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Gène

JMJD1C

jumonji domain containing 1C

Résumé

Localisation cytogénétique
10q21.3
Coordonnées
Chromosome 10 : 63 167 225–63 465 977 (GRCh38)
Exons
26 exons sur 298,8 kb
Protéine
2 540 acides aminés
Aussi appelé
DKFZp761F0118, KIAA1380, FLJ14374, KDM3C
Symboles précédents
TRIP8
Transcrit MANE Select
ENST00000399262.7NM_032776.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de JMJD1C

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 10, avec un crochet à l'emplacement de JMJD1C. JMJD1C et 3 gènes à proximité sur le chromosome 10, de 62 816 601 à 63 816 600.Chromosome 1010q21.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.363 Mb63,2 Mb63,4 Mb63,6 Mb63,8 MbEGR2 : 62 811 996–62 819 167, brin inverseEGR2NRBF2 : 63 133 247–63 156 880, brin directNRBF2JMJD1C : 63 167 225–63 465 977, brin inverseJMJD1CREEP3 : 63 521 331–63 625 128, brin directREEP3Schéma de JMJD1C : 26 exons sur le brin inverse du chromosome 10Exon 26 : 63 167 225–63 168 134, 910 basesExon 25 : 63 168 435–63 168 566, 132 basesExon 24 : 63 176 297–63 176 473, 177 basesExon 23 : 63 177 717–63 177 856, 140 basesExon 22 : 63 183 447–63 183 569, 123 basesExon 21 : 63 184 608–63 184 738, 131 basesExon 20 : 63 185 563–63 185 653, 91 basesExon 19 : 63 186 215–63 186 383, 169 basesExon 18 : 63 189 168–63 189 446, 279 basesExon 17 : 63 190 894–63 191 108, 215 basesExon 16 : 63 192 938–63 193 151, 214 basesExon 15 : 63 193 345–63 193 472, 128 basesExon 14 : 63 194 286–63 194 375, 90 basesExon 13 : 63 197 411–63 197 563, 153 basesExon 12 : 63 198 513–63 198 727, 215 basesExon 11 : 63 200 476–63 200 677, 202 basesExon 10 : 63 206 595–63 208 801, 2 207 basesExon 9 : 63 209 063–63 209 235, 173 basesExon 8 : 63 213 473–63 215 151, 1 679 basesExon 7 : 63 215 263–63 215 455, 193 basesExon 6 : 63 215 553–63 215 696, 144 basesExon 5 : 63 217 207–63 217 331, 125 basesExon 4 : 63 219 878–63 219 983, 106 basesExon 3 : 63 264 651–63 264 764, 114 basesExon 2 : 63 380 318–63 380 482, 165 basesExon 1 : 63 465 495–63 465 977, 483 bases26201015′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 8,8 kb sur les 298,8 kb du gène ; 7 623 de ces bases codent pour la protéine.

    Séquençage de JMJD1C

    1Faible

    Difficulté de séquençage de JMJD1C avec des lectures courtes, sur 100

    • Cartographiabilité0 %
    • Homologie0 %
    • Répétitions1,8 %
    • Teneur en GC9,7 %
    • Couverture de référence0 %

    Gènes liés aux mêmes affections

    Traits associés à JMJD1C

    L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que JMJD1C peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

    Liens externes

    D'où proviennent ces données

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-17 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène JMJD1C : jumonji domain containing 1C. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/jmjd1c

    Vancouver

    Dante Labs. Gène JMJD1C : jumonji domain containing 1C [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/jmjd1c

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