Gen
PTPN11
protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11
- HGNC 9644↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000179295↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 5781↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 12q24.13
- Coördinaten
- Chromosoom 12: 112.418.947–112.509.918 (GRCh38)
- Exons
- 16 exons over 91 kb
- Eiwit
- 593 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- BPTP3, SH-PTP2, SHP-2, PTP2C, SHP2
- Eerdere symbolen
- NS1
- MANE Select-transcript
- ENST00000351677.7NM_002834.5
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees PTPN11 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Noonansyndroom
- Autosomaal dominant
Het Noonansyndroom (NS) wordt gekenmerkt door kleine lichaamslengte, typische gelaatskenmerken en aangeboren hartafwijkingen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Hartcontroles, ontwikkelingsondersteuning, groeihormoontherapie, genetische counseling, studies met MEK-remmers
- Noonan-syndroom en aanverwante syndromen
Een groep aandoeningen van de RAS-signaleringsroute, waaronder het Noonan-, Costello-, cardiofaciocutane en Legius-syndroom, met wisselende hartafwijkingen, kleine lichaamslengte en kenmerkende gelaatstrekken.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Door hiervan op de hoogte te zijn, kan de hart-, groei- en ontwikkelingsbeoordeling beter worden ondersteund.
Bredere groeperingen
Hypertrofische cardiomyopathie
- Autosomaal dominant
Een van 62 genen die hiermee verband houden
Een aandoening waarbij de hartspier zonder duidelijke oorzaak is verdikt. De verdikking is doorgaans asymmetrisch en kan gepaard gaan met een obstructie van de uitstroombaan van de linkerkamer.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Bètablokkers, niet-dihydropyridine calciumkanaalblokkers, beperking van lichamelijke activiteit, genetische counseling
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van PTPN11
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 6,1 kb van de 91 kb van het gen; 1.782 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest PTPN11 leest
127
posities in PTPN11 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
1 daarvan (0,8%) valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
- Low mappability (1 positie)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een volledig genoom dekt alle 91 kb van PTPN11, inclusief introns, en niet alleen de 6,1 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (8)
De PTPN11-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| E139D | c.417G>C | Exon 4 | 112.453.279 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| I56T | c.167T>C | Exon 3 | 112.450.347 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| I56V | c.166A>G | Exon 3 | 112.450.346 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| M504V | c.1510A>G | Exon 13 | 112.489.086 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| N308D | c.922A>G | Exon 8 | 112.477.719 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| Q510P | c.1529A>C | Exon 13 | 112.489.105 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| T468M | c.1403C>T | Exon 12 | 112.488.466 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| Y63C | c.188A>G | Exon 3 | 112.450.368 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeelt 3 aandoeningen
- ERFETS2 repressor factorDeelt 3 aandoeningen
- KRASKRas proto-oncogene, GTPaseDeelt 3 aandoeningen
- LZTR1leucine zipper like post translational regulator 1Deelt 3 aandoeningen
- MAPK1mitogen-activated protein kinase 1Deelt 3 aandoeningen
- MRASmuscle RAS oncogene homologDeelt 3 aandoeningen
- NRASNRAS proto-oncogene, GTPaseDeelt 3 aandoeningen
- PPP1CBprotein phosphatase 1 catalytic subunit betaDeelt 3 aandoeningen
- RAF1Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeelt 3 aandoeningen
- RIT1Ras like without CAAX 1Deelt 3 aandoeningen
- RRAS2RAS related 2Deelt 3 aandoeningen
- SHOC2SHOC2 leucine rich repeat scaffold proteinDeelt 3 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan PTPN11
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die PTPN11 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Multiple enchondromatosis
- Multiple exostoses
- Abnormal shape of end part of bone
- Bone pain
- Death of bone due to decreased blood supply
- Double-Jointed
- Formation of new noncancerous bone on top of existing bone
- Funnel chest
Toon 17 kenmerken meer
- Muscle weakness
- Pigeon chest
- Wide rib cage
- Delayed bone maturation
- High shoulder blade
- Low muscle tone
- Scoliosis
- Abnormality of the sternum
- Osteopenia
- Abnormal shape of joints
- Kyphoscoliosis
- Missing ribs
- Multiple digital exostoses
- Pectus excavatum of inferior sternum
- Shield chest
- Superior pectus carinatum
- Synovitis
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal EKG
- Abnormal heart rate
- Abnormal pulmonary valve morphology
- Abnormality of lung artery
- Bundle branch block
- Enlarged and thickened heart muscle
- Narrowing of lung artery
Toon 16 kenmerken meer
- Narrowing of pulmonic valve
- Abnormal mitral valve morphology
- Abnormality of the lymphatic system
- Abnormality of the spleen
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in center of heart
- Mitral valve prolapse
- Abnormal endocardium morphology
- Aneurysm
- Complete atrioventricular canal defect
- Heart attack
- Narrowing of aorta
- Narrowing of blood vessel below aortic heart valve
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Patent ductus arteriosus
- Complete heart block
Abnormality of the integument
- Birthmark
- Liver spots
- Beauty mark
- Freckling
- Hyperelastic skin
- Abnormal fingerprints
- Abnormal hair quantity
- Coarse hair
Toon 4 kenmerken meer
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the reproductive system
- Undescended testes
- Decreased fertility
- Abnormal localisation of kidneys
- Dilatation of the renal pelvis
- Hypospadias
- Absent kidney on one side
- Absent ovary
Toon 3 kenmerken meer
Abnormality of limbs
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Winged shoulder blade
- Curvature of little finger
- Fused forearm bones
- Outward turned elbows
- Short fingers or toes
- Bowing of the long bones
- Curvature of digit
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of the nervous system
- Abnormal speech pattern
- Cranial nerve paralysis
- Difficulty articulating speech
- Neurodevelopmental delay
- Cancer of early nerve cells
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal platelet function
- Abnormality of coagulation
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Juvenile myelomonocytic leukemia
- Myelodysplasia
- Amegakaryocytic thrombocytopenia
- Reduced factor XII activity
Toon 1 kenmerk meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). PTPN11-gen: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/ptpn11
Dante Labs. PTPN11-gen: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/ptpn11
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken