Gen
SAMHD1
SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1
- HGNC 15925↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000101347↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 25939↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 20q11.23
- Souřadnice
- Chromozom 20: 36 890 229–36 951 708 (GRCh38)
- Exony
- 16 exonů na 61,5 kb
- Protein
- 626 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní Autozomálně recesivní
- Další názvy
- SBBI88, Mg11, HDDC1, MOP-5, AGS5
- Transkript MANE Select
- ENST00000646673.2NM_015474.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SAMHD1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Aicardi-Goutieres Syndrome
- SAMHD1-related type 1 interferonopathyAutozomálně recesivní
SAMHD1 variants causing Aicardi-Goutieres syndrome, sometimes with cerebral vasculopathy.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 7 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Autozomálně recesivní
Aicardi-Goutieres syndrome (AGS) is an inherited, subacute encephalopathy characterized by the association of basal ganglia calcification, leukodystrophy and cerebrospinal fluid (CSF) lymphocytosis.
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Moyamoya Disease
Progressive narrowing of the arteries at the base of the brain, linked to changes in RNF213 (a susceptibility gene with reduced penetrance, especially common in East Asian populations), ACTA2 or GUCY1A1, which can cause strokes or mini-strokes.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing about it supports early assessment of symptoms such as transient weakness, and access to specialist stroke prevention and surgical treatment.
Rare Monogenic Autoinflammatory Diseases
- PTPN2-related autoinflammation and autoimmunityAutozomálně dominantní
Early-onset inflammatory and autoimmune disease, including colitis and arthritis, caused by variants in PTPN2.
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
Jeden z 114 genů spojených s touto vazbou
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Other Inherited Leukodystrophies
- Leukodystrophy (other and unspecified types)
Jeden z 80 genů spojených s touto vazbou
Inherited conditions that damage or prevent the normal formation of myelin, the white matter of the brain and spinal cord. Different types follow autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance depending on the gene involved.
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing the specific genetic cause can end a diagnostic search, guide supportive care and surveillance, show whether a specific treatment exists, and allow testing of relatives.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je SAMHD1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,6 kb z 61,5 kb genu; 1 881 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SAMHD1
122
pozic v genu SAMHD1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 61,5 kb genu SAMHD1, včetně intronů, nikoli jen 4,6 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ADARadenosine deaminase RNA specificSdílí 4 onemocnění
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Sdílí 4 onemocnění
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ASdílí 4 onemocnění
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BSdílí 4 onemocnění
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CSdílí 4 onemocnění
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Sdílí 4 onemocnění
- TREX1three prime repair exonuclease 1Sdílí 4 onemocnění
- SKIC2SKI2 subunit of superkiller complexSdílí 2 onemocnění
- SKIC3SKI3 subunit of superkiller complexSdílí 2 onemocnění
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialSdílí 1 onemocnění
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SAMHD1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SAMHD1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Leukodystrophy
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
Zobrazit ještě 18 rysů
- Brain degeneration
- Chronic CSF lymphocytosis
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Deep white matter hypodensities
- Leukoencephalopathy
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SAMHD1: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/samhd1
Dante Labs. Gen SAMHD1: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/samhd1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů