Gen
POMT2
protein O-mannosyltransferase 2
- HGNC 19743↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000009830↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 29954↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 14q24.3
- Koordinater
- Kromosom 14: 77 274 956–77 320 883 (GRCh38)
- Exoner
- 21 exoner på 45,9 kb
- Protein
- 750 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- LGMD2N
- MANE Select-transkript
- ENST00000261534.9NM_013382.7
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs POMT2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Medfödda muskeldystrofier
- Medfödd muskeldystrofi
En grupp muskeldystrofier med debut vid födseln eller under spädbarnsåldern, inklusive dystroglykanopatier (såsom former relaterade till FKRP, FKTN och POMT1/2).
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Medfødda glykosyleringsrubbningar
- Alfa-dystroglykanopatierAutosomalt recessiv
Muskelsjukdomar orsakade av felaktig sockerfästning (O-mannosylering) till alfa-dystroglykan, från svår medfödd muskeldystrofi med påverkan på hjärna och ögon till mildare svaghet i bälte- och extremitetsmuskulatur; behandlas också mer ingående i rapporten om medfödda muskeldystrofier.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- Medfödda glykosyleringsrubbningar (CDG)
En av 98 gener kopplade till den
En stor grupp ärftliga tillstånd där sockerkedjor (glykaner) inte byggs eller fästs korrekt på proteiner och lipider, ofta med påverkan på hjärnan, levern, blodkoagulationen, tillväxten och många andra organsystem. De flesta är autosomalt recessiva, men vissa är X-bundna eller autosomalt dominanta.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är POMT2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,9 kb av genens 45,9 kb, och 2 253 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest POMT2
132
positioner i POMT2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 45,9 kb av POMT2, med introner inräknade, inte bara de 4,9 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase ADelar 3 tillstånd
- DAG1dystroglycan 1Delar 3 tillstånd
- FKRPfukutin related proteinDelar 3 tillstånd
- FKTNfukutinDelar 3 tillstånd
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDelar 3 tillstånd
- POMT1protein O-mannosyltransferase 1Delar 3 tillstånd
- DPM2dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatoryDelar 2 tillstånd
- DPM3dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatoryDelar 2 tillstånd
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Delar 2 tillstånd
- POMGNT2protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-)Delar 2 tillstånd
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Delar 1 tillstånd
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till POMT2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som POMT2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Agyria
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Intellectual disability, severe
Visa ytterligare 57 egenskaper
- Small brainstem
- Small cerebellum
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Type II lissencephaly
- Abnormal cerebellar vermis morphology
- Abnormal cortical gyration
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of neuronal migration
- Absent reflexes
- Cognitive impairment
- Decreased reflex response
- EEG abnormality
- Fewer and broader ridges in brain
- Fewer or absent grooves in brain
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Specific learning disability
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal shape of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of movement
- Abnormality of the cerebellum
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Delayed motor skills
- Diffuse white matter abnormalities
- Dilated fourth ventricle
- Gray matter heterotopia
- Kinked brainstem
- Motor delay
- Partial absence of cerebellar vermis
- Poor gross motor coordination
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pons morphology
- Abnormality of the nervous system
- Absent/small cerebellum
- Cerebellar cyst
- Clonus
- Decreased thalamic volume
- Diminished deep tendon reflex
- Frontal cortical atrophy
- Fusion of the cerebellar hemispheres
- Holoprosencephaly
- Hypoplasia of the pons
- Increased reflexes
- Intellectual disability, mild
- Loss of ability to walk
- Meningocele
- Olivopontocerebellar hypoplasia
- Paralysis or weakness of one side of body
- Poor speech
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Cerebellar dysplasia
- Excessive daytime sleepiness
- IQ less than 20
Abnormality of the musculoskeletal system
- Generalized muscle weakness
- Increased skeletal muscle cells
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Low muscle tone
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Muscular dystrophy
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Absent/small skeletal muscles
Visa ytterligare 25 egenskaper
- Decreased muscle tone in infant
- EMG abnormality
- Hypoglycosylation of alpha-dystroglycan
- Muscle degeneration
- Muscle tissue disease
- Muscle weakness
- Reduced muscle fiber alpha dystroglycan
- Difficulty walking up stairs
- Excessive inward curvature of lower spine
- Fatigable weakness of skeletal muscles
- Multiple joint contractures
- Spasticity and rigidity of muscles
- Wasting of muscles near the body
- Abnormality of connective tissue
- Axial muscle weakness
- Limited neck movement
- Neuropathic spinal arthropathy
- Scapuloperoneal amyotrophy
- Scoliosis
- Congenital contracture
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized decreased muscle tone
- Prominent swayback
- Reduced spine movement
- Severely decreased muscle tone
Abnormality of the eye
- Abnormally small eyeball
- Clouding of the lens of the eye
- Corneal opacity
- Retinal dysplasia
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Chorioretinal dysplasia
- Close sighted
- Cross-eyed
Visa ytterligare 20 egenskaper
- Glaucoma
- Optic atrophy
- Optic nerve issue
- Retinal detachment
- Visual impairment
- Absence of eyeballs
- Enlarged eyeball
- Persistent pupillary membrane
- Peters anomaly
- Abnormality of the eye
- Abnormality of the iris
- Cat eye
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Enlarged cornea
- Notched pupil
- Optic nerve hypoplasia
- Pigmentary retinopathy
- Blindness
- Farsightedness
- Retinal atrophy
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). POMT2-genen: protein O-mannosyltransferase 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/pomt2
Dante Labs. POMT2-genen: protein O-mannosyltransferase 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/pomt2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor