Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

TNXB

tenascin XB

Shrnutí

Cytogenetická poloha
6p21.33-p21.32
Souřadnice
Chromozom 6: 32 041 153–32 109 338 (GRCh38)
Exony
44 exonů na 68,2 kb
Protein
4 244 aminokyselin
Další názvy
TNXBS, XBS, XB, HXBL, TN-X, TNX
Předchozí symboly
TNXB1, TNXB2
Transkript MANE Select
ENST00000644971.2NM_001365276.2
Typ lokusu
gene with protein product

Kurátorovaný report související s tímto genem

Jak je TNXB uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 6, se závorkou u TNXB. TNXB a 64 genů poblíž na chromozomu 6, od 31 575 246 do 32 575 245.Chromozom 66p21.33-p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 Mb32,4 MbTNF: 31 575 558–31 578 336, řetězec dopřednémLTB: 31 580 525–31 582 522, řetězec zpětnémLST1: 31 581 065–31 588 911, řetězec dopřednémLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, řetězec zpětnémNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, řetězec dopřednémAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, řetězec dopřednémPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, řetězec dopředném: 31 623 874–31 625 499, řetězec dopřednémBAG6: 31 638 543–31 652 747, řetězec zpětnémAPOM: 31 652 416–31 658 214, řetězec dopřednémC6orf47: 31 658 298–31 660 778, řetězec zpětnémGPANK1: 31 661 228–31 666 283, řetězec zpětnémCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, řetězec dopředném: 31 666 102–31 673 546, řetězec dopřednémLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, řetězec dopřednémLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, řetězec zpětnémLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, řetězec zpětnémLY6G6F: 31 706 863–31 710 801, řetězec dopřednémLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, řetězec dopřednémLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, řetězec dopřednémLY6G6DMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, řetězec dopřednémLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, řetězec zpětnémDDAH2: 31 726 586–31 730 617, řetězec zpětnémCLIC1: 31 730 579–31 740 558, řetězec zpětnémMSH5: 31 739 677–31 762 678, řetězec dopřednémMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, řetězec dopřednémSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, řetězec dopřednémVWA7: 31 765 590–31 777 328, řetězec zpětnémVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 975, řetězec zpětnémLSM2: 31 797 019–31 806 992, řetězec zpětnémLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, řetězec zpětnémHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, řetězec dopřednémHSPA1AHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, řetězec dopřednémHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, řetězec zpětnémNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, řetězec zpětnémSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, řetězec zpětnémEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, řetězec dopřednémC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, řetězec zpětnémZBTB12: 31 927 698–31 952 048, řetězec dopřednémCFB: 31 945 650–31 952 086, řetězec dopřednémNELFE: 31 952 087–31 959 079, řetězec zpětnémSKIC2: 31 959 025–31 969 852, řetězec dopřednémSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, řetězec zpětnémDXOWHR1: 31 971 091–31 982 821, řetězec dopřednémWHR1C4A: 31 981 991–32 005 247, řetězec dopřednémC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, řetězec dopřednémC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, řetězec dopřednémCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 109 338, řetězec zpětnémTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, řetězec zpětnémATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, řetězec zpětnémFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, řetězec dopřednémPRRT1: 32 147 292–32 153 083, řetězec zpětnémPRRT1: 32 150 495–32 154 373, řetězec zpětnémPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, řetězec dopřednémEGFL8: 32 163 918–32 171 980, řetězec dopřednémAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, řetězec zpětnémRNF5: 32 178 391–32 184 769, řetězec dopřednémAGER: 32 180 963–32 184 365, řetězec zpětnémPBX2: 32 184 733–32 190 278, řetězec zpětnémGPSM3: 32 190 766–32 195 523, řetězec zpětnémNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, řetězec zpětnémNOTCH4TSBP1: 32 288 526–32 371 907, řetězec zpětnémTSBP1BTNL2: 32 391 481–32 407 181, řetězec zpětnémBTNL2HLA-DRA: 32 439 870–32 445 181, řetězec dopřednémHLA-DRAHLA-DRB5: 32 516 622–32 530 369, řetězec zpětnémHLA-DRB5Schéma TNXB: 44 exonů na zpětném řetězci chromozomu 6Exon 43: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 42: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 41: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 40: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 36: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 35: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 33: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 32: 3 známých míst způsobujících onemocněníExon 31: 11 známých míst způsobujících onemocněníExon 30: 6 známých míst způsobujících onemocněníExon 29: 10 známých míst způsobujících onemocněníExon 28: 9 známých míst způsobujících onemocněníExon 27: 4 známých míst způsobujících onemocněníExon 26: 9 známých míst způsobujících onemocněníExon 25: 6 známých míst způsobujících onemocněníExon 24: 11 známých míst způsobujících onemocněníExon 23: 12 známých míst způsobujících onemocněníExon 22: 2 známých míst způsobujících onemocněníExon 21: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 20: 4 známých míst způsobujících onemocněníExon 19: 6 známých míst způsobujících onemocněníExon 18: 8 známých míst způsobujících onemocněníExon 17: 4 známých míst způsobujících onemocněníExon 16: 6 známých míst způsobujících onemocněníExon 15: 5 známých míst způsobujících onemocněníExon 14: 5 známých míst způsobujících onemocněníExon 13: 10 známých míst způsobujících onemocněníExon 12: 4 známých míst způsobujících onemocněníExon 11: 8 známých míst způsobujících onemocněníExon 10: 11 známých míst způsobujících onemocněníExon 9: 6 známých míst způsobujících onemocněníExon 8: 11 známých míst způsobujících onemocněníExon 7: 8 známých míst způsobujících onemocněníExon 6: 5 známých míst způsobujících onemocněníExon 5: 7 známých míst způsobujících onemocněníExon 4: 2 známých míst způsobujících onemocněníExon 3: 50 známých míst způsobujících onemocněníExon 2: 6 známých míst způsobujících onemocněníExon 44: 32 041 153–32 041 450, 298 bázíExon 43: 32 041 771–32 041 934, 164 bázíExon 42: 32 042 012–32 042 173, 162 bázíExon 41: 32 042 266–32 042 362, 97 bázíExon 40: 32 042 455–32 042 606, 152 bázíExon 39: 32 042 699–32 042 831, 133 bázíExon 38: 32 042 951–32 043 081, 131 bázíExon 37: 32 043 175–32 043 318, 144 bázíExon 36: 32 043 437–32 043 556, 120 bázíExon 35: 32 043 749–32 043 892, 144 bázíExon 34: 32 044 007–32 044 129, 123 bázíExon 33: 32 044 381–32 044 716, 336 bázíExon 32: 32 045 006–32 045 326, 321 bázíExon 31: 32 046 175–32 046 456, 282 bázíExon 30: 32 047 734–32 048 012, 279 bázíExon 29: 32 048 363–32 048 650, 288 bázíExon 28: 32 049 270–32 049 587, 318 bázíExon 27: 32 049 998–32 050 321, 324 bázíExon 26: 32 052 670–32 052 993, 324 bázíExon 25: 32 053 388–32 053 711, 324 bázíExon 24: 32 055 851–32 056 174, 324 bázíExon 23: 32 056 586–32 056 903, 318 bázíExon 22: 32 058 058–32 058 390, 333 bázíExon 21: 32 061 397–32 061 720, 324 bázíExon 20: 32 062 157–32 062 483, 327 bázíExon 19: 32 064 821–32 065 117, 297 bázíExon 18: 32 067 661–32 067 984, 324 bázíExon 17: 32 068 390–32 068 707, 318 bázíExon 16: 32 068 822–32 069 136, 315 bázíExon 15: 32 069 553–32 069 861, 309 bázíExon 14: 32 070 127–32 070 414, 288 bázíExon 13: 32 071 990–32 072 298, 309 bázíExon 12: 32 073 647–32 073 952, 306 bázíExon 11: 32 079 033–32 079 365, 333 bázíExon 10: 32 081 368–32 081 673, 306 bázíExon 9: 32 082 036–32 082 326, 291 bázíExon 8: 32 084 413–32 084 709, 297 bázíExon 7: 32 085 750–32 086 118, 369 bázíExon 6: 32 088 785–32 089 048, 264 bázíExon 5: 32 089 223–32 089 379, 157 bázíExon 4: 32 095 076–32 095 191, 116 bázíExon 3: 32 095 611–32 097 449, 1 839 bázíExon 2: 32 097 796–32 098 206, 411 bázíExon 1: 32 109 181–32 109 338, 158 bází442515′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 13,1 kb z 68,2 kb genu; 12 735 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte TNXB

273

pozic v genu TNXB, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Z nich 273 (100 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.

  • Low mappability (51 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • MHC (273 míst)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.
  • Segmental duplications (71 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Celý genom pokrývá všech 68,2 kb genu TNXB, včetně intronů, nikoli jen 13,1 kb exonů.

Geny spojené se stejnými onemocněními

Rysy spojené s TNXB

Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit TNXB. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.

Externí odkazy

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
  • Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen TNXB: tenascin XB. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/tnxb

Vancouver

Dante Labs. Gen TNXB: tenascin XB [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/tnxb

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test