Geen
EFEMP2
EGF-like fibulin extracellular matrix protein 2
- HGNC 3219↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000172638↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 30008↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11q13.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 65 866 441–65 872 800 (GRCh38)
- Eksonid
- 11 eksonit, ulatus 6,4 kb
- Valk
- 443 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FBLN4, UPH1
- MANE Select transkript
- ENST00000307998.11NM_016938.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe EFEMP2 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Cutis laxa
Cutis laxa (CL) on pärilik või omandatud sidekoehaigus, mida iseloomustab kortsus, liigne ja lonkav elastsuseta nahk. Sellega kaasnevad luustiku- ja arenguhäired ning mõnel juhul ka raske süsteemne kahjustus. Pärilikku CL-i on kirjeldatud mitmeid erinevaid vorme, mida eristatakse pärimistüübi ning siseorganite kahjustuse ulatuse, kaasnevate kõrvalekallete ja haiguse raskusastme alusel.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 6 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas EFEMP2 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 6,4 kb; neist 1332 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse EFEMP2
36
kohad geenis EFEMP2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni EFEMP2 6,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,9 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Jagab 1 haigust
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Jagab 1 haigust
- ATP6V1AATPase H+ transporting V1 subunit AJagab 1 haigust
- ATP6V1E1ATPase H+ transporting V1 subunit E1Jagab 1 haigust
- ATP7AATPase copper transporting alphaJagab 1 haigust
- EFEMP1EGF-like fibulin extracellular matrix protein 1Jagab 1 haigust
- ELNelastinJagab 1 haigust
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Jagab 1 haigust
- FBLN5fibulin 5Jagab 1 haigust
- GORABgolgin, RAB6 interactingJagab 1 haigust
- LTBP1latent transforming growth factor beta binding protein 1Jagab 1 haigust
- LTBP4latent transforming growth factor beta binding protein 4Jagab 1 haigust
Geeniga EFEMP2 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida EFEMP2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- Arterial tortuosity
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Bulging of wall of large artery located above heart
- Generalized twisted arteries
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Right ventricular dilatation
- Slow heartbeats
- Tricuspid regurgitation
Näita veel 33 tunnust
- Twisted blood vessels
- Cutis marmorata
- Mucoid extracellular matrix accumulation
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal left ventricular function
- Abnormal systemic arterial morphology
- Aortic regurgitation
- Ascending aortic dissection
- Cardiac failure
- Descending aortic dissection
- Enlarged heart
- High blood pressure
- Narrowing of peripheral lung artery
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Stroke
- Abdominal aortic aneurysm
- Abnormal cardiac ventricular function
- Aneurysm
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Brain aneurysm
- Carotid artery dilatation
- Depleted blood volume
- Descending thoracic aorta aneurysm
- Dilatation of the ventricular cavity
- Ischemic stroke
- Mini stroke
- Patent ductus arteriosus
- Peripheral arterial stenosis
- Supravalvular aortic stenosis
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Pulmonary artery aneurysm
- Pulmonary artery dilatation
- Pulmonic regurgitation
Abnormality of the musculoskeletal system
- Congenital diaphragmatic hernia
- Funnel chest
- Low muscle tone
- Underdeveloped diaphragm
- Abnormality of connective tissue
- Double-Jointed
- Hernia
- Joint subluxation
Näita veel 3 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). EFEMP2 geen: EGF-like fibulin extracellular matrix protein 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/efemp2
Dante Labs. EFEMP2 geen: EGF-like fibulin extracellular matrix protein 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/efemp2
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast