Gén
COL11A1
collagen type XI alpha 1 chain
- HGNC 2186↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000060718↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 1301↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1p21.1
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 102 876 473–103 108 522 (GRCh38)
- Exonok
- 67 exon, összesen 232,1 kb
- Fehérje
- 1806 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális domináns
- Más néven ismert
- STL2, CO11A1
- Korábbi jelölések
- COLL6, DFNA37
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000370096.9NM_001854.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a COL11A1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Hearing Loss and Deafness
- Autosomal Dominant Nonsyndromic Hearing LossAutoszomális domináns
Autosomal dominant form of nonsyndromic deafness.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: közepes
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Nonsyndromic Genetic Hearing Loss
A 97 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited hearing loss without other medical features, including the common recessive forms caused by GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC and many other genes, as well as dominant, X-linked and mitochondrial forms.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: közepes
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Knowing the genetic cause can guide hearing support and cochlear implant decisions, gene-therapy trial eligibility (for example OTOF) and family counselling.
Vitreoretinopathy
- Marshall SyndromeAutoszomális domináns
A dominant condition related to Stickler syndrome, caused by changes in COL11A1, with high short-sightedness, a risk of retinal detachment, hearing loss and distinctive facial features.
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Vitreoretinal Degeneration
- 2 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Öröklődési mód
- Autoszomális domináns
- Egy megváltozott másolat bármelyik szülőtől is származik, elegendő. Az a szülő, akinek van ilyen másolata, minden gyermekének 50%-os eséllyel adja tovább.
A COL11A1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 232,1 kb-jából 7,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 5421 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) COL11A1 gént
72
pozíció a(z) COL11A1 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a COL11A1 gén mind a 232,1 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 7,3 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACTG1actin gamma 12 betegséget oszt meg
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11A2 betegséget oszt meg
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 22 betegséget oszt meg
- CD164CD164 molecule2 betegséget oszt meg
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane component2 betegséget oszt meg
- COCHcochlin2 betegséget oszt meg
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chain2 betegséget oszt meg
- DIAPH1diaphanous related formin 12 betegséget oszt meg
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 42 betegséget oszt meg
- GJB2gap junction protein beta 22 betegséget oszt meg
- GJB6gap junction protein beta 62 betegséget oszt meg
- GREB1LGREB1 like retinoic acid receptor coactivator2 betegséget oszt meg
A(z) COL11A1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) COL11A1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of head or neck
- Depressed nasal bridge
- Midface retrusion
- Short nose
- Abnormal dentition
- Broad head shape
- Cheekbone underdevelopment
- Cleft palate
- Flat face
Még 30 tulajdonság megjelenítése
- Full lower lip
- Full upper lip
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Nasal tip, upturned
- Round face
- Short neck
- Wide nasal bridge
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Zygomatic flattening
- Bifid uvula
- Decreased depth of eye sockets
- Decreased size of maxilla
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Frontal bossing
- Hypoplastic frontal sinuses
- Increased thickness of skull cap
- Narrow mouth
- Pierre-Robin sequence
- Retraction of the tongue
- Asymmetry of the posterior head
- High palate
- High, narrow palate
- Sparse eyebrow
- Sparse eyelashes
- Absent frontal sinuses
- Eye folds
- Macrodontia of permanent maxillary central incisor
- Widely patent coronal suture
- Widely patent sagittal suture
Abnormality of the musculoskeletal system
- Ankle pain
- Knee pain
- Low muscle tone
- Lumbar hypolordosis
- Recurrent fractures
- Abnormal vertebral body morphology
- Abnormality of the ribs
- Bell-shaped thorax
Még 26 tulajdonság megjelenítése
- Broad ribs
- Narrow chest
- Short ribs
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Degenerative joint disease
- Small shoulder blade
- Double-Jointed
- Flattened vertebrae
- Anterior rib cupping
- Broad ischia
- Broad long bones
- Calcification of falx cerebri
- Disease of the joints
- Hypoplastic ischia
- Long collarbone
- Meningeal calcification
- Narrow greater sciatic notch
- Permanent flexion of the finger or toe
- Posterior rib cupping
- Posterior vertebral hypoplasia
- Short long bone
- Small chest
- Small wings of the pelvic girdle
- Spondyloepiphyseal dysplasia
- Thin collarbone
- Thin ribs
Abnormality of limbs
- Broad wide portion of long bone
- Abnormal shape of shaft of long bone
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Disproportionately short upper portion of limb
- Short fingers or toes
- Smaller or shorter than typical limbs
- Bowed thighbone
- Dumbbell-shaped long bone
Még 22 tulajdonság megjelenítése
- Knock knees
- Short thighbone
- Curvature of little finger
- Curvature of ring finger
- Permanent flexion of the finger
- Bowing of outer large bone of the forearm
- Coxa valga
- Curving of inner forearm bone
- Irregular innermost shankbone end part
- Irregular outermost thighbone end part
- Irregular thighbone end part
- Joint contracture of the hand
- Knee osteoarthritis
- Long fingers
- Long slender fingers
- Short calf bone
- Short foot
- Short palm
- Small end part of innermost shankbone
- Small end part of outermost thighbone
- Small hand
- Wide tips of outermost digital bone
Abnormality of the eye
- Abnormal vitreous humor morphology
- Angle closure glaucoma
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Degenerative vitreoretinopathy
- Remnants of the hyaloid vascular system
- Retinal dysplasia
- Severe near sightedness
Még 15 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). COL11A1 gén: collagen type XI alpha 1 chain. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/col11a1
Dante Labs. COL11A1 gén: collagen type XI alpha 1 chain [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/col11a1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt