Gen
PIGN
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N
- HGNC 8967↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000197563↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 23556↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 18q21.33
- Souřadnice
- Chromozom 18: 62 041 164–62 187 056 (GRCh38)
- Exony
- 31 exonů na 145,9 kb
- Protein
- 931 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- MCD4, PIG-N
- Transkript MANE Select
- ENST00000640252.2NM_176787.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si PIGN i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
GPI Anchor Biosynthesis Defects
- PIGN-Related Multiple Congenital Anomalies-Hypotonia-Seizures Syndrome (MCAHS1)Autozomálně recesivní
A GPI anchor defect caused by variants in PIGN, with low muscle tone, early seizures, developmental delay and congenital anomalies.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Multiple Congenital Anomalies-Hypotonia-Seizures Syndrome
A group of GPI anchor defects (PIGN, PIGA, PIGT, PIGQ and related genes) with low muscle tone, seizures, developmental delay and congenital anomalies.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Disorders of GPI Anchor Biosynthesis
A group of inherited conditions caused by variants in the PIG, PGAP and related genes needed to make and attach the GPI anchor, typically causing developmental delay, low muscle tone and epilepsy.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Congenital Disorders of Glycosylation
- Congenital Disorders of Glycosylation (CDG)
Jeden z 98 genů spojených s touto vazbou
A large group of inherited conditions in which sugar chains (glycans) are not correctly built or attached to proteins and lipids, often affecting the brain, liver, blood clotting, growth and many other body systems. Most are autosomal recessive, but some are X-linked or autosomal dominant.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je PIGN uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 7,9 kb z 145,9 kb genu; 2 796 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PIGN
161
pozic v genu PIGN, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 6 (3,7 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Segmental duplications (6 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 145,9 kb genu PIGN, včetně intronů, nikoli jen 7,9 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class ASdílí 3 onemocnění
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class TSdílí 3 onemocnění
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 2Sdílí 2 onemocnění
- PGAP3post-GPI attachment to proteins phospholipase 3Sdílí 2 onemocnění
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)Sdílí 2 onemocnění
- PIGLphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class LSdílí 2 onemocnění
- PIGOphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class OSdílí 2 onemocnění
- PIGQphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class QSdílí 2 onemocnění
- PIGVphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class VSdílí 2 onemocnění
- PIGWphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class WSdílí 2 onemocnění
- PIGYphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class YSdílí 2 onemocnění
- ST3GAL5ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s PIGN
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PIGN. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- High palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Short neck
- Tented mouth
- Wide nasal bridge
- Big calvaria
Zobrazit ještě 32 rysů
- Big head present at birth
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
- Coarse facial features
- Nasal tip, upturned
- Non-midline cleft of the upper lip
- Prominent palatine ridges
- Thickened skin folds of neck
- Wide mouth
- Abnormal posterior cranial fossa morphology
- Asymmetric crying face
- Dandy-Walker malformation
- Decreased volume of lower lip
- Eye folds
- Full cheeks
- Gum enlargement
- Increased nuchal translucency
- Inflammation of eyelids
- Monobrow
- Narrow mouth
- Prominent back of the head
- Short nose
- Small forehead
- Small retruded chin
- Smooth philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Decreased volume of lip
- Depressed nasal bridge
- Frontal bossing
- Narrow forehead
- Open mouth
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Severe global developmental delay
- Agenesis of corpus callosum
- Choreoathetosis
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased reflex response
Zobrazit ještě 10 rysů
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Patent foramen ovale
- Tetralogy of Fallot
- Abnormal aortic arch morphology
- Abnormal aortic morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Feeding difficulties in infancy
- Abnormal anus position
- Absence or narrowing of first part of small bowel
- Absent anus
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intestinal malrotation
- Narrowing of anal opening
Zobrazit ještě 3 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PIGN: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pign
Dante Labs. Gen PIGN: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pign
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů