Gene
PIGN
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N
- HGNC 8967↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000197563↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 23556↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 18q21.33
- Coordinate
- Cromosoma 18: 62.041.164–62.187.056 (GRCh38)
- Esoni
- 31 esoni su 145,9 kb
- Proteina
- 931 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Noto anche come
- MCD4, PIG-N
- Trascritto MANE Select
- ENST00000640252.2NM_176787.5
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Difetti della biosintesi dell'ancora GPI
- Sindrome da malformazioni congenite multiple, ipotonia e crisi epilettiche correlata a PIGN (MCAHS1)Autosomica recessiva
Un difetto dell'ancora GPI causato da varianti in PIGN, con ipotonia, crisi epilettiche precoci, ritardo dello sviluppo e malformazioni congenite.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Sindrome da malformazioni congenite multiple, ipotonia e crisi epilettiche
Un gruppo di difetti dell'ancora GPI (PIGN, PIGA, PIGT, PIGQ e geni correlati) con ipotonia, crisi epilettiche, ritardo dello sviluppo e malformazioni congenite.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Disturbi della biosintesi dell'ancora GPI
Un gruppo di malattie ereditarie causate da varianti nei geni PIG, PGAP e geni correlati, necessari per produrre e agganciare l'ancora GPI, che tipicamente provocano ritardo dello sviluppo, ipotonia e epilessia.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Glicosilazione congenita disturbata (CDG)
Uno di 98 geni collegati ad esso
Un ampio gruppo di condizioni ereditarie in cui le catene di zuccheri (glicani) non vengono costruite o attaccate correttamente a proteine e lipidi, con effetti spesso su cervello, fegato, coagulazione del sangue, crescita e molti altri sistemi dell'organismo. La maggior parte è autosomica recessiva, ma alcune sono legate al cromosoma X o autosomiche dominanti.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di PIGN
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 7,9 kb dei 145,9 kb del gene; 2796 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge PIGN
161
posizioni in PIGN in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
6 di esse (3,7%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.
- Segmental duplications (6 siti)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un genoma intero copre tutti i 145,9 kb di PIGN, introni inclusi, non solo i 7,9 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class ACondivide 3 condizioni
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class TCondivide 3 condizioni
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 2Condivide 2 condizioni
- PGAP3post-GPI attachment to proteins phospholipase 3Condivide 2 condizioni
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)Condivide 2 condizioni
- PIGLphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class LCondivide 2 condizioni
- PIGOphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class OCondivide 2 condizioni
- PIGQphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class QCondivide 2 condizioni
- PIGVphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class VCondivide 2 condizioni
- PIGWphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class WCondivide 2 condizioni
- PIGYphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class YCondivide 2 condizioni
- ST3GAL5ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a PIGN
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PIGN può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- High palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Short neck
- Tented mouth
- Wide nasal bridge
- Big calvaria
Mostra altri 32 tratti
- Big head present at birth
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
- Coarse facial features
- Nasal tip, upturned
- Non-midline cleft of the upper lip
- Prominent palatine ridges
- Thickened skin folds of neck
- Wide mouth
- Abnormal posterior cranial fossa morphology
- Asymmetric crying face
- Dandy-Walker malformation
- Decreased volume of lower lip
- Eye folds
- Full cheeks
- Gum enlargement
- Increased nuchal translucency
- Inflammation of eyelids
- Monobrow
- Narrow mouth
- Prominent back of the head
- Short nose
- Small forehead
- Small retruded chin
- Smooth philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Decreased volume of lip
- Depressed nasal bridge
- Frontal bossing
- Narrow forehead
- Open mouth
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Severe global developmental delay
- Agenesis of corpus callosum
- Choreoathetosis
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased reflex response
Mostra altri 10 tratti
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Patent foramen ovale
- Tetralogy of Fallot
- Abnormal aortic arch morphology
- Abnormal aortic morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Feeding difficulties in infancy
- Abnormal anus position
- Absence or narrowing of first part of small bowel
- Absent anus
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intestinal malrotation
- Narrowing of anal opening
Mostra altri 3 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene PIGN: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pign
Dante Labs. Gene PIGN: phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pign
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