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Gène

TNXB

tenascin XB

Résumé

Localisation cytogénétique
6p21.33-p21.32
Coordonnées
Chromosome 6 : 32 041 153–32 109 338 (GRCh38)
Exons
44 exons sur 68,2 kb
Protéine
4 244 acides aminés
Aussi appelé
TNXBS, XBS, XB, HXBL, TN-X, TNX
Symboles précédents
TNXB1, TNXB2
Transcrit MANE Select
ENST00000644971.2NM_001365276.2
Type de locus
Protein-coding

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Structure de TNXB

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de TNXB. TNXB et 64 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 31 575 246 à 32 575 245.Chromosome 66p21.33-p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 Mb32,4 MbTNF : 31 575 558–31 578 336, brin directLTB : 31 580 525–31 582 522, brin inverseLST1 : 31 581 065–31 588 911, brin directLST1NCR3 : 31 588 895–31 593 217, brin inverseNCR3AIF1 : 31 615 214–31 617 025, brin directAIF1PRRC2A : 31 620 675–31 637 771, brin directPRRC2A : 31 622 774–31 622 860, brin direct : 31 623 874–31 625 499, brin directBAG6 : 31 638 543–31 652 747, brin inverseAPOM : 31 652 416–31 658 214, brin directC6orf47 : 31 658 298–31 660 778, brin inverseGPANK1 : 31 661 228–31 666 283, brin inverseCSNK2B : 31 665 227–31 670 343, brin direct : 31 666 102–31 673 546, brin directLY6G5B : 31 669 976–31 673 776, brin directLY6G5C : 31 676 684–31 684 040, brin inverseLY6G5CABHD16A : 31 686 954–31 703 391, brin inverseLY6G6F : 31 706 863–31 710 801, brin directLY6G6F-LY6G6D : 31 706 904–31 717 918, brin directLY6G6D : 31 715 285–31 717 919, brin directLY6G6DMPIG6B : 31 718 594–31 726 714, brin directLY6G6C : 31 718 648–31 721 746, brin inverseDDAH2 : 31 726 586–31 730 617, brin inverseCLIC1 : 31 730 579–31 740 558, brin inverseMSH5 : 31 739 677–31 762 678, brin directMSH5MSH5-SAPCD1 : 31 740 020–31 764 851, brin directSAPCD1 : 31 762 656–31 764 851, brin directVWA7 : 31 765 590–31 777 328, brin inverseVWA7VARS1 : 31 777 518–31 795 975, brin inverseLSM2 : 31 797 019–31 806 992, brin inverseLSM2HSPA1L : 31 809 619–31 815 788, brin inverseHSPA1A : 31 815 543–31 817 994, brin directHSPA1AHSPA1B : 31 827 738–31 830 254, brin directHSPA1BNEU1 : 31 857 063–31 862 905, brin inverseNEU1SLC44A4 : 31 863 173–31 879 198, brin inverseSLC44A4EHMT2 : 31 879 758–31 897 723, brin inverseEHMT2C2 : 31 897 785–31 945 677, brin directC2ZBTB12 : 31 899 065–31 902 103, brin inverseZBTB12 : 31 927 698–31 952 048, brin directCFB : 31 945 650–31 952 086, brin directNELFE : 31 952 087–31 959 079, brin inverseSKIC2 : 31 959 025–31 969 852, brin directSKIC2DXO : 31 969 810–31 972 517, brin inverseDXOWHR1 : 31 971 091–31 982 821, brin directWHR1C4A : 31 981 991–32 005 247, brin directC4AC4B : 32 014 725–32 035 975, brin directC4BCYP21A2 : 32 038 297–32 042 321, brin directCYP21A2TNXB : 32 041 153–32 109 338, brin inverseTNXBATF6B : 32 115 264–32 128 255, brin inverseATF6BFKBPL : 32 128 697–32 131 070, brin inverseFKBPLPPT2 : 32 146 580–32 163 679, brin directPRRT1 : 32 147 292–32 153 083, brin inversePRRT1 : 32 150 495–32 154 373, brin inversePPT2-EGFL8 : 32 153 845–32 171 978, brin directEGFL8 : 32 163 918–32 171 980, brin directAGPAT1 : 32 167 118–32 178 112, brin inverseRNF5 : 32 178 391–32 184 769, brin directAGER : 32 180 963–32 184 365, brin inversePBX2 : 32 184 733–32 190 278, brin inverseGPSM3 : 32 190 766–32 195 523, brin inverseNOTCH4 : 32 194 843–32 224 111, brin inverseNOTCH4TSBP1 : 32 288 526–32 371 907, brin inverseTSBP1BTNL2 : 32 391 481–32 407 181, brin inverseBTNL2HLA-DRA : 32 439 870–32 445 181, brin directHLA-DRAHLA-DRB5 : 32 516 622–32 530 369, brin inverseHLA-DRB5Schéma de TNXB : 44 exons sur le brin inverse du chromosome 6Exon 43 : 1 site connu associé à une maladieExon 42 : 1 site connu associé à une maladieExon 41 : 1 site connu associé à une maladieExon 40 : 1 site connu associé à une maladieExon 36 : 1 site connu associé à une maladieExon 35 : 1 site connu associé à une maladieExon 33 : 1 site connu associé à une maladieExon 32 : 3 sites connus associés à une maladieExon 31 : 11 sites connus associés à une maladieExon 30 : 6 sites connus associés à une maladieExon 29 : 10 sites connus associés à une maladieExon 28 : 9 sites connus associés à une maladieExon 27 : 4 sites connus associés à une maladieExon 26 : 9 sites connus associés à une maladieExon 25 : 6 sites connus associés à une maladieExon 24 : 11 sites connus associés à une maladieExon 23 : 12 sites connus associés à une maladieExon 22 : 2 sites connus associés à une maladieExon 21 : 1 site connu associé à une maladieExon 20 : 4 sites connus associés à une maladieExon 19 : 6 sites connus associés à une maladieExon 18 : 8 sites connus associés à une maladieExon 17 : 4 sites connus associés à une maladieExon 16 : 6 sites connus associés à une maladieExon 15 : 5 sites connus associés à une maladieExon 14 : 5 sites connus associés à une maladieExon 13 : 10 sites connus associés à une maladieExon 12 : 4 sites connus associés à une maladieExon 11 : 8 sites connus associés à une maladieExon 10 : 11 sites connus associés à une maladieExon 9 : 6 sites connus associés à une maladieExon 8 : 11 sites connus associés à une maladieExon 7 : 8 sites connus associés à une maladieExon 6 : 5 sites connus associés à une maladieExon 5 : 7 sites connus associés à une maladieExon 4 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 50 sites connus associés à une maladieExon 2 : 6 sites connus associés à une maladieExon 44 : 32 041 153–32 041 450, 298 basesExon 43 : 32 041 771–32 041 934, 164 basesExon 42 : 32 042 012–32 042 173, 162 basesExon 41 : 32 042 266–32 042 362, 97 basesExon 40 : 32 042 455–32 042 606, 152 basesExon 39 : 32 042 699–32 042 831, 133 basesExon 38 : 32 042 951–32 043 081, 131 basesExon 37 : 32 043 175–32 043 318, 144 basesExon 36 : 32 043 437–32 043 556, 120 basesExon 35 : 32 043 749–32 043 892, 144 basesExon 34 : 32 044 007–32 044 129, 123 basesExon 33 : 32 044 381–32 044 716, 336 basesExon 32 : 32 045 006–32 045 326, 321 basesExon 31 : 32 046 175–32 046 456, 282 basesExon 30 : 32 047 734–32 048 012, 279 basesExon 29 : 32 048 363–32 048 650, 288 basesExon 28 : 32 049 270–32 049 587, 318 basesExon 27 : 32 049 998–32 050 321, 324 basesExon 26 : 32 052 670–32 052 993, 324 basesExon 25 : 32 053 388–32 053 711, 324 basesExon 24 : 32 055 851–32 056 174, 324 basesExon 23 : 32 056 586–32 056 903, 318 basesExon 22 : 32 058 058–32 058 390, 333 basesExon 21 : 32 061 397–32 061 720, 324 basesExon 20 : 32 062 157–32 062 483, 327 basesExon 19 : 32 064 821–32 065 117, 297 basesExon 18 : 32 067 661–32 067 984, 324 basesExon 17 : 32 068 390–32 068 707, 318 basesExon 16 : 32 068 822–32 069 136, 315 basesExon 15 : 32 069 553–32 069 861, 309 basesExon 14 : 32 070 127–32 070 414, 288 basesExon 13 : 32 071 990–32 072 298, 309 basesExon 12 : 32 073 647–32 073 952, 306 basesExon 11 : 32 079 033–32 079 365, 333 basesExon 10 : 32 081 368–32 081 673, 306 basesExon 9 : 32 082 036–32 082 326, 291 basesExon 8 : 32 084 413–32 084 709, 297 basesExon 7 : 32 085 750–32 086 118, 369 basesExon 6 : 32 088 785–32 089 048, 264 basesExon 5 : 32 089 223–32 089 379, 157 basesExon 4 : 32 095 076–32 095 191, 116 basesExon 3 : 32 095 611–32 097 449, 1 839 basesExon 2 : 32 097 796–32 098 206, 411 basesExon 1 : 32 109 181–32 109 338, 158 bases442515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 13,1 kb sur les 68,2 kb du gène ; 12 735 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de TNXB

273

positions de TNXB où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

273 d'entre elles (100 %) se situent dans des régions que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Low mappability (51 sites)
  • MHC (273 sites)
  • Segmental duplications (71 sites)

Un génome entier couvre les 68,2 kb de TNXB, introns compris, et pas seulement les 13,1 kb d'exons.

Gènes liés aux mêmes affections

Traits associés à TNXB

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que TNXB peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-17 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TNXB : tenascin XB. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tnxb

Vancouver

Dante Labs. Gène TNXB : tenascin XB [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tnxb

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