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Gene

VARS1

valyl-tRNA synthetase 1

Resumo

Localização citogenética
6p21.33
Coordenadas
Cromossoma 6: 31 777 518–31 795 752 (GRCh38)
Exões
30 exões ao longo de 18,2 kb
Proteína
1264 aminoácidos
Símbolos anteriores
VARS2, VARS
Transcrito MANE Select
ENST00000375663.8NM_006295.3
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Genoma de referênciaGRCh38

As posições nas páginas de genes e variantes seguem esta escolha, neste navegador.

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa VARS1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como VARS1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 6, com um parêntese onde se situa VARS1. VARS1 e 69 genes próximos no cromossoma 6, de 31 286 635 a 32 286 634.Cromossoma 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 MbHLA-B: 31 353 195–31 367 067, fita inversaHLA-BMICA: 31 399 784–31 415 315, fita diretaMICAMICB: 31 494 881–31 511 124, fita diretaMICBMCCD1: 31 528 962–31 530 232, fita diretaMCCD1DDX39B: 31 530 217–31 542 451, fita inversaDDX39BATP6V1G2-DDX39B: 31 530 219–31 546 608, fita inversaATP6V1G2: 31 544 444–31 548 427, fita inversaNFKBIL1: 31 546 870–31 558 829, fita diretaLTA: 31 572 054–31 574 324, fita diretaTNF: 31 575 558–31 578 336, fita diretaTNFLTB: 31 580 525–31 582 522, fita inversaLST1: 31 581 065–31 588 911, fita diretaLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, fita inversaNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, fita diretaAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, fita diretaPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, fita direta: 31 623 874–31 625 499, fita diretaBAG6: 31 638 543–31 652 747, fita inversaAPOM: 31 652 416–31 658 214, fita diretaC6orf47: 31 658 298–31 660 778, fita inversaGPANK1: 31 661 228–31 666 283, fita inversaCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, fita direta: 31 666 102–31 673 546, fita diretaLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, fita diretaLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, fita inversaLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, fita inversaABHD16ALY6G6F: 31 706 863–31 710 801, fita diretaLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, fita diretaLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, fita diretaMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, fita diretaLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, fita inversaDDAH2: 31 726 586–31 730 617, fita inversaCLIC1: 31 730 579–31 740 558, fita inversaMSH5: 31 739 677–31 762 678, fita diretaMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, fita diretaSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, fita diretaSAPCD1VWA7: 31 765 590–31 777 328, fita inversaVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 752, fita inversaVARS1LSM2: 31 797 019–31 806 992, fita inversaLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, fita inversaHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, fita diretaHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, fita diretaHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, fita inversaNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, fita inversaSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, fita inversaEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, fita diretaC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, fita inversaZBTB12: 31 927 698–31 952 048, fita diretaCFB: 31 945 650–31 952 086, fita diretaCFBNELFE: 31 952 087–31 959 079, fita inversaSKIC2: 31 959 025–31 969 852, fita diretaSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, fita inversaWHR1: 31 971 091–31 982 821, fita diretaC4A: 31 981 991–32 005 247, fita diretaC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, fita diretaC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, fita diretaCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 115 334, fita inversaTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, fita inversaATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, fita inversaFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, fita diretaPRRT1: 32 147 292–32 153 083, fita inversaPRRT1: 32 150 495–32 154 373, fita inversaPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, fita diretaEGFL8: 32 163 918–32 171 980, fita diretaAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, fita inversaRNF5: 32 178 391–32 184 769, fita diretaAGER: 32 180 963–32 184 365, fita inversaPBX2: 32 184 733–32 190 278, fita inversaGPSM3: 32 190 766–32 195 523, fita inversaNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, fita inversaNOTCH4Diagrama de VARS1: 30 exões na cadeia inversa do cromossoma 6Exão 29: 3 locais conhecidos associados a doençaExão 28: 3 locais conhecidos associados a doençaExão 27: 6 locais conhecidos associados a doençaExão 25: 3 locais conhecidos associados a doençaExão 20: 1 local conhecido associado a doençaExão 15: 1 local conhecido associado a doençaExão 13: 1 local conhecido associado a doençaExão 9: 2 locais conhecidos associados a doençaExão 5: 1 local conhecido associado a doençaExão 4: 1 local conhecido associado a doençaExão 2: 1 local conhecido associado a doençaExão 30: 31 777 518–31 777 662, 145 basesExão 29: 31 778 967–31 779 292, 326 basesExão 28: 31 779 425–31 779 536, 112 basesExão 27: 31 779 608–31 779 814, 207 basesExão 26: 31 779 998–31 780 153, 156 basesExão 25: 31 780 441–31 780 568, 128 basesExão 24: 31 780 705–31 780 783, 79 basesExão 23: 31 780 870–31 780 938, 69 basesExão 22: 31 781 019–31 781 123, 105 basesExão 21: 31 781 481–31 781 606, 126 basesExão 20: 31 781 691–31 781 761, 71 basesExão 19: 31 781 847–31 781 952, 106 basesExão 18: 31 782 087–31 782 177, 91 basesExão 17: 31 782 285–31 782 443, 159 basesExão 16: 31 782 530–31 782 633, 104 basesExão 15: 31 782 721–31 782 845, 125 basesExão 14: 31 783 096–31 783 186, 91 basesExão 13: 31 784 214–31 784 308, 95 basesExão 12: 31 784 394–31 784 502, 109 basesExão 11: 31 784 595–31 784 714, 120 basesExão 10: 31 785 246–31 785 327, 82 basesExão 9: 31 785 569–31 785 733, 165 basesExão 8: 31 791 610–31 791 737, 128 basesExão 7: 31 791 871–31 791 971, 101 basesExão 6: 31 792 217–31 792 301, 85 basesExão 5: 31 792 392–31 792 516, 125 basesExão 4: 31 792 757–31 792 895, 139 basesExão 3: 31 792 986–31 793 120, 135 basesExão 2: 31 794 831–31 795 250, 420 basesExão 1: 31 795 546–31 795 752, 207 bases3025201510515′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 4,1 kb dos 18,2 kb do gene; 3795 dessas bases codificam a proteína.

Como um teste de genoma lê VARS1

25

posições em VARS1 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

25 delas (100%) situam-se em regiões onde as leituras curtas têm dificuldade.

  • MHC (25 locais)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.

Um genoma completo abrange todos os 18,2 kb de VARS1, incluindo os intrões, e não apenas os 4,1 kb de exões.

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene VARS1: valyl-tRNA synthetase 1. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/vars1

Vancouver

Dante Labs. Gene VARS1: valyl-tRNA synthetase 1 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/vars1

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