Gén
EMILIN1
elastin microfibril interfacer 1
- HGNC 19880↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000138080↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 11117↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 2p23.3
- Koordináták
- 2. kromoszóma: 27 078 615–27 086 403 (GRCh38)
- Exonok
- 8 exon, összesen 7,8 kb
- Fehérje
- 1016 aminosav
- Más néven ismert
- DKFZp586M121, gp115, EMILIN
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000380320.9NM_007046.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/emilin1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a EMILIN1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Charcot-Marie-Tooth Disease
- Distal Hereditary Motor Neuropathy
Inherited neuropathies that mainly affect motor nerves, causing weakness and wasting of the hands and feet, including SORD-related neuropathy.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Cutis Laxa
Cutis laxa (CL) is an inherited or acquired connective tissue disorder characterized by wrinkled, redundant and sagging inelastic skin associated with skeletal and developmental anomalies and, in some cases, with severe systemic involvement. Several different forms of inherited CL have been described, differentiated on the basis of the mode of inheritance and differences in the extent of internal organ involvement, associated anomalies and disease severity.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Spinal Muscular Atrophy
A group of disorders characterised by degeneration of spinal cord anterior horn cells, leading to progressive muscle weakness and atrophy.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Gene therapy (onasemnogene abeparvovec), antisense oligonucleotide therapy (nusinersen), oral splicing modifier (risdiplam), supportive care
Átfogóbb csoportosítások
Inherited Neurodegenerative Disorders
- KIF5A-Related Neurodegenerative DisorderAutoszomális domináns
A 372 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one copy of KIF5A, which encodes a motor protein with a cargo-binding tail. Different types of change lead to different conditions: hereditary spastic paraplegia type 10, an axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis (ALS).
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Care is symptomatic and depends on the presentation, including physiotherapy, antispasticity medicines and multidisciplinary ALS care. Each child of an affected person has a 1 in 2 chance of inheriting the change; genetic counselling helps families understand this.
Rare Hereditary Peripheral Neuropathies
- Hereditary Peripheral Neuropathy
A 233 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one of many genes needed to keep long nerve fibres healthy. In this report these include IGHMBP2 and PLEKHG5, which are recessive.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Physiotherapy, orthoses and occupational therapy help maintain mobility, with surgery for foot deformities when needed. Some forms need breathing monitoring. Genetic counselling guides family testing according to the inheritance pattern of the gene involved.
A EMILIN1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 7,8 kb-jából 3,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3051 bázis kódolja a fehérjét.
EMILIN1 szekvenálása
18Közepes
Mennyire nehéz a EMILIN1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A EMILIN1 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.
Ehhez hozzájárul: a EMILIN1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.4,8%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.85%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a EMILIN1 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
1
a EMILIN1 azon pozíciója, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a EMILIN1 mind a 7,8 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 3,9 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (1)
The EMILIN1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Valószínűleg patogén 1
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_007046.4(EMILIN1):c.1333C>T (p.Arg445Ter) (opens in a new tab) | arterial tortuosity-bone fragility syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ATP7AATPase copper transporting alpha5 betegséget oszt meg
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipin4 betegséget oszt meg
- DCTN1dynactin subunit 14 betegséget oszt meg
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B24 betegséget oszt meg
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 14 betegséget oszt meg
- FBXO38F-box protein 384 betegséget oszt meg
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 14 betegséget oszt meg
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 84 betegséget oszt meg
- IGHMBP2immunoglobulin mu DNA binding protein 24 betegséget oszt meg
- PLEKHG5pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G54 betegséget oszt meg
- REEP1receptor accessory protein 14 betegséget oszt meg
- SIGMAR1sigma receptor chaperone 14 betegséget oszt meg
A(z) EMILIN1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) EMILIN1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the cardiovascular system
- Aortic tortuosity
- Arterial tortuosity
- Carotid artery tortuosity
- Coronary artery aneurysm
- Postductal coarctation of the aorta
- Vertebral artery tortuosity
- Aortic regurgitation
- Ascending aortic dissection
Még 9 tulajdonság megjelenítése
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Descending aortic dissection
- Disease of the heart muscle
- Retinal vascular tortuosity
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Common origin of the right brachiocephalic artery and left common carotid artery
- High blood pressure
- Narrowing of aorta
- Stroke
Abnormality of the musculoskeletal system
- Fiber type grouping
- Multiple fractures present at birth
- Degenerative joint disease
- Double-Jointed
- Large joint hypermobility
- Low muscle tone
- Osteopenia
- Recurrent fractures
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). EMILIN1 gén: elastin microfibril interfacer 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/emilin1
Dante Labs. EMILIN1 gén: elastin microfibril interfacer 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/emilin1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt