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Gen

TNXB

tenascin XB

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
6p21.33-p21.32
Koordinaten
Chromosom 6: 32.041.153–32.109.338 (GRCh38)
Exons
44 Exons über 68,2 kb
Protein
4.244 Aminosäuren
Auch bekannt als
TNXBS, XBS, XB, HXBL, TN-X, TNX
Frühere Symbole
TNXB1, TNXB2
MANE-Select-Transkript
ENST00000644971.2NM_001365276.2
Locus-Typ
Protein-coding

Kuratierter Bericht zu diesem Gen

Aufbau von TNXB

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Bekannte krankheitsverursachende Stellen
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 6, mit einer Klammer, an der TNXB liegt. TNXB und 64 Gene in der Nähe auf Chromosom 6, von 31.575.246 bis 32.575.245.Chromosom 66p21.33-p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 Mb32,4 MbTNF: 31.575.558–31.578.336, Plus-StrangLTB: 31.580.525–31.582.522, Minus-StrangLST1: 31.581.065–31.588.911, Plus-StrangLST1NCR3: 31.588.895–31.593.217, Minus-StrangNCR3AIF1: 31.615.214–31.617.025, Plus-StrangAIF1PRRC2A: 31.620.675–31.637.771, Plus-StrangPRRC2A: 31.622.774–31.622.860, Plus-Strang: 31.623.874–31.625.499, Plus-StrangBAG6: 31.638.543–31.652.747, Minus-StrangAPOM: 31.652.416–31.658.214, Plus-StrangC6orf47: 31.658.298–31.660.778, Minus-StrangGPANK1: 31.661.228–31.666.283, Minus-StrangCSNK2B: 31.665.227–31.670.343, Plus-Strang: 31.666.102–31.673.546, Plus-StrangLY6G5B: 31.669.976–31.673.776, Plus-StrangLY6G5C: 31.676.684–31.684.040, Minus-StrangLY6G5CABHD16A: 31.686.954–31.703.391, Minus-StrangLY6G6F: 31.706.863–31.710.801, Plus-StrangLY6G6F-LY6G6D: 31.706.904–31.717.918, Plus-StrangLY6G6D: 31.715.285–31.717.919, Plus-StrangLY6G6DMPIG6B: 31.718.594–31.726.714, Plus-StrangLY6G6C: 31.718.648–31.721.746, Minus-StrangDDAH2: 31.726.586–31.730.617, Minus-StrangCLIC1: 31.730.579–31.740.558, Minus-StrangMSH5: 31.739.677–31.762.678, Plus-StrangMSH5MSH5-SAPCD1: 31.740.020–31.764.851, Plus-StrangSAPCD1: 31.762.656–31.764.851, Plus-StrangVWA7: 31.765.590–31.777.328, Minus-StrangVWA7VARS1: 31.777.518–31.795.975, Minus-StrangLSM2: 31.797.019–31.806.992, Minus-StrangLSM2HSPA1L: 31.809.619–31.815.788, Minus-StrangHSPA1A: 31.815.543–31.817.994, Plus-StrangHSPA1AHSPA1B: 31.827.738–31.830.254, Plus-StrangHSPA1BNEU1: 31.857.063–31.862.905, Minus-StrangNEU1SLC44A4: 31.863.173–31.879.198, Minus-StrangSLC44A4EHMT2: 31.879.758–31.897.723, Minus-StrangEHMT2C2: 31.897.785–31.945.677, Plus-StrangC2ZBTB12: 31.899.065–31.902.103, Minus-StrangZBTB12: 31.927.698–31.952.048, Plus-StrangCFB: 31.945.650–31.952.086, Plus-StrangNELFE: 31.952.087–31.959.079, Minus-StrangSKIC2: 31.959.025–31.969.852, Plus-StrangSKIC2DXO: 31.969.810–31.972.517, Minus-StrangDXOWHR1: 31.971.091–31.982.821, Plus-StrangWHR1C4A: 31.981.991–32.005.247, Plus-StrangC4AC4B: 32.014.725–32.035.975, Plus-StrangC4BCYP21A2: 32.038.297–32.042.321, Plus-StrangCYP21A2TNXB: 32.041.153–32.109.338, Minus-StrangTNXBATF6B: 32.115.264–32.128.255, Minus-StrangATF6BFKBPL: 32.128.697–32.131.070, Minus-StrangFKBPLPPT2: 32.146.580–32.163.679, Plus-StrangPRRT1: 32.147.292–32.153.083, Minus-StrangPRRT1: 32.150.495–32.154.373, Minus-StrangPPT2-EGFL8: 32.153.845–32.171.978, Plus-StrangEGFL8: 32.163.918–32.171.980, Plus-StrangAGPAT1: 32.167.118–32.178.112, Minus-StrangRNF5: 32.178.391–32.184.769, Plus-StrangAGER: 32.180.963–32.184.365, Minus-StrangPBX2: 32.184.733–32.190.278, Minus-StrangGPSM3: 32.190.766–32.195.523, Minus-StrangNOTCH4: 32.194.843–32.224.111, Minus-StrangNOTCH4TSBP1: 32.288.526–32.371.907, Minus-StrangTSBP1BTNL2: 32.391.481–32.407.181, Minus-StrangBTNL2HLA-DRA: 32.439.870–32.445.181, Plus-StrangHLA-DRAHLA-DRB5: 32.516.622–32.530.369, Minus-StrangHLA-DRB5Diagramm von TNXB: 44 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 6Exon 43: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 42: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 41: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 40: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 36: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 35: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 33: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 32: 3 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 31: 11 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 30: 6 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 29: 10 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 28: 9 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 27: 4 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 26: 9 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 25: 6 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 24: 11 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 23: 12 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 22: 2 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 21: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 20: 4 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 19: 6 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 18: 8 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 17: 4 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 16: 6 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 15: 5 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 14: 5 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 13: 10 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 12: 4 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 11: 8 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 10: 11 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 9: 6 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 8: 11 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 7: 8 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 6: 5 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 5: 7 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 4: 2 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 3: 50 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 2: 6 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 44: 32.041.153–32.041.450, 298 BasenExon 43: 32.041.771–32.041.934, 164 BasenExon 42: 32.042.012–32.042.173, 162 BasenExon 41: 32.042.266–32.042.362, 97 BasenExon 40: 32.042.455–32.042.606, 152 BasenExon 39: 32.042.699–32.042.831, 133 BasenExon 38: 32.042.951–32.043.081, 131 BasenExon 37: 32.043.175–32.043.318, 144 BasenExon 36: 32.043.437–32.043.556, 120 BasenExon 35: 32.043.749–32.043.892, 144 BasenExon 34: 32.044.007–32.044.129, 123 BasenExon 33: 32.044.381–32.044.716, 336 BasenExon 32: 32.045.006–32.045.326, 321 BasenExon 31: 32.046.175–32.046.456, 282 BasenExon 30: 32.047.734–32.048.012, 279 BasenExon 29: 32.048.363–32.048.650, 288 BasenExon 28: 32.049.270–32.049.587, 318 BasenExon 27: 32.049.998–32.050.321, 324 BasenExon 26: 32.052.670–32.052.993, 324 BasenExon 25: 32.053.388–32.053.711, 324 BasenExon 24: 32.055.851–32.056.174, 324 BasenExon 23: 32.056.586–32.056.903, 318 BasenExon 22: 32.058.058–32.058.390, 333 BasenExon 21: 32.061.397–32.061.720, 324 BasenExon 20: 32.062.157–32.062.483, 327 BasenExon 19: 32.064.821–32.065.117, 297 BasenExon 18: 32.067.661–32.067.984, 324 BasenExon 17: 32.068.390–32.068.707, 318 BasenExon 16: 32.068.822–32.069.136, 315 BasenExon 15: 32.069.553–32.069.861, 309 BasenExon 14: 32.070.127–32.070.414, 288 BasenExon 13: 32.071.990–32.072.298, 309 BasenExon 12: 32.073.647–32.073.952, 306 BasenExon 11: 32.079.033–32.079.365, 333 BasenExon 10: 32.081.368–32.081.673, 306 BasenExon 9: 32.082.036–32.082.326, 291 BasenExon 8: 32.084.413–32.084.709, 297 BasenExon 7: 32.085.750–32.086.118, 369 BasenExon 6: 32.088.785–32.089.048, 264 BasenExon 5: 32.089.223–32.089.379, 157 BasenExon 4: 32.095.076–32.095.191, 116 BasenExon 3: 32.095.611–32.097.449, 1.839 BasenExon 2: 32.097.796–32.098.206, 411 BasenExon 1: 32.109.181–32.109.338, 158 Basen442515′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 13,1 kb der 68,2 kb des Gens aus; 12.735 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von TNXB

273

Positionen in TNXB, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft

273 davon (100 %) liegen in Bereichen, die Short Reads nur schwer erfassen.

  • Low mappability (51 Stellen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • MHC (273 Stellen)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.
  • Segmental duplications (71 Stellen)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Ein Whole Genome erfasst alle 68,2 kb von TNXB, einschließlich der Introns, nicht nur die 13,1 kb Exons.

Gene mit denselben Erkrankungen

Mit TNXB verknüpfte Merkmale

Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die TNXB verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.

Externe Links

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-17: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
  • Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
  • ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
  • Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
  • Datenversion 2026.10.17-8666dff2.

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APA

Dante Labs. (o. J.). TNXB-Gen: tenascin XB. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/tnxb

Vancouver

Dante Labs. TNXB-Gen: tenascin XB [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/tnxb

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