Gen
RIGI
RNA sensor RIG-I
- HGNC 19102↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000107201↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 23586↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 9p21.1
- Współrzędne
- Chromosom 9: 32 455 302–32 526 196 (GRCh38)
- Eksony
- 18 eksonów na odcinku 70,9 kb
- Białko
- 925 aminokwasów
- Znany również jako
- RIG-I, FLJ13599, DKFZp434J1111, RIG-1, RIG1
- Poprzednie symbole
- DDX58
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000379883.3NM_014314.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rigi.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj RIGI oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Osteogenesis Imperfecta
Grupa dziedzicznych zaburzeń tkanki łącznej powodujących kruche kości, które łatwo ulegają złamaniu, często z niebieskawymi twardówkami, utratą słuchu i problemami stomatologicznymi.
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Cykliczne dożylne bisfosfoniany (pamidronian, zoledronian); wprowadzanie prętów domszpikowych do długich kości; fizjoterapia; denosumab (stosowany klinicznie w OI u dzieci); romosozumab (w fazie badań); monitorowanie słuchu; opieka stomatologiczna w przypadku dentinogenesis imperfecta
Rzadkie jednogenowe choroby autozapalne
- Autozapalenie i autoimmunizacja związane z PTPN2Autosomalne dominujące
Wczesna choroba zapalna i autoimmunologiczna, w tym zapalenie okrężnicy i zapalenie stawów, spowodowana wariantami w genie PTPN2.
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Interferonopatie typu I
- Zespół Singletona-Mertena 2Autosomalne dominujące
Łagodniejsza postać zespołu Singletona-Mertena spowodowana wariantami DDX58 (RIG-I).
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu RIGI
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,6 kb z 70,9 kb genu; 2778 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie RIGI
0Niski
Jak trudno sekwencjonować RIGI krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych RIGI w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.2,5%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.0%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
1
pozycja w RIGI, w której ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 70,9 kb RIGI, łącznie z intronami, a nie tylko 4,6 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Wspólnych schorzeń: 2
- ACP5acid phosphatase 5, tartrate resistantWspólne schorzenie: 1
- ADA2adenosine deaminase 2Wspólne schorzenie: 1
- ADARadenosine deaminase RNA specificWspólne schorzenie: 1
- ANO5anoctamin 5Wspólne schorzenie: 1
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Wspólne schorzenie: 1
- BMP1bone morphogenetic protein 1Wspólne schorzenie: 1
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainWspólne schorzenie: 1
- COPAcoat protein complex I subunit alphaWspólne schorzenie: 1
- CREB3L1cAMP responsive element binding protein 3 like 1Wspólne schorzenie: 1
- CRTAPcartilage associated proteinWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem RIGI
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać RIGI. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.18-e609d43e.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen RIGI: RNA sensor RIG-I. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/rigi
Dante Labs. Gen RIGI: RNA sensor RIG-I [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/rigi
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni