Gène
LAMA3
laminin subunit alpha 3
- HGNC 6483↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000053747↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 3909↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 18q11.2
- Coordonnées
- Chromosome 18 : 23 689 453–23 955 066 (GRCh38)
- Exons
- 75 exons sur 265,6 kb
- Protéine
- 3 333 acides aminés
- Aussi appelé
- nicein-150kDa, kalinin-165kDa, BM600-150kDa, epiligrin
- Symboles précédents
- LAMNA
- Transcrit MANE Select
- ENST00000313654.14NM_198129.4
- Type de locus
- Codant pour une protéine
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Épidermolyse bulleuse
- Épidermolyse bulleuse jonctionnelle 2a, intermédiaireAutosomique récessif
- 1 évaluateur GenCC le classe comme définitif ou fort
- Épidermolyse bulleuse jonctionnelle 2b, sévèreAutosomique récessif
- 1 évaluateur GenCC le classe comme définitif ou fort
- Épidermolyse bulleuse héréditaire
Toutes les formes héréditaires de fragilité cutanée avec formation de cloques, notamment l'épidermolyse bulleuse simple, jonctionnelle et dystrophique, ainsi que le syndrome de Kindler.
- 5 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Les formes dystrophiques récessives nécessitent une surveillance régulière pour le cancer de la peau, et une thérapie cicatrisante basée sur les gènes est désormais disponible pour l'épidermolyse bulleuse dystrophique.
Structure de LAMA3
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 10,7 kb sur les 265,6 kb du gène ; 10 002 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de LAMA3
1Faible
Difficulté de séquençage de LAMA3 avec des lectures courtes, sur 100Chaque barre représente la part des bases d'exons de LAMA3 situées dans ce type de région difficile. Le score les pondère selon le coût de chacune pour un appel en lecture courte : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une telle région, 100 lorsque chaque base se trouve dans toutes.
- CartographiabilitéZones où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel à cet endroit peut être manquant ou erroné. Poids 35 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 30 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir entièrement. Poids 15 %.1,1 %
- Teneur en GCFenêtres dont le taux de G et de C est inférieur à 25 % ou supérieur à 65 %, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 10 %.12 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 10 %.0 %
88
positions dans LAMA3 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à couvrir.
Un génome complet couvre les 265,6 kb de LAMA3, introns compris, et pas seulement les 10,7 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- CD151CD151 molecule (Raph blood group)Partage 1 affection
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainPartage 1 affection
- COL7A1collagen type VII alpha 1 chainPartage 1 affection
- DSPdesmoplakinPartage 1 affection
- DSTdystoninPartage 1 affection
- EXPH5exophilin 5Partage 1 affection
- FERMT1FERM domain containing kindlin 1Partage 1 affection
- ITGA3integrin subunit alpha 3Partage 1 affection
- ITGA6integrin subunit alpha 6Partage 1 affection
- ITGB4integrin subunit beta 4Partage 1 affection
- JUPjunction plakoglobinPartage 1 affection
- KLHL24kelch like family member 24Partage 1 affection
Traits associés à LAMA3
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que LAMA3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the integument
- Abnormal blistering of the skin
- Hypoplastic dermoepidermal hemidesmosomes
- Lamina lucida cleavage
- Poor nail formation
- Abnormal skin pigmentation
- Abnormality of the nail
- Absence of part of skin at birth
- Fragile skin
Afficher 16 traits supplémentaires
- Milk spot
- Open skin sore
- Skin erosion
- Skin plaque
- Sparse body hair
- Sunken or indented skin due to damage
- Abnormal periungual morphology
- Absent nails
- Exuberant granulation tissue
- Paronychia
- Subepidermal blistering
- Hair loss
- Squamous cell carcinoma
- Atypical nail growth
- Congenital localized absence of skin
- Recurrent loss of toenails and fingernails
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the bladder
- Absent/small bladder
- Cystic kidney disease
- Dull burning sensation with urination
- Duplicated collecting system
- Frequent urinary tract infections
- Hydronephrosis
- Hydroureter
Afficher 6 traits supplémentaires
Abnormality of head or neck
- Oral mucosal blisters
- Surfer's eye
- Thin dental enamel
- Abnormality of lining of mouth
- Hair loss on scalp from scarring condition
- Decreased size of tooth
- Delayed eruption of teeth
- Dental cavities
Afficher 3 traits supplémentaires
Abnormality of the respiratory system
- Subglottic stenosis
- Breathing difficulty
- Inspiratory stridor
- Noisy breathing
- Abnormality of the upper respiratory tract
- Abnormality of the vocal cords
- Breathing difficulties
- Laryngeal stenosis
Afficher 2 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-17 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.18-e609d43e.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène LAMA3 : laminin subunit alpha 3. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/lama3
Dante Labs. Gène LAMA3 : laminin subunit alpha 3 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/lama3
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