Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

TNXB

tenascin XB

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
6p21.33-p21.32
Koordinaadid
Kromosoom 6: 32 041 153–32 109 338 (GRCh38)
Eksonid
44 eksonit, ulatus 68,2 kb
Valk
4244 aminohapet
Tuntud ka kui
TNXBS, XBS, XB, HXBL, TN-X, TNX
Varasemad tähised
TNXB1, TNXB2
MANE Select transkript
ENST00000644971.2NM_001365276.2
Lookuse tüüp
gene with protein product

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanne

Kuidas TNXB on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 6, millel on sulg kohal, kus asub TNXB. TNXB ja sellele lähedal asuvad 64 geeni kromosoomil 6, vahemikus 31 575 246 kuni 32 575 245.Kromosoom 66p21.33-p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 Mb32,4 MbTNF: 31 575 558–31 578 336, otsene ahelLTB: 31 580 525–31 582 522, pöördne ahelLST1: 31 581 065–31 588 911, otsene ahelLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, pöördne ahelNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, otsene ahelAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, otsene ahelPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, otsene ahel: 31 623 874–31 625 499, otsene ahelBAG6: 31 638 543–31 652 747, pöördne ahelAPOM: 31 652 416–31 658 214, otsene ahelC6orf47: 31 658 298–31 660 778, pöördne ahelGPANK1: 31 661 228–31 666 283, pöördne ahelCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, otsene ahel: 31 666 102–31 673 546, otsene ahelLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, otsene ahelLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, pöördne ahelLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, pöördne ahelLY6G6F: 31 706 863–31 710 801, otsene ahelLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, otsene ahelLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, otsene ahelLY6G6DMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, otsene ahelLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, pöördne ahelDDAH2: 31 726 586–31 730 617, pöördne ahelCLIC1: 31 730 579–31 740 558, pöördne ahelMSH5: 31 739 677–31 762 678, otsene ahelMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, otsene ahelSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, otsene ahelVWA7: 31 765 590–31 777 328, pöördne ahelVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 975, pöördne ahelLSM2: 31 797 019–31 806 992, pöördne ahelLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, pöördne ahelHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, otsene ahelHSPA1AHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, otsene ahelHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, pöördne ahelNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, pöördne ahelSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, pöördne ahelEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, otsene ahelC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, pöördne ahelZBTB12: 31 927 698–31 952 048, otsene ahelCFB: 31 945 650–31 952 086, otsene ahelNELFE: 31 952 087–31 959 079, pöördne ahelSKIC2: 31 959 025–31 969 852, otsene ahelSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, pöördne ahelDXOWHR1: 31 971 091–31 982 821, otsene ahelWHR1C4A: 31 981 991–32 005 247, otsene ahelC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, otsene ahelC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, otsene ahelCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 109 338, pöördne ahelTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, pöördne ahelATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, pöördne ahelFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, otsene ahelPRRT1: 32 147 292–32 153 083, pöördne ahelPRRT1: 32 150 495–32 154 373, pöördne ahelPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, otsene ahelEGFL8: 32 163 918–32 171 980, otsene ahelAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, pöördne ahelRNF5: 32 178 391–32 184 769, otsene ahelAGER: 32 180 963–32 184 365, pöördne ahelPBX2: 32 184 733–32 190 278, pöördne ahelGPSM3: 32 190 766–32 195 523, pöördne ahelNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, pöördne ahelNOTCH4TSBP1: 32 288 526–32 371 907, pöördne ahelTSBP1BTNL2: 32 391 481–32 407 181, pöördne ahelBTNL2HLA-DRA: 32 439 870–32 445 181, otsene ahelHLA-DRAHLA-DRB5: 32 516 622–32 530 369, pöördne ahelHLA-DRB5TNXB skeem: 44 eksonit kromosoomi 6 pöördne ahelalEkson 43: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 42: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 41: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 40: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 36: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 35: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 33: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 32: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 31: 11 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 30: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 29: 10 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 28: 9 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 27: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 26: 9 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 25: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 24: 11 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 23: 12 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 22: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 21: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 20: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 19: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 18: 8 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 17: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 16: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 15: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 14: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 13: 10 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 12: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 11: 8 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 10: 11 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 9: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 8: 11 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 7: 8 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 6: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 5: 7 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 4: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 3: 50 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 2: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 44: 32 041 153–32 041 450, 298 alustEkson 43: 32 041 771–32 041 934, 164 alustEkson 42: 32 042 012–32 042 173, 162 alustEkson 41: 32 042 266–32 042 362, 97 alustEkson 40: 32 042 455–32 042 606, 152 alustEkson 39: 32 042 699–32 042 831, 133 alustEkson 38: 32 042 951–32 043 081, 131 alustEkson 37: 32 043 175–32 043 318, 144 alustEkson 36: 32 043 437–32 043 556, 120 alustEkson 35: 32 043 749–32 043 892, 144 alustEkson 34: 32 044 007–32 044 129, 123 alustEkson 33: 32 044 381–32 044 716, 336 alustEkson 32: 32 045 006–32 045 326, 321 alustEkson 31: 32 046 175–32 046 456, 282 alustEkson 30: 32 047 734–32 048 012, 279 alustEkson 29: 32 048 363–32 048 650, 288 alustEkson 28: 32 049 270–32 049 587, 318 alustEkson 27: 32 049 998–32 050 321, 324 alustEkson 26: 32 052 670–32 052 993, 324 alustEkson 25: 32 053 388–32 053 711, 324 alustEkson 24: 32 055 851–32 056 174, 324 alustEkson 23: 32 056 586–32 056 903, 318 alustEkson 22: 32 058 058–32 058 390, 333 alustEkson 21: 32 061 397–32 061 720, 324 alustEkson 20: 32 062 157–32 062 483, 327 alustEkson 19: 32 064 821–32 065 117, 297 alustEkson 18: 32 067 661–32 067 984, 324 alustEkson 17: 32 068 390–32 068 707, 318 alustEkson 16: 32 068 822–32 069 136, 315 alustEkson 15: 32 069 553–32 069 861, 309 alustEkson 14: 32 070 127–32 070 414, 288 alustEkson 13: 32 071 990–32 072 298, 309 alustEkson 12: 32 073 647–32 073 952, 306 alustEkson 11: 32 079 033–32 079 365, 333 alustEkson 10: 32 081 368–32 081 673, 306 alustEkson 9: 32 082 036–32 082 326, 291 alustEkson 8: 32 084 413–32 084 709, 297 alustEkson 7: 32 085 750–32 086 118, 369 alustEkson 6: 32 088 785–32 089 048, 264 alustEkson 5: 32 089 223–32 089 379, 157 alustEkson 4: 32 095 076–32 095 191, 116 alustEkson 3: 32 095 611–32 097 449, 1839 alustEkson 2: 32 097 796–32 098 206, 411 alustEkson 1: 32 109 181–32 109 338, 158 alust442515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 13,1 kb kogupikkusega 68,2 kb; neist 12 735 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse TNXB

273

kohad geenis TNXB, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist 273 (100%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

  • Low mappability (51 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • MHC (273 kohta)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.
  • Segmental duplications (71 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni TNXB 68,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (13,1 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
  • ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). TNXB geen: tenascin XB. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tnxb

Vancouver

Dante Labs. TNXB geen: tenascin XB [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tnxb

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test