Geen
B4GAT1
beta-1,4-glucuronyltransferase 1
- HGNC 15685↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000174684↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 11041↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11q13.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 66 345 374–66 347 629 (GRCh38)
- Eksonid
- 2 eksonit, ulatus 2,3 kb
- Valk
- 415 aminohapet
- Tuntud ka kui
- IGnT, iGAT, BETA3GNTI, B3GN-T1
- Varasemad tähised
- B3GNT6, B3GNT1
- MANE Select transkript
- ENST00000311181.5NM_006876.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe B4GAT1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Kaasasündinud lihasdüstroofiad
- Kaasasündinud lihasdüstroofia
Lihasdüstroofiate rühm, mis avaldub sünnil või imikueas, sealhulgas düstroglükanopaatiad (nt FKRP-, FKTN- ja POMT1/2-seotud vormid).
- ClinGen hindab seost järgmiselt: mõõdukas
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas B4GAT1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2 kb kogupikkusega 2,3 kb; neist 1248 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse B4GAT1
2
kohad geenis B4GAT1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni B4GAT1 2,3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Jagab 1 haigust
- CHKBcholine kinase betaJagab 1 haigust
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainJagab 1 haigust
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainJagab 1 haigust
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase AJagab 1 haigust
- DAG1dystroglycan 1Jagab 1 haigust
- DOK7docking protein 7Jagab 1 haigust
- DPM2dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatoryJagab 1 haigust
- DPM3dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatoryJagab 1 haigust
- FKRPfukutin related proteinJagab 1 haigust
Geeniga B4GAT1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida B4GAT1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Gray matter heterotopia
- Small cerebellum
- Ventriculomegaly
- Abnormal cerebellar vermis morphology
- Abnormal cortical gyration
- Abnormality of neuronal migration
- Absent reflexes
Näita veel 19 tunnust
- Decreased reflex response
- Fewer and broader ridges in brain
- Fewer or absent grooves in brain
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Specific learning disability
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Communicating hydrocephalus
- Type II lissencephaly
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Agenesis of cerebellar vermis
- Cerebellar hemisphere hypoplasia
- Hydromyelia
- Small brainstem
- Anencephaly
- Cortical dysplasia
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). B4GAT1 geen: beta-1,4-glucuronyltransferase 1. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/b4gat1
Dante Labs. B4GAT1 geen: beta-1,4-glucuronyltransferase 1 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/b4gat1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast