Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

VIPAS39

VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog

Sammanfattning

Cytogenetisk position
14q24.3
Koordinater
Kromosom 14: 77 426 675–77 457 601 (GRCh38)
Exoner
20 exoner på 30,9 kb
Protein
493 aminosyror
Även känd som
VIPAR, VPS16B, SPE-39, SPE39, hSPE-39
Tidigare symboler
C14orf133
MANE Select-transkript
ENST00000557658.6NM_001193315.2
Lokustyp
Protein-coding
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser VIPAS39 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är VIPAS39 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 14, med en parentes där VIPAS39 finns. VIPAS39 och 18 gener i närheten på kromosom 14, från 76 942 138 till 77 942 137.Kromosom 1414q24.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3377 Mb77,2 Mb77,4 Mb77,6 Mb77,8 MbIRF2BPL: 77 024 543–77 028 708, bakåt-strängIRF2BPLCIPC: 77 098 126–77 117 287, framåt-strängCIPC: 77 098 311–77 225 462, framåt-strängTMEM63C: 77 116 568–77 259 498, framåt-strängTMEM63CZDHHC22: 77 131 266–77 143 032, bakåt-strängZDHHC22NGB: 77 265 483–77 271 211, bakåt-strängNGBPOMT2: 77 274 956–77 320 898, bakåt-strängPOMT2GSTZ1: 77 320 996–77 344 021, framåt-strängGSTZ1TMED8: 77 335 024–77 377 348, bakåt-strängTMED8SAMD15: 77 376 689–77 392 372, framåt-strängSAMD15NOXRED1: 77 394 021–77 423 523, bakåt-strängNOXRED1VIPAS39: 77 426 675–77 457 601, bakåt-strängVIPAS39AHSA1: 77 457 743–77 469 482, framåt-strängAHSA1ISM2: 77 474 394–77 499 408, bakåt-strängISM2SPTLC2: 77 505 997–77 616 781, bakåt-strängSPTLC2ALKBH1: 77 672 401–77 708 038, bakåt-strängALKBH1SLIRP: 77 708 045–77 761 104, framåt-strängSLIRPSNW1: 77 709 019–77 761 207, bakåt-strängSNW1ADCK1: 77 800 059–77 937 188, framåt-strängADCK1Diagram över VIPAS39: 20 exoner på bakåt-strängen av kromosom 14Exon 14: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 12: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 10: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 9: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 7: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 3: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 20: 77 426 675–77 427 636, 962 baserExon 19: 77 428 370–77 428 474, 105 baserExon 18: 77 429 006–77 429 095, 90 baserExon 17: 77 429 681–77 429 767, 87 baserExon 16: 77 433 842–77 433 931, 90 baserExon 15: 77 434 262–77 434 303, 42 baserExon 14: 77 435 259–77 435 393, 135 baserExon 13: 77 435 844–77 435 919, 76 baserExon 12: 77 437 808–77 437 881, 74 baserExon 11: 77 441 066–77 441 093, 28 baserExon 10: 77 442 560–77 442 662, 103 baserExon 9: 77 443 119–77 443 152, 34 baserExon 8: 77 444 249–77 444 341, 93 baserExon 7: 77 448 494–77 448 550, 57 baserExon 6: 77 449 293–77 449 357, 65 baserExon 5: 77 449 714–77 449 752, 39 baserExon 4: 77 451 187–77 451 333, 147 baserExon 3: 77 453 299–77 453 401, 103 baserExon 2: 77 454 010–77 454 102, 93 baserExon 1: 77 457 495–77 457 601, 107 baser201816141210864215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 2,5 kb av genens 30,9 kb, och 1 482 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av VIPAS39

11

positioner i VIPAS39 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.

En helgenomsekvensering täcker alla 30,9 kb av VIPAS39, inklusive introner, och inte bara de 2,5 kb exoner.

Egenskaper kopplade till VIPAS39

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som VIPAS39 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). VIPAS39-genen: VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/vipas39

Vancouver

Dante Labs. VIPAS39-genen: VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/vipas39

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test