Gen
APC
APC regulator of Wnt signaling pathway
- HGNC 583↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000134982↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 324↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 5q22.2
- Współrzędne
- Chromosom 5: 112 737 885–112 846 239 (GRCh38)
- Eksony
- 16 eksonów na odcinku 108,4 kb
- Białko
- 2843 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Znany również jako
- DP2, DP3, DP2.5, PPP1R46
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000257430.9NM_000038.6
- Typ locus
- gene with protein product
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj APC oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Rak jelita grubego i polipowatość
- Gruczolakorak żołądka i polipowatość bliższej części żołądkaAutosomalne dominujące
Rzadki dziedziczny rak żołądka charakteryzujący się polipowatością bliższej części żołądka oraz zwiększonym ryzykiem wczesnego wystąpienia gruczolakoraka typu jelitowego trzonu żołądka, bez polipowatości dwunastnicy lub jelita grubego. Jest to przypadek jednostkowy (n-of-1), w którym opisano tylko jednego pacjenta lub jedną rodzinę z tym zaburzeniem.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Rodzinna polipowatość gruczolakowata (postać klasyczna lub atenuowana)Autosomalne dominujące
Setki do tysięcy gruczolaków jelita grubego z niemal pewnym ryzykiem raka jelita grubego bez leczenia; obejmuje polipowatość związaną z APC oraz polipowatość związaną z MUTYH, NTHL1 i MSH3.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
Budowa genu APC
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 10,7 kb z 108,4 kb genu; 8532 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje APC
1946
pozycje w APC, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 108,4 kb genu APC, łącznie z intronami, a nie tylko 10,7 kb eksonów.
Warianty z podstroną (721)
Warianty APC z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|
| c.220+1G>A | Intron 3 | 112 766 411 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.220+2T>A | Intron 3 | 112 766 412 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.423-8A>G | Intron 4 | 112 775 621 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.423-9A>G | Intron 4 | 112 775 620 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.423-11A>G | Intron 4 | 112 775 618 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.471G>A | Ekson 5 | 112 775 677 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.531+1_531+4del | Ekson 5 | 112 775 737 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.531+5G>AIVS5+5G>A | Intron 5 | 112 775 742 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.531+5G>C | Intron 5 | 112 775 742 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.531+6T>C | Intron 5 | 112 775 743 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
Cechy powiązane z genem APC
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać APC. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the digestive system
- Adenomatous colonic polyposis
- Fundic gland polyposis
- Abnormality of the abdominal wall
- Colon cancer
- Colorectal polyposis
- Duodenal polyposis
- Gastrointestinal desmoid tumor
- Gastrointestinal tract tumor
Pokaż jeszcze 28 cech
- Abdominal pain
- Constipation
- Diarrhea
- Gastric adenocarcinoma
- Growths in inner lining of intestine
- Large intestinal polyposis
- Malabsorption
- Multiple gastric polyps
- Rectal polyposis
- Stomach tumor
- Adenocarcinoma of the colon
- Duodenal adenocarcinoma
- Intestinal obstruction
- Adenocarcinoma of the small intestine
- Bile duct cancer
- Biliary tract obstruction
- Cancer of the pancreas
- Gastrointestinal carcinoma
- Hepatoblastoma
- Neoplasm of the gallbladder
- Pancreatic adenocarcinoma
- Pancreatic inflammation
- Stomach cancer
- Hepatocellular carcinoma
- Hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma
- Micronodular cirrhosis
- Small intestine carcinoid
- Subacute progressive viral hepatitis
Abnormality of head or neck
- Frontal bossing
- Abnormal dentition
- Abnormality of canine
- Big lower jaw
- Broad nasal tip
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Full upper lip
- High forehead
Pokaż jeszcze 21 cech
- High palate
- Long face
- Long philtrum
- Narrow mouth
- Relatively large head
- Abnormal cementum morphology
- Abnormal tooth enamel
- Beaked nose
- Dental cavities
- Everted eyelid
- Extra teeth
- Failure of development of between one and six teeth
- Failure of eruption of tooth
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Low hairline at back of neck
- Odontoma
- Short neck
- Short nose
- Short philtrum
- Zygomatic flattening
Abnormality of the integument
- Absent fingernail
- Firm lump under the skin
- Absent toenail
- Early balding
- Epidermoid cyst
- Abnormal fingerprints
- Papilloma
- Skin cancer
Pokaż jeszcze 4 cech
Abnormality of the musculoskeletal system
- Fusion of joints
- Muscular abnormality
- Osteoma
- Abnormal vertebral body morphology
- Abnormality of the ribs
- Breakdown of bone
- Generalized decreased muscle tone
- Limitation of joint mobility
Pokaż jeszcze 4 cech
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the upper urinary tract
- Absent/small kidney
- Crossed fused renal ectopia
- Hydronephrosis
- Multiple kidney cysts
- Uterine leiomyoma
- Abnormality of the kidney
- Cancer starting in small tubes in kidneys
Pokaż jeszcze 2 cech
Abnormality of the eye
- Congenital hypertrophy of retinal pigment epithelium
- Abnormal retinal pigmentation
- Wide-set eyes
- Bulging eye
- Clouding of the lens of the eye
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc hypoplasia
Pokaż jeszcze 1 cechę
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen APC: APC regulator of Wnt signaling pathway. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/apc
Dante Labs. Gen APC: APC regulator of Wnt signaling pathway [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/apc
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni