- Abolished vibration sense
Näytä 23 piirrettä lisää
- Degeneration of cerebellum
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal cerebellar cortex morphology
- Abnormal corpus striatum morphology
- Babinski sign
- Damage to nerves that sense feeling
- Decreased number of large peripheral myelinated nerve fibers
- Decreased sensation in extremities
- Decreased touch sensation in extremities
- Delayed myelination
- Diffuse cerebellar atrophy
- Disorder of involuntary muscle movements
- Impaired pain sensation
- Inability to coordinate movements when walking
- Limb dystonia
- Profound static encephalopathy
- Abnormal basal ganglia morphology
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal corpus callosum morphology
- Absent speech development
- Orofacial dyskinesia
- Difficulty articulating speech
- Leukodystrophy
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PNPT1-geeni: polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pnpt1
Dante Labs. PNPT1-geeni: polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pnpt1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa