Gen
APC
APC regulator of Wnt signaling pathway
- HGNC 583↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000134982↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 324↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 5q22.2
- Coördinaten
- Chromosoom 5: 112.737.885–112.846.239 (GRCh38)
- Exons
- 16 exons over 108,4 kb
- Eiwit
- 2.843 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- DP2, DP3, DP2.5, PPP1R46
- MANE Select-transcript
- ENST00000257430.9NM_000038.6
- Type locus
- gene with protein product
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees APC en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Darmkanker en polyposis
- Gastrisch adenocarcinoom en proximale polyposis van de maagAutosomaal dominant
Een zeldzame erfelijke maagkanker, gekenmerkt door proximale gastrische polyposis en een verhoogd risico op adenocarcinoom van het intestinale type in het maaglichaam op jonge leeftijd, zonder duodenale of colorectale polyposis. Dit is een n-van-1-geval, waarbij slechts één patiënt of familie met deze aandoening is beschreven.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Familiaire adenomateuze polyposis (klassiek of attenuatief)Autosomaal dominant
Honderden tot duizenden colorectale adenomen met zonder behandeling een vrijwel zekere kans op colorectaal carcinoom; omvat APC-gerelateerde FAP en polyposis gerelateerd aan MUTYH, NTHL1 en MSH3.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van APC
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 10,7 kb van de 108,4 kb van het gen; 8.532 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest APC leest
1.946
posities in APC waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 108,4 kb van APC, inclusief introns, en niet alleen de 10,7 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (721)
De APC-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|
| c.220+1G>A | Intron 3 | 112.766.411 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.220+2T>A | Intron 3 | 112.766.412 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.423-8A>G | Intron 4 | 112.775.621 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.423-9A>G | Intron 4 | 112.775.620 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.423-11A>G | Intron 4 | 112.775.618 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.471G>A | Exon 5 | 112.775.677 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.531+1_531+4del | Exon 5 | 112.775.737 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.531+5G>AIVS5+5G>A | Intron 5 | 112.775.742 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.531+5G>C | Intron 5 | 112.775.742 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.531+6T>C | Intron 5 | 112.775.743 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
Kenmerken gekoppeld aan APC
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die APC kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the digestive system
- Adenomatous colonic polyposis
- Fundic gland polyposis
- Abnormality of the abdominal wall
- Colon cancer
- Colorectal polyposis
- Duodenal polyposis
- Gastrointestinal desmoid tumor
- Gastrointestinal tract tumor
Toon 28 kenmerken meer
- Abdominal pain
- Constipation
- Diarrhea
- Gastric adenocarcinoma
- Growths in inner lining of intestine
- Large intestinal polyposis
- Malabsorption
- Multiple gastric polyps
- Rectal polyposis
- Stomach tumor
- Adenocarcinoma of the colon
- Duodenal adenocarcinoma
- Intestinal obstruction
- Adenocarcinoma of the small intestine
- Bile duct cancer
- Biliary tract obstruction
- Cancer of the pancreas
- Gastrointestinal carcinoma
- Hepatoblastoma
- Neoplasm of the gallbladder
- Pancreatic adenocarcinoma
- Pancreatic inflammation
- Stomach cancer
- Hepatocellular carcinoma
- Hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma
- Micronodular cirrhosis
- Small intestine carcinoid
- Subacute progressive viral hepatitis
Abnormality of head or neck
- Frontal bossing
- Abnormal dentition
- Abnormality of canine
- Big lower jaw
- Broad nasal tip
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Full upper lip
- High forehead
Toon 21 kenmerken meer
- High palate
- Long face
- Long philtrum
- Narrow mouth
- Relatively large head
- Abnormal cementum morphology
- Abnormal tooth enamel
- Beaked nose
- Dental cavities
- Everted eyelid
- Extra teeth
- Failure of development of between one and six teeth
- Failure of eruption of tooth
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Low hairline at back of neck
- Odontoma
- Short neck
- Short nose
- Short philtrum
- Zygomatic flattening
Abnormality of the integument
- Absent fingernail
- Firm lump under the skin
- Absent toenail
- Early balding
- Epidermoid cyst
- Abnormal fingerprints
- Papilloma
- Skin cancer
Toon 4 kenmerken meer
Abnormality of the musculoskeletal system
- Fusion of joints
- Muscular abnormality
- Osteoma
- Abnormal vertebral body morphology
- Abnormality of the ribs
- Breakdown of bone
- Generalized decreased muscle tone
- Limitation of joint mobility
Toon 4 kenmerken meer
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the upper urinary tract
- Absent/small kidney
- Crossed fused renal ectopia
- Hydronephrosis
- Multiple kidney cysts
- Uterine leiomyoma
- Abnormality of the kidney
- Cancer starting in small tubes in kidneys
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of the eye
- Congenital hypertrophy of retinal pigment epithelium
- Abnormal retinal pigmentation
- Wide-set eyes
- Bulging eye
- Clouding of the lens of the eye
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc hypoplasia
Toon 1 kenmerk meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). APC-gen: APC regulator of Wnt signaling pathway. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/apc
Dante Labs. APC-gen: APC regulator of Wnt signaling pathway [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/apc
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken