Gen
PTPN11
protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11
- HGNC 9644↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000179295↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 5781↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 12q24.13
- Współrzędne
- Chromosom 12: 112 418 947–112 509 918 (GRCh38)
- Eksony
- 16 eksonów na odcinku 91 kb
- Białko
- 593 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Znany również jako
- BPTP3, SH-PTP2, SHP-2, PTP2C, SHP2
- Poprzednie symbole
- NS1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000351677.7NM_002834.5
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj PTPN11 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Zespół Noonana
- Autosomalne dominujące
Zespół Noonana (NS) charakteryzuje się niskim wzrostem, typowym dysmorfizmem twarzy oraz wrodzonymi wadami serca.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Monitorowanie kardiologiczne, wsparcie rozwojowe, terapia hormonem wzrostu, poradnictwo genetyczne, badania kliniczne inhibitorów MEK
- Zespół Noonan i zespoły pokrewne Noonan
Grupa schorzeń związanych ze szlakiem RAS, w tym zespoły Noonan, Costello, kardiofaciokutaneralny i Legiusa, o zmiennych wadach serca, niskim wzroście i charakterystycznych rysach twarzy.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Wiedza o tym stanowi wsparcie w ocenie pracy serca, wzrastania i rozwoju.
Szersze grupy
Kardiomiopatia przerostowa
- Autosomalne dominujące
Jeden z 62 powiązanych z nim genów
Schorzenie, w którym mięsień sercowy ulega przerostowi bez oczywistej przyczyny. Przerost jest zazwyczaj asymetryczny i może wiązać się z zaburzeniem odpływu z komory.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Beta-blokery, niedihydropirydynowe blokery kanału wapniowego, ograniczenie aktywności fizycznej, poradnictwo genetyczne
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
Budowa genu PTPN11
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 6,1 kb z 91 kb genu; 1782 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje PTPN11
127
pozycje w PTPN11, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
1 z nich (0,8%) przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (1 miejsce)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 91 kb genu PTPN11, łącznie z intronami, a nie tylko 6,1 kb eksonów.
Warianty z podstroną (8)
Warianty PTPN11 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| E139D | c.417G>C | Ekson 4 | 112 453 279 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| I56T | c.167T>C | Ekson 3 | 112 450 347 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| I56V | c.166A>G | Ekson 3 | 112 450 346 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| M504V | c.1510A>G | Ekson 13 | 112 489 086 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| N308D | c.922A>G | Ekson 8 | 112 477 719 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| Q510P | c.1529A>C | Ekson 13 | 112 489 105 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| T468M | c.1403C>T | Ekson 12 | 112 488 466 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| Y63C | c.188A>G | Ekson 3 | 112 450 368 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseWspólnych schorzeń: 3
- ERFETS2 repressor factorWspólnych schorzeń: 3
- KRASKRas proto-oncogene, GTPaseWspólnych schorzeń: 3
- LZTR1leucine zipper like post translational regulator 1Wspólnych schorzeń: 3
- MAPK1mitogen-activated protein kinase 1Wspólnych schorzeń: 3
- MRASmuscle RAS oncogene homologWspólnych schorzeń: 3
- NRASNRAS proto-oncogene, GTPaseWspólnych schorzeń: 3
- PPP1CBprotein phosphatase 1 catalytic subunit betaWspólnych schorzeń: 3
- RAF1Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinaseWspólnych schorzeń: 3
- RIT1Ras like without CAAX 1Wspólnych schorzeń: 3
- RRAS2RAS related 2Wspólnych schorzeń: 3
- SHOC2SHOC2 leucine rich repeat scaffold proteinWspólnych schorzeń: 3
Cechy powiązane z genem PTPN11
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać PTPN11. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Multiple enchondromatosis
- Multiple exostoses
- Abnormal shape of end part of bone
- Bone pain
- Death of bone due to decreased blood supply
- Double-Jointed
- Formation of new noncancerous bone on top of existing bone
- Funnel chest
Pokaż jeszcze 17 cech
- Muscle weakness
- Pigeon chest
- Wide rib cage
- Delayed bone maturation
- High shoulder blade
- Low muscle tone
- Scoliosis
- Abnormality of the sternum
- Osteopenia
- Abnormal shape of joints
- Kyphoscoliosis
- Missing ribs
- Multiple digital exostoses
- Pectus excavatum of inferior sternum
- Shield chest
- Superior pectus carinatum
- Synovitis
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal EKG
- Abnormal heart rate
- Abnormal pulmonary valve morphology
- Abnormality of lung artery
- Bundle branch block
- Enlarged and thickened heart muscle
- Narrowing of lung artery
Pokaż jeszcze 16 cech
- Narrowing of pulmonic valve
- Abnormal mitral valve morphology
- Abnormality of the lymphatic system
- Abnormality of the spleen
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in center of heart
- Mitral valve prolapse
- Abnormal endocardium morphology
- Aneurysm
- Complete atrioventricular canal defect
- Heart attack
- Narrowing of aorta
- Narrowing of blood vessel below aortic heart valve
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Patent ductus arteriosus
- Complete heart block
Abnormality of the integument
- Birthmark
- Liver spots
- Beauty mark
- Freckling
- Hyperelastic skin
- Abnormal fingerprints
- Abnormal hair quantity
- Coarse hair
Pokaż jeszcze 4 cech
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the reproductive system
- Undescended testes
- Decreased fertility
- Abnormal localisation of kidneys
- Dilatation of the renal pelvis
- Hypospadias
- Absent kidney on one side
- Absent ovary
Pokaż jeszcze 3 cech
Abnormality of limbs
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Winged shoulder blade
- Curvature of little finger
- Fused forearm bones
- Outward turned elbows
- Short fingers or toes
- Bowing of the long bones
- Curvature of digit
Pokaż jeszcze 2 cech
Abnormality of the nervous system
- Abnormal speech pattern
- Cranial nerve paralysis
- Difficulty articulating speech
- Neurodevelopmental delay
- Cancer of early nerve cells
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
Pokaż jeszcze 2 cech
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal platelet function
- Abnormality of coagulation
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Juvenile myelomonocytic leukemia
- Myelodysplasia
- Amegakaryocytic thrombocytopenia
- Reduced factor XII activity
Pokaż jeszcze 1 cechę
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen PTPN11: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ptpn11
Dante Labs. Gen PTPN11: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ptpn11
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni