Geen
CTLA4
cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4
- HGNC 2505↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000163599↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1493↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 2q33.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 2: 203 867 771–203 873 965 (GRCh38)
- Eksonid
- 4 eksonit, ulatus 6,2 kb
- Valk
- 223 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Tuntud ka kui
- CD152, CD, GSE, CTLA-4
- Varasemad tähised
- CELIAC3, IDDM12
- MANE Select transkript
- ENST00000648405.2NM_005214.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CTLA4 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Autoimmuunhaigus
Haigusseisund, mis tuleneb ühe või mitme elundi talitlushäirest või koe hävimisest, mis tekib indiviidi humoraalse või rakulise immuunvastuse tõttu tema enda koe komponentidele. See võib olla süsteemne (nt süsteemne erütematoosne luupus) või elundispetsiifiline (nt türeoidiit).
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Autoimmunne lümfoproliferatiivne sündroom (ALPS)
- Autoimmunne lümfoproliferatiivne sündroom
Krooniline lümfisõlmede ja põrna suurenemine, autoimmuunsed tsütopeeniad ning suurenenud topeltnegatiivsete T-rakkude arv, mis on põhjustatud muutustest geenides FAS, FASLG, CASP10 ja teistes apoptoosiga seotud geenides.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Diagnoos võimaldab kasutada tsütopeeniate raviks sirolimuusi või muud immunosupressiivset ravi, vältida põhjendamatut splenektoomiat, jälgida lümfoomi tekkimise võimalust ning uurida pereliikmeid.
IPEX-sündroom ja muud tregopaatiad
- CTLA4 haploinsufitsientsAutosoomne dominantne
Autoimmuunsus, lümfoproliferatsioon, madal antikehade tase ning soole- või kopsupõletik, mida põhjustab CTLA4 ühe muutunud koopia; haiguse avaldumise tõenäosus on vähenenud.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Abatatsept või sirolimus võivad haigust kontrollida ning lähisugulastele võib pakkuda testimist.
Laiemad rühmad
Ostali pärilikud immuunpuudulikkused
- Pärilik immuunpuudulikkus
Üks 114 sellega seotud geenist
Pärilikud immuunsüsteemi häired, mis on põhjustatud üksikute geenide muutustest ning mõjutavad seda, kuidas organism infektsioonidega võitleb või põletikku reguleerib.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas CTLA4 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2 kb kogupikkusega 6,2 kb; neist 672 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CTLA4
43
kohad geenis CTLA4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CTLA4 6,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2 kb).
Variandid, millel on leht (15)
Siin on CTLA4 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A121Pfs*23 | c.361del | Ekson 2 | 203 870 834 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| C35X | c.105C>A | Ekson 1 | 203 868 047 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D153N | c.457G>A | Ekson 2 | 203 870 933 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| L24Pfs*35 | c.71_72del | Ekson 1 | 203 868 009 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| L28Ffs*44 | c.75del | Ekson 1 | 203 868 016 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| L28Sfs*32 | c.81dup | Ekson 1 | 203 868 017 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| P32Ffs*29 | c.94_101delinsTTCTCTTCATCA | Ekson 1 | 203 868 036 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| P136A | c.406C>G | Ekson 2 | 203 870 882 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| P136L | c.407C>T | Ekson 2 | 203 870 883 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| P136S | c.406C>T | Ekson 2 | 203 870 882 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- CASP10caspase 10Jagab 3 haigust
- CASP8caspase 8Jagab 3 haigust
- FASFas cell surface death receptorJagab 3 haigust
- FASLGFas ligandJagab 3 haigust
- KRASKRas proto-oncogene, GTPaseJagab 3 haigust
- PRKCDprotein kinase C deltaJagab 3 haigust
- C1QAcomplement C1q A chainJagab 2 haigust
- STAT1signal transducer and activator of transcription 1Jagab 2 haigust
- STAT3signal transducer and activator of transcription 3Jagab 2 haigust
- TREX1three prime repair exonuclease 1Jagab 2 haigust
- ADARadenosine deaminase RNA specificJagab 1 haigust
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseJagab 1 haigust
Geeniga CTLA4 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CTLA4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Autoimmunity
- Eczema
- Recurrent respiratory infections
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Skin rash
- Allergy
- Anti-complement component C1q antibody positivity
Näita veel 28 tunnust
- Anti-myeloperoxidase antibody positivity
- Anti-neutrophil elastase antibody positivity
- Anti-proteinase 3 antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Baby eczema
- Cytoplasmic antineutrophil antibody positivity
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Decreased immune function
- Increased inflammatory response
- Malar rash
- Pneumonia
- Recurrent chest infections
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Infection in blood stream
- Meningitis
- Psoriasiform dermatitis
- Recurrent Candida infection
- Serositis
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal lymphocyte morphology
- Abnormal T cell morphology
- Bloody nose
- Cancer of lymphatic system
- Cutaneous T-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Granulomatosis
- Autoimmune hemolytic anemia
Näita veel 13 tunnust
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the nose
- Abnormality of the oral cavity
- Sinus disease
- Blocked tear duct
- Periorbital edema
- Recurrent colds
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormality of salivation
Näita veel 4 tunnust
Abnormality of the cardiovascular system
- Disruption of blood oxygen supply to brain
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes
- High blood pressure
- Increased spleen size
- Raynaud phenomenon
- Abnormal heart rate
Näita veel 2 tunnust
Abnormality of the nervous system
- Peripheral neuropathy
- Cranial nerve paralysis
- Damage to nerves that sense feeling
- Depression
- Epilepsy
- Headache
- Paralysis on one side of body
- Tremor
Näita veel 2 tunnust
Laboratory abnormality
- Blood in urine
- Fever
- High urine protein levels
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- High ESR
- High urine neutrophil count
- Fluid around lungs
- Fluid retention
Näita veel 2 tunnust
Constitutional symptom
- Fatigue
- Joint pain
- Malaise
- Chest pain
- Chills
- Death of body tissue due to lack of blood flow or infection
- Muscle ache
- Shivering
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CTLA4 geen: cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ctla4
Dante Labs. CTLA4 geen: cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ctla4
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast