Gén
ATP7A
ATPase copper transporting alpha
- HGNC 869↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000165240↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 538↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- Xq21.1
- Koordináták
- X. kromoszóma: 77 910 693–78 050 395 (GRCh38)
- Exonok
- 23 exon, összesen 139,7 kb
- Fehérje
- 1500 aminosav
- Korábbi jelölések
- MNK
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000341514.11NM_000052.7
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp7a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a ATP7A-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Charcot-Marie-Tooth Disease
- Distal Hereditary Motor Neuropathy
Inherited neuropathies that mainly affect motor nerves, causing weakness and wasting of the hands and feet, including SORD-related neuropathy.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: mérsékelt
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Cutis Laxa
Cutis laxa (CL) is an inherited or acquired connective tissue disorder characterized by wrinkled, redundant and sagging inelastic skin associated with skeletal and developmental anomalies and, in some cases, with severe systemic involvement. Several different forms of inherited CL have been described, differentiated on the basis of the mode of inheritance and differences in the extent of internal organ involvement, associated anomalies and disease severity.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Disorder of Copper Metabolism
An inherited metabolic disease that is has its basis in the disruption of cellular copper ion homeostasis.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 7 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Spinal Muscular Atrophy
A group of disorders characterised by degeneration of spinal cord anterior horn cells, leading to progressive muscle weakness and atrophy.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: mérsékelt
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Gene therapy (onasemnogene abeparvovec), antisense oligonucleotide therapy (nusinersen), oral splicing modifier (risdiplam), supportive care
Átfogóbb csoportosítások
Inherited Neurodegenerative Disorders
- KIF5A-Related Neurodegenerative DisorderAutoszomális domináns
A 372 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one copy of KIF5A, which encodes a motor protein with a cargo-binding tail. Different types of change lead to different conditions: hereditary spastic paraplegia type 10, an axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis (ALS).
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: mérsékelt
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Care is symptomatic and depends on the presentation, including physiotherapy, antispasticity medicines and multidisciplinary ALS care. Each child of an affected person has a 1 in 2 chance of inheriting the change; genetic counselling helps families understand this.
Rare Hereditary Peripheral Neuropathies
- Hereditary Peripheral Neuropathy
A 233 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one of many genes needed to keep long nerve fibres healthy. In this report these include IGHMBP2 and PLEKHG5, which are recessive.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: mérsékelt
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Physiotherapy, orthoses and occupational therapy help maintain mobility, with surgery for foot deformities when needed. Some forms need breathing monitoring. Genetic counselling guides family testing according to the inheritance pattern of the gene involved.
A ATP7A felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 139,7 kb-jából 8,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4503 bázis kódolja a fehérjét.
ATP7A szekvenálása
224
a ATP7A-génen belüli pozíciók, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a ATP7A mind a 139,7 kb-os szakaszát lefedi, az intronokkal együtt, nem csupán az exonok 8,5 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (237)
The ATP7A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 120
- Patogén/valószínűleg patogén 10
- Valószínűleg patogén 107
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_000052.7(ATP7A):c.169C>T (p.Gln57Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.466_467insC (p.Lys156fs) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.601C>T (p.Arg201Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1273del (p.Leu424_Leu425insTer) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1639C>T (p.Arg547Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1782C>G (p.Tyr594Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1870-1G>C (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1933C>T (p.Arg645Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1996G>C (p.Gly666Arg) (opens in a new tab) | Menkes disease and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2187G>A (p.Trp729Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2383C>T (p.Arg795Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2499-1G>A (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2938C>T (p.Arg980Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2956C>T (p.Arg986Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.3111G>T (p.Lys1037Asn) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.3473C>A (p.Ser1158Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.422_423del (p.Glu141fs) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1544-1G>A (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.1874T>G (p.Leu625Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2172+5G>C (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2179G>A (p.Gly727Arg) (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2916+3_2916+6del (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.2922C>A (p.Tyr974Ter) (opens in a new tab) | Menkes disease | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.3943G>A (p.Gly1315Arg) (opens in a new tab) | Menkes disease | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000052.7(ATP7A):c.4005+1G>T (opens in a new tab) | Menkes disease and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
See all 237 with every other ATP7A variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 15 betegséget oszt meg
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipin4 betegséget oszt meg
- DCTN1dynactin subunit 14 betegséget oszt meg
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B24 betegséget oszt meg
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 14 betegséget oszt meg
- FBXO38F-box protein 384 betegséget oszt meg
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 14 betegséget oszt meg
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 84 betegséget oszt meg
- IGHMBP2immunoglobulin mu DNA binding protein 24 betegséget oszt meg
- PLEKHG5pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G54 betegséget oszt meg
- REEP1receptor accessory protein 14 betegséget oszt meg
- SIGMAR1sigma receptor chaperone 14 betegséget oszt meg
A(z) ATP7A génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) ATP7A gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone
- Poor head control
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Double-Jointed
- Formation of new noncancerous bone on top of existing bone
- Funnel chest
- Hernia
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
Még 29 tulajdonság megjelenítése
- Spasticity and rigidity of muscles
- Flattened vertebrae
- Fusion of joints
- Muscle weakness
- Narrow chest
- Osteopenia
- Osteoporosis
- Pigeon chest
- Scarring
- Softening of the bones
- Weak and soft bones
- Abnormal formation of the hip
- Abnormality of the pubic bone
- Absent collarbone
- Breakdown of bone
- Calcium deposits in joints
- Hunched back
- Large iliac wing
- Recurrent fractures
- Rounded shoulders
- Scoliosis
- Broad collarbone
- Broad ribs
- Distal muscle wasting
- EMG: neuropathic changes
- Pelvic bone exostoses
- Short collarbone
- Spinal muscle degeneration
- Weakness of outermost muscles
Abnormality of the digestive system
- Abdominal pain
- Absent/small abdominal wall muscles
- Constipation
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Feeding difficulties in infancy
- Functional abnormality of the gastrointestinal tract
- Inguinal hernia
- Intestinal obstruction
Még 22 tulajdonság megjelenítése
- Nausea and vomiting
- Umbilical hernia
- Abdominal bloating
- Abnormal esophagus physiology
- Acid reflux
- Bilious emesis
- Chronic diarrhea
- Delayed gastric emptying
- Feeding difficulties
- Inflammation of the esophagus
- Jaundice
- Liver inflammation
- Malabsorption
- Poor suck
- Poor swallowing
- Prolonged yellowing of skin in newborn
- Slowed or blocked flow of bile from liver
- Stomach hernia
- Colon perforation
- Diarrhea
- Enterocolitis
- Femoral hernia
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the face
- Abnormality of the palate
- Abnormality of the skull
- Abnormally small head
- Delayed cranial suture closure
- Wide fontanelles
- Abnormality of the sense of smell
- Expressionless face
Még 15 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the integument
- Brittle hair
- Flattened and twisted hair
- Hair loss
- Hyperelastic skin
- Patchy lightened skin
- Afro-textured hair
- Dry skin
- Loss of hair color
Még 9 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). ATP7A gén: ATPase copper transporting alpha. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/atp7a
Dante Labs. ATP7A gén: ATPase copper transporting alpha [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/atp7a
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt