Genă
GNAO1
G protein subunit alpha o1
- HGNC 4389↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000087258↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 2775↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 16q13
- Coordonate
- Cromozomul 16: 56.191.489–56.357.444 (GRCh38)
- Exoni
- 9 de exoni pe 166 kb
- Proteină
- 354 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- G-ALPHA-o
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000262493.12NM_020988.3
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gnao1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți GNAO1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRaport curatoriat relevant pentru această genă
Epilepsie (panel complet)
- Epilepsie
Una dintre cele 171 gene legate de ea
O tulburare cerebrală caracterizată prin episoade de descărcare neuronală anormal de intensă, care duc la episoade tranzitorii de disfuncție neurologică senzorială sau motorie ori de disfuncție psihică. Aceste episoade pot fi sau nu asociate cu pierderea cunoștinței sau cu convulsii.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Structura genei GNAO1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 3,2 kb din cei 166 kb ai genei; 1.065 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențiere GNAO1
12Ușor
Cât de greu este de secvențiat GNAO1 cu citiri scurte, din 100
0 · Ușor100 · Greu
Aproape toți exonii lui GNAO1 se află în zone în care citirile scurte se aliniază curat.
Ce adaugă: ponderea exonilor lui GNAO1 din fiecare tip de regiune dificilă
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 pb nu pot fi plasate unic, astfel încât un apel de acolo poate lipsi sau fi greșit. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 100.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogi și pseudogene, cu identitate de 90% sau mai mare. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 60.0 %
- Comună cu chrYRegiunile pseudoautozomale și regiunea transpusă X, unde chrX și chrY conțin aceeași secvență sau una aproape identică, astfel încât o citire de pe unul poate fi plasată pe celălalt. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 60.0 %
- Acoperire de referințăGoluri din apropiere în asamblarea de referință, unde nu există secvență cu care citirile să se alinieze. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 50.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere integral. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 30.14 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 20.38 %
Un scor Dante Labs din propriile noastre cercetări, construit pe hărțile regiunilor greu de secvențiat Genome in a Bottle ale NIST.Cum se calculează scorulFiecare bară reprezintă ponderea bazelor exonice ale lui GNAO1 aflate în acel tip de regiune dificilă. Fiecare tip poate face singur o genă greu de analizat, iar fiecare tip suplimentar adaugă mai puțin: 0 când nicio bază nu se află în niciunul, 100 când fiecare bază se află acolo unde citirile nu pot fi plasate unic.
41
poziții în GNAO1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre ele nu se află într-o regiune în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
Un genom complet acoperă toți cei 166 kb ai GNAO1, inclusiv intronii, nu doar cei 3,2 kb de exoni.
ClinVar pathogenic variants (47)
The GNAO1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenă 15
- Patogenă/probabil patogenă 5
- Probabil patogenă 27
| Variantă | Conditions | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|
| NM_020988.3(GNAO1):c.607G>A (p.Gly203Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 and 1 other | Patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.625C>T (p.Arg209Cys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 and 1 other | Patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.626G>A (p.Arg209His) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.736G>A (p.Glu246Lys) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.470T>C (p.Leu157Pro) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.680C>T (p.Ala227Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 and 2 others | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.709G>A (p.Glu237Lys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 and 1 other | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.724-8G>A (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 and 1 other | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.1054G>A (p.Gly352Ser) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 and 1 other | Patogenă/probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.451G>A (p.Asp151Asn) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.662C>A (p.Ala221Asp) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Probabil patogenă | ★★★★2 stele din 4 criterii furnizate, mai mulți depunători, fără conflicte |
| NM_020988.3(GNAO1):c.118G>C (p.Gly40Arg) (opens in a new tab) | epilepsy | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.124G>A (p.Gly42Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.124G>C (p.Gly42Arg) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.140G>A (p.Ser47Asn) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.510del (p.Thr171fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.607G>C (p.Gly203Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.610G>C (p.Gly204Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.620C>T (p.Ser207Phe) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.748C>T (p.Leu250Phe) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.818A>T (p.Asp273Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.851T>C (p.Leu284Ser) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.4G>C (p.Gly2Arg) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.44G>A (p.Arg15Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_020988.3(GNAO1):c.57T>G (p.Ile19Met) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
See all 47 with every other GNAO1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gene asociate acelorași afecțiuni
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Are 1 afecțiune în comun
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseAre 1 afecțiune în comun
- ACTL6Bactin like 6BAre 1 afecțiune în comun
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Are 1 afecțiune în comun
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Are 1 afecțiune în comun
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitAre 1 afecțiune în comun
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Are 1 afecțiune în comun
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Are 1 afecțiune în comun
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorAre 1 afecțiune în comun
- ARXaristaless related homeoboxAre 1 afecțiune în comun
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Are 1 afecțiune în comun
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Are 1 afecțiune în comun
Trăsături asociate cu GNAO1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca GNAO1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Epilepsy
- Epileptic encephalopathy
- Generalized tonic seizure
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Intellectual disability, severe
- Focal motor seizure
Afișați încă 45 de trăsături
- Generalized myoclonic seizure
- Intellectual disability
- Chorea
- Degeneration of cerebrum
- Delayed CNS myelination
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased reflexes
- Lethargy
- Multifocal epileptiform discharges
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Atrophy/Degeneration affecting the brainstem
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized clonic seizure
- Grand mal seizures
- Infantile spasms
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Hyperactive movements
- Involuntary movements
- Orofacial dyskinesia
- Ventriculomegaly
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-19: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.19-9814e911.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena GNAO1: G protein subunit alpha o1. Accesat 19 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/gnao1
Dante Labs. Gena GNAO1: G protein subunit alpha o1 [Internet]. [citat 19 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/gnao1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni