Gen
APC
APC regulator of Wnt signaling pathway
- HGNC 583↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000134982↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 324↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- 5q22.2
- Koordinaten
- Chromosom 5: 112.737.885–112.846.239 (GRCh38)
- Exons
- 16 Exons über 108,4 kb
- Protein
- 2.843 Aminosäuren
- Vererbung
- Autosomal-dominant
- Auch bekannt als
- DP2, DP3, DP2.5, PPP1R46
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000257430.9NM_000038.6
- Locus-Typ
- gene with protein product
ReferenzgenomGRCh38hg38
Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.
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Kolorektales Karzinom & Polyposis
- Magenadenokarzinom und proximale Polyposis des MagensAutosomal-dominant
Eine seltene erbliche Form von Magenkrebs, die durch eine proximale Magenpolyposis und ein erhöhtes Risiko für ein früh einsetzendes Adenokarzinom vom intestinalen Typ des Magenkorpus gekennzeichnet ist, ohne dass eine duodenale oder kolorektale Polyposis vorliegt. Dies ist ein Einzelfall (n-of-1), bei dem bisher nur ein einziger Patient oder eine Familie mit dieser Erkrankung beschrieben wurde.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 3 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
- Familiäre adenomatöse Polyposis (klassisch oder abgeschwächt)Autosomal-dominant
Hunderte bis Tausende kolorektale Adenome mit einem nahezu sicheren Risiko für ein kolorektales Karzinom ohne Behandlung; umfasst die APC-bedingte FAP sowie Polyposen im Zusammenhang mit MUTYH, NTHL1 und MSH3.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 4 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
- Auf der ACMG-Liste sekundärer Befunde
Vererbung
- Autosomal-dominant
- Eine veränderte Kopie von einem der beiden Elternteile reicht aus. Ein Elternteil, das eine solche Kopie hat, gibt sie mit einer Wahrscheinlichkeit von eins zu zwei an jedes Kind weiter.
Aufbau von APC
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Bekannte krankheitsverursachende Stellen
- Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
- Varianten mit Seite
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 10,7 kb der 108,4 kb des Gens aus; 8.532 dieser Basen kodieren für das Protein.
So liest ein Gentest APC
1.946
Positionen in APC, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft
Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.
Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 108,4 kb von APC, einschließlich der Introns, und nicht nur die 10,7 kb Exons.
Varianten mit Seite (721)
Die APC-Varianten mit Seite hier, zuerst die mit den meisten Review-Sternen. Jede Seite beschreibt den öffentlichen Eintrag von ClinVar zur Variante, niemals ein Ergebnis.
| Variante | Exon oder Intron | Position (GRCh38) | ClinVar-Klassifikation | Überprüfungsstatus |
|---|---|---|---|---|
| c.220+1G>A | Intron 3 | 112.766.411 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.220+2T>A | Intron 3 | 112.766.412 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.423-8A>G | Intron 4 | 112.775.621 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.423-9A>G | Intron 4 | 112.775.620 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.423-11A>G | Intron 4 | 112.775.618 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.471G>A | Exon 5 | 112.775.677 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.531+1_531+4del | Exon 5 | 112.775.737 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.531+5G>AIVS5+5G>A | Intron 5 | 112.775.742 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.531+5G>C | Intron 5 | 112.775.742 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.531+6T>C | Intron 5 | 112.775.743 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
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Mit APC verknüpfte Merkmale
Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die APC verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.
Abnormality of the digestive system
- Adenomatous colonic polyposis
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- Large intestinal polyposis
- Malabsorption
- Multiple gastric polyps
- Rectal polyposis
- Stomach tumor
- Adenocarcinoma of the colon
- Duodenal adenocarcinoma
- Intestinal obstruction
- Adenocarcinoma of the small intestine
- Bile duct cancer
- Biliary tract obstruction
- Cancer of the pancreas
- Gastrointestinal carcinoma
- Hepatoblastoma
- Neoplasm of the gallbladder
- Pancreatic adenocarcinoma
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- Stomach cancer
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- Short nose
- Short philtrum
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Abnormality of the integument
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- Papilloma
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Abnormality of the musculoskeletal system
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Abnormality of the endocrine system
- Thyroid nodule
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- Adrenocortical adenoma
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- Papillary thyroid carcinoma
- Thyroid adenoma
- Underactive thyroid
- Adrenocortical carcinoma
3 weitere Merkmale anzeigen
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the upper urinary tract
- Absent/small kidney
- Crossed fused renal ectopia
- Hydronephrosis
- Multiple kidney cysts
- Uterine leiomyoma
- Abnormality of the kidney
- Cancer starting in small tubes in kidneys
2 weitere Merkmale anzeigen
Abnormality of the eye
- Congenital hypertrophy of retinal pigment epithelium
- Abnormal retinal pigmentation
- Wide-set eyes
- Bulging eye
- Clouding of the lens of the eye
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc hypoplasia
1 weiteres Merkmal anzeigen
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Woher diese Angaben stammen
- HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
- MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
- Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
- ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
- Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
- Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). APC-Gen: APC regulator of Wnt signaling pathway. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/apc
Dante Labs. APC-Gen: APC regulator of Wnt signaling pathway [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/apc
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