Gen
SAMHD1
SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1
- HGNC 15925↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000101347↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 25939↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 20q11.23
- Coördinaten
- Chromosoom 20: 36.890.229–36.951.708 (GRCh38)
- Exons
- 16 exons over 61,5 kb
- Eiwit
- 626 aminozuren
- Ook bekend als
- SBBI88, Mg11, HDDC1, MOP-5, AGS5
- MANE Select-transcript
- ENST00000646673.2NM_015474.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/samhd1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SAMHD1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Aicardi-Goutières-syndroom
- SAMHD1-gerelateerde type 1-interferonopathieAutosomaal recessief
SAMHD1-varianten die het Aicardi-Goutières-syndroom veroorzaken, soms met cerebrale vasculopathie.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 7 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Autosomaal recessief
Het Aicardi-Goutières-syndroom (AGS) is een erfelijke, subacute encefalopathie die wordt gekenmerkt door een combinatie van verkalking in de basale ganglia, leukodystrofie en lymfocytose in de liquor cerebrospinalis (CSF).
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Moyamoya-ziekte
Progressieve vernauwing van de slagaders aan de basis van de hersenen, in verband gebracht met veranderingen in RNF213 (een aanlegggen met verminderde penetrantie, die vooral vaak voorkomt bij bevolkingsgroepen uit Oost-Azië), ACTA2 of GUCY1A1, die beroertes of mini-beroertes kunnen veroorzaken.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Als u hiervan op de hoogte bent, kunt u tijdig laten onderzoeken of u klachten heeft zoals tijdelijke zwakte, en heeft u toegang tot gespecialiseerde beroertepreventie en chirurgische behandeling.
Zeldzame monogene auto-inflammatoire ziekten
- Auto-inflammatie en auto-immuniteit gerelateerd aan PTPN2Autosomaal dominant
Vroeg begonnen inflammatoire en auto-immuunziekte, waaronder colitis en artritis, veroorzaakt door varianten in PTPN2.
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Bredere groeperingen
Overige aangeboren immuunstoornissen
- Aangeboren immuundeficiëntie
Een van 114 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen van het immuunsysteem die worden veroorzaakt door veranderingen in één gen en die invloed hebben op hoe het lichaam infecties bestrijdt of ontstekingen reguleert.
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Overige erfelijke leukodystrofieën
- Leukodystrofie (overige en niet-gespecificeerde typen)
Een van 80 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen die de vorming van myeline, de witte stof van de hersenen en het ruggenmerg, beschadigen of normale vorming verhinderen. Afhankelijk van het betrokken gen volgen de verschillende typen autosomaal recessieve, autosomaal dominante of X-gebonden overerving.
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het kennen van de specifieke genetische oorzaak kan een diagnostisch zoektraject beëindigen, de ondersteunende zorg en controles sturen, laten zien of een specifieke behandeling bestaat, en het mogelijk maken familieleden te testen.
Opbouw van SAMHD1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 4,6 kb van de 61,5 kb van het gen; 1.881 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SAMHD1
122
posities in SAMHD1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 61,5 kb van SAMHD1, inclusief intronen, en niet alleen de 4,6 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeelt 4 aandoeningen
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Deelt 4 aandoeningen
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ADeelt 4 aandoeningen
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BDeelt 4 aandoeningen
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CDeelt 4 aandoeningen
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Deelt 4 aandoeningen
- TREX1three prime repair exonuclease 1Deelt 4 aandoeningen
- SKIC2SKI2 subunit of superkiller complexDeelt 2 aandoeningen
- SKIC3SKI3 subunit of superkiller complexDeelt 2 aandoeningen
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deelt 1 aandoening
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeelt 1 aandoening
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SAMHD1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SAMHD1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Leukodystrophy
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
Toon 18 kenmerken meer
- Brain degeneration
- Chronic CSF lymphocytosis
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Deep white matter hypodensities
- Leukoencephalopathy
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SAMHD1-gen: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/samhd1
Dante Labs. SAMHD1-gen: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/samhd1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken