Gen
SAMHD1
SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1
- HGNC 15925↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000101347↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 25939↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 20q11.23
- Koordinater
- Kromosom 20: 36.890.229–36.951.708 (GRCh38)
- Exoner
- 16 exoner fordelt over 61,5 kb
- Protein
- 626 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant Autosomal recessiv
- Også kendt som
- SBBI88, Mg11, HDDC1, MOP-5, AGS5
- MANE Select-transkript
- ENST00000646673.2NM_015474.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs SAMHD1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Aicardi-Goutieres syndrom
- SAMHD1-relateret type 1-interferonopatiAutosomal recessiv
SAMHD1-varianter, der forårsager Aicardi-Goutières syndrom, nogle gange med cerebral vaskulopati.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 7 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Autosomal recessiv
Aicardi-Goutieres syndrom (AGS) er en arvelig, subakut encefalopati, kendetegnet ved en kombination af forkalkning i basalganglierne, leukodystrofi og lymfocytose i cerebrospinalvæsken (CSF).
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Moyamoya-sygdom
Gradvis indsnævring af arterierne ved hjernens basis, knyttet til ændringer i RNF213 (et dispositionsgen med nedsat penetrans, særligt almindeligt i østasiatiske befolkninger), ACTA2 eller GUCY1A1, som kan forårsage apopleksi eller små blodpropper i hjernen.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
At kende til den hjælper med at vurdere symptomer såsom forbigående svaghed tidligt og giver adgang til specialiseret forebyggelse af apopleksi og kirurgisk behandling.
Sjældne monogene autoinflammatoriske sygdomme
- PTPN2-relateret autoinflammation og autoimmunitetAutosomal dominant
Inflammatorisk og autoimmun sygdom med debut tidligt i livet, herunder colitis og artritis, forårsaget af varianter i PTPN2.
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsvigt
- Medfødt immundefekt
Et af 114 gener, der er knyttet til det
Arvelige sygdomme i immunsystemet, forårsaget af ændringer i enkelte gener, som påvirker kroppens evne til at bekæmpe infektioner eller regulere inflammation.
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Andre arvelige leukodystrofier
- Leukodystrofi (andre og uspecificerede typer)
Et af 80 gener, der er knyttet til det
Arvelige tilstande, der beskadiger eller forhindrer den normale dannelse af myelin, hjernens og rygmarvens hvide substans. De forskellige typer følger autosomal recessiv, autosomal dominant eller X-bundet arvegang, afhængigt af det involverede gen.
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Kendskab til den specifikke genetiske årsag kan afslutte en diagnostisk søgen, vejlede understøttende behandling og opfølgning, vise, om en specifik behandling findes, og gøre det muligt at teste slægtninge.
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
- Autosomal recessiv
- Det kræver en ændret kopi fra hver forælder. Med én er man bærer og som regel upåvirket; når begge forældre er bærere, har hvert barn en chance på en ud af fire for at arve to.
Sådan er SAMHD1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4,6 kb af genets 61,5 kb; 1.881 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest SAMHD1
122
positioner i SAMHD1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 61,5 kb af SAMHD1, inklusive introner, og ikke kun de 4,6 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeler 4 sygdomme
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Deler 4 sygdomme
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ADeler 4 sygdomme
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BDeler 4 sygdomme
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CDeler 4 sygdomme
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Deler 4 sygdomme
- TREX1three prime repair exonuclease 1Deler 4 sygdomme
- SKIC2SKI2 subunit of superkiller complexDeler 2 sygdomme
- SKIC3SKI3 subunit of superkiller complexDeler 2 sygdomme
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deler 1 sygdom
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeler 1 sygdom
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deler 1 sygdom
Træk knyttet til SAMHD1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SAMHD1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Leukodystrophy
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
Vis 18 træk mere
- Brain degeneration
- Chronic CSF lymphocytosis
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Deep white matter hypodensities
- Leukoencephalopathy
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SAMHD1-genet: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/samhd1
Dante Labs. SAMHD1-genet: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/samhd1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger