Geen
RNASEH2C
ribonuclease H2 subunit C
- HGNC 24116↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000172922↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 84153↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11q13.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 65 717 673–65 720 798 (GRCh38)
- Eksonid
- 4 eksonit, ulatus 3,1 kb
- Valk
- 164 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- AYP1, AGS3
- MANE Select transkript
- ENST00000308418.10NM_032193.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe RNASEH2C ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Aicardi-Goutières'i sündroom
- RNASEH2C-seotud tüüp 1 interferonopaatiaAutosoomne retsessiivne
RNASEH2C variandid, mis põhjustavad Aicardi-Goutières'i sündroomi.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- Autosoomne retsessiivne
Aicardi-Goutières'i sündroom (AGS) on pärilik, subakuutselt kulgev entsefalopaatia, mida iseloomustavad basaalganglionide kaltsifikatsioon, leukodüstroofia ja liquori lümfotsütoos.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Harvinaised monogeensed autoinflammatoorsed haigused
- PTPN2-ga seotud autoinflammatsioon ja autoimmuunsusAutosoomne dominantne
Varajase algusega põletikuline ja autoimmuunhaigus, sealhulgas koliit ja artriit, mida põhjustavad PTPN2 variandid.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Ostali pärilikud immuunpuudulikkused
- Pärilik immuunpuudulikkus
Üks 114 sellega seotud geenist
Pärilikud immuunsüsteemi häired, mis on põhjustatud üksikute geenide muutustest ning mõjutavad seda, kuidas organism infektsioonidega võitleb või põletikku reguleerib.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Ostale pärilikud leukodüstroofiad
- Leukodüstroofia (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 80 sellega seotud geenist
Pärilikud seisundid, mis kahjustavad või takistavad müeliini, aju ja seljaaju valgeaine, normaalset moodustumist. Erinevad tüübid päranduvad autosoomselt retsessiivselt, autosoomselt dominantselt või X-seotult, sõltuvalt asjaomasest geenist.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Konkreetse geneetilise põhjuse teadmine võib lõpetada diagnostilise otsingu, suunata toetavat ravi ja jälgimist, näidata, kas konkreetne ravi on olemas, ning võimaldada sugulaste testimist.
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas RNASEH2C on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,6 kb kogupikkusega 3,1 kb; neist 495 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse RNASEH2C
7
kohad geenis RNASEH2C, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni RNASEH2C 3,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,6 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ADARadenosine deaminase RNA specificJagab 4 haigust
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Jagab 4 haigust
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit AJagab 4 haigust
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BJagab 4 haigust
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Jagab 4 haigust
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Jagab 4 haigust
- TREX1three prime repair exonuclease 1Jagab 4 haigust
- SKIC2SKI2 subunit of superkiller complexJagab 2 haigust
- SKIC3SKI3 subunit of superkiller complexJagab 2 haigust
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 1 haigust
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Jagab 1 haigust
Geeniga RNASEH2C seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RNASEH2C võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- Global developmental delay
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Brain degeneration
Näita veel 21 tunnust
- Chronic CSF lymphocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Abnormal cerebral white matter morphology
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Delayed myelination
- Encephalopathy
- Increased reflexes
- Severe global developmental delay
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RNASEH2C geen: ribonuclease H2 subunit C. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rnaseh2c
Dante Labs. RNASEH2C geen: ribonuclease H2 subunit C [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rnaseh2c
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast