Gen
GNAO1
G protein subunit alpha o1
- HGNC 4389↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000087258↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 2775↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 16q13
- Koordinater
- Kromosom 16: 56 191 489–56 357 444 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner på 166 kb
- Protein
- 354 aminosyror
- Även känd som
- G-ALPHA-o
- MANE Select-transkript
- ENST00000262493.12NM_020988.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Share this page
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gnao1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs GNAO1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Epilepsi (fullständig panel)
- Epilepsi
En av 171 gener kopplade till den
En hjärnsjukdom som kännetecknas av episoder med onormalt ökad neuronal urladdning, vilket ger övergående episoder av sensoriska eller motoriska neurologiska störningar eller psykiska störningar. Dessa episoder kan, men behöver inte, vara förknippade med medvetslöshet eller krampanfall.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är GNAO1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,2 kb av genens 166 kb, och 1 065 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av GNAO1
12Lätt
Hur svår GNAO1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i GNAO1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som tillkommer: andelen av GNAO1s exoner i varje typ av svår region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 100.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- Delas med chrYDe pseudoautosomala regionerna och den X-transponerade regionen, där chrX och chrY bär samma eller nästan samma sekvens, så en läsning från den ena kan placeras på den andra. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassemblyn, där det inte finns någon sekvens för läsningarna att anpassas mot. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 50.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, där läsningar glider och som kanske inte spänns över. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 30.14 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker glest. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 20.38 %
Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av GNAO1s exonbaser i den typen av svår region. Varje enskild typ kan göra en gen svår på egen hand, och varje ytterligare typ lägger till mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
41
positioner i GNAO1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsprov täcker alla 166 kb av GNAO1, inklusive introner, och inte bara de 3,2 kb exoner.
ClinVar-patogena varianter (47)
De GNAO1-varianter som ClinVar klassificerar som patogena eller sannolikt patogena för något tillstånd, granskade av minst en inlämnare med angivna kriterier, samt de mest granskade av dem. Det är ClinVars offentliga register över genen, aldrig ett resultat.
- Patogen 15
- Patogen/sannolikt patogen 5
- Sannolikt patogen 27
| Variant | Tillstånd | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_020988.3(GNAO1):c.607G>A (p.Gly203Arg) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 och 1 till | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.625C>T (p.Arg209Cys) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 och 1 till | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.626G>A (p.Arg209His) (öppnas i en ny flik) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.736G>A (p.Glu246Lys) (öppnas i en ny flik) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.470T>C (p.Leu157Pro) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.680C>T (p.Ala227Val) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 och 2 till | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.709G>A (p.Glu237Lys) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 och 1 till | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.724-8G>A (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 och 1 till | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.1054G>A (p.Gly352Ser) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 och 1 till | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.451G>A (p.Asp151Asn) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.662C>A (p.Ala221Asp) (öppnas i en ny flik) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_020988.3(GNAO1):c.118G>C (p.Gly40Arg) (öppnas i en ny flik) | epilepsy | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.124G>A (p.Gly42Arg) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.124G>C (p.Gly42Arg) (öppnas i en ny flik) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.140G>A (p.Ser47Asn) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.510del (p.Thr171fs) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.607G>C (p.Gly203Arg) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.610G>C (p.Gly204Arg) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.620C>T (p.Ser207Phe) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.748C>T (p.Leu250Phe) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.818A>T (p.Asp273Val) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.851T>C (p.Leu284Ser) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.4G>C (p.Gly2Arg) (öppnas i en ny flik) | neurodevelopmental disorder with involuntary movements | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.44G>A (p.Arg15Gln) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_020988.3(GNAO1):c.57T>G (p.Ile19Met) (öppnas i en ny flik) | developmental and epileptic encephalopathy, 17 och 1 till | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Visa alla 47 tillsammans med alla andra GNAO1-varianter i ClinVar → (öppnas i en ny flik)
Gener kopplade till samma tillstånd
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Delar 1 tillstånd
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDelar 1 tillstånd
- ACTL6Bactin like 6BDelar 1 tillstånd
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Delar 1 tillstånd
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Delar 1 tillstånd
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDelar 1 tillstånd
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDelar 1 tillstånd
- ARXaristaless related homeoboxDelar 1 tillstånd
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Delar 1 tillstånd
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till GNAO1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som GNAO1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Epilepsy
- Epileptic encephalopathy
- Generalized tonic seizure
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Intellectual disability, severe
- Focal motor seizure
Visa ytterligare 45 egenskaper
- Generalized myoclonic seizure
- Intellectual disability
- Chorea
- Degeneration of cerebrum
- Delayed CNS myelination
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased reflexes
- Lethargy
- Multifocal epileptiform discharges
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Atrophy/Degeneration affecting the brainstem
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dystonia
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized clonic seizure
- Grand mal seizures
- Infantile spasms
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Hyperactive movements
- Involuntary movements
- Orofacial dyskinesia
- Ventriculomegaly
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-19: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.19-9814e911.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). GNAO1-genen: G protein subunit alpha o1. Hämtad 21 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gnao1
Dante Labs. GNAO1-genen: G protein subunit alpha o1 [Internet]. [citerad 21 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gnao1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor