Gen
ACP5
acid phosphatase 5, tartrate resistant
- HGNC 124↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000102575↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 54↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 19p13.2
- Współrzędne
- Chromosom 19: 11 574 660–11 577 645 (GRCh38)
- Eksony
- 5 eksonów na odcinku 3 kb
- Białko
- 325 aminokwasów
- Znany również jako
- TRAP, HPAP, TRAcP
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000648477.1NM_001611.5
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/acp5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj ACP5 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Rzadkie jednogenowe choroby autozapalne
- Autozapalenie i autoimmunizacja związane z PTPN2Autosomalne dominujące
Wczesna choroba zapalna i autoimmunologiczna, w tym zapalenie okrężnicy i zapalenie stawów, spowodowana wariantami w genie PTPN2.
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Interferonopatie typu I
- Spondyloenchondrodysplazja z dysregulacją odpornościowąAutosomalne recesywne
Dysplazja szkieletowa z chorobami autoimmunologicznymi, takimi jak toczeń lub niska liczba płytek krwi, spowodowana wariantami ACP5.
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu ACP5
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,4 kb z 3 kb genu; 978 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie ACP5
3Niski
Jak trudno sekwencjonować ACP5 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych ACP5 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.0%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.31%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
31
pozycje w ACP5, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 3 kb ACP5, łącznie z intronami, a nie tylko 1,4 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ADA2adenosine deaminase 2Wspólne schorzenie: 1
- ADARadenosine deaminase RNA specificWspólne schorzenie: 1
- COPAcoat protein complex I subunit alphaWspólne schorzenie: 1
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Wspólne schorzenie: 1
- POLA1DNA polymerase alpha 1, catalytic subunitWspólne schorzenie: 1
- POMPproteasome maturation proteinWspólne schorzenie: 1
- PSMB10proteasome 20S subunit beta 10Wspólne schorzenie: 1
- PSMB8proteasome 20S subunit beta 8Wspólne schorzenie: 1
- PSMB9proteasome 20S subunit beta 9Wspólne schorzenie: 1
- PTPN2protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2Wspólne schorzenie: 1
- RIGIRNA sensor RIG-IWspólne schorzenie: 1
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit AWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem ACP5
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać ACP5. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Flattened vertebrae
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Barrel-shaped chest
- Excessive inward curvature of lower spine
- Increased intervertebral space
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Short pelvis bones
- Arthritis
Pokaż jeszcze 14 cech
- Disproportionate short-trunked short stature
- Enchondroma
- Juvenile idiopathic arthritis
- Lower limb pain
- Scoliosis
- Small wings of the pelvic girdle
- Hunched back
- Pigeon chest
- Irregular vertebral endplates
- Kyphoscoliosis
- Progressive spastic quadriplegia
- Rheumatoid arthritis
- Spastic diplegia
- Spondylometaphyseal dysplasia
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Autoimmunity
- Granuloma
- Recurrent infections
- Recurrent respiratory infections
- Systemic lupus erythematosus
- Pneumonia
Pokaż jeszcze 4 cech
Abnormality of the nervous system
- Brain imaging abnormality
- Intellectual disability, mild
- Abnormal lateral ventricle morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormality of the nervous system
- Chorea
- Global developmental delay
- Headache
Pokaż jeszcze 4 cech
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen ACP5: acid phosphatase 5, tartrate resistant. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/acp5
Dante Labs. Gen ACP5: acid phosphatase 5, tartrate resistant [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/acp5
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni