Gen
AP1S2
adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2
- HGNC 560↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000182287↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 8905↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- Xp22.2
- Koordinater
- Kromosom X: 15.825.806–15.854.813 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner fordelt over 29 kb
- Protein
- 160 aminosyrer
- Også kendt som
- SIGMA1B
- Tidligere symboler
- MRX59, MRXS5, PGS
- MANE Select-transkript
- ENST00000672987.1NM_001272071.2
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs AP1S2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Intellektuel funktionsnedsættelse
Et af 233 gener, der er knyttet til det
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er AP1S2 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 2,1 kb af genets 29 kb; 483 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest AP1S2
12
positioner i AP1S2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
4 af dem (33 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Low mappability (4 steder)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalyse dækker alle 29 kb af AP1S2, inklusive introner, og ikke kun de 2,1 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 sygdom
- ADKadenosine kinaseDeler 1 sygdom
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 sygdom
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 sygdom
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 sygdom
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 sygdom
- ANK3ankyrin 3Deler 1 sygdom
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 sygdom
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 sygdom
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 sygdom
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 sygdom
- ARID1BAT-rich interaction domain 1BDeler 1 sygdom
Træk knyttet til AP1S2
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, AP1S2 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Abnormal gait
- Absent/small cerebellum
- Aggressive behavior
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- IQ between 34 and 49
- IQ less than 20
- Poor speech
Vis 18 træk mere
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
- Absent speech development
- Aqueductal stenosis
- Autism spectrum disorder
- Delayed ability to walk
- EEG abnormality
- Abnormality of the cerebellum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Delayed speech and language development
- Intellectual disability, mild
- Stereotypical hand wringing
- Choreoathetosis
- Epilepsy
- Inability to coordinate movements when walking
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- Self-injurious behavior
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). AP1S2-genet: adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/ap1s2
Dante Labs. AP1S2-genet: adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/ap1s2
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger