Gen
ALG9
ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase
- HGNC 15672↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000086848↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 79796↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 11q23.1
- Koordinater
- Kromosom 11: 111 782 195–111 871 581 (GRCh38)
- Eksoner
- 15 eksoner over 89,4 kb
- Protein
- 618 aminosyrer
- Tidligere symboler
- DIBD1
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000616540.5NM_024740.2
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/alg9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes ALG9 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Polycystisk nyresykdom
En vanligvis autosomal dominant og sjeldnere autosomal recessiv genetisk lidelse som kjennetegnes av mange cyster i nyrene, og som fører til nyresvikt i sluttstadiet. Den autosomal dominante formen er knyttet til avvik på den korte armen av kromosom 16. Symptomer hos pasienter med autosomal dominant form opptrer vanligvis i middelalderen og omfatter magesmerter, blod i urinen og høyt blodtrykk. Pasienter kan utvikle aneurismer i hjernen og cyster i leveren. Pasienter med autosomal recessiv form får progredierende nyresvikt tidlig i livet og symptomer som følge av leverfibrose. Den autosomal recessive formen er knyttet til avvik på kromosom 6. Polycystisk nyresykdom kan også oppstå som bivirkning hos pasienter i nyredialyse.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Tolvaptan (Jynarque, FDA 2018) ved raskt progredierende ADPKD; blodtrykkskontroll (mål <110/75); smertebehandling; behandling av cysteinfeksjon; hjerne-MRA-screening for intrakranielle aneurismer; nyretransplantasjon ved nyresvikt i sluttstadiet (ESRD)
Bredere grupperinger
Medfødte glykosyleringsforstyrrelser
- Medfødte glykosyleringsforstyrrelser (CDG)
Ett av 98 gener knyttet til den
En stor gruppe arvelige tilstander der sukkerkjeder (glykaner) ikke blir riktig bygget opp eller festet til proteiner og lipider, og som ofte rammer hjernen, leveren, blodkoagulasjonen, veksten og mange andre organsystemer. De fleste er autosomalt recessive, men noen er X-bundne eller autosomalt dominante.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er ALG9 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 6,2 kb av genets 89,4 kb, og 1 857 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av ALG9
1Lav
Hvor vanskelig ALG9 er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av ALG9s eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.3 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.2,8 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
38
posisjoner i ALG9 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 89,4 kb av ALG9, inkludert introner, og ikke bare de 6,2 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 2 tilstander
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Deler 1 tilstand
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseDeler 1 tilstand
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeler 1 tilstand
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseDeler 1 tilstand
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 tilstand
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 tilstand
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeler 1 tilstand
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseDeler 1 tilstand
- ALG5ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferaseDeler 1 tilstand
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 1 tilstand
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til ALG9
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene ALG9 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of head or neck
- Beaked nose
- Little lower jaw
- Receding chin
- Short neck
- Smooth philtrum
- Thickened skin folds of neck
- Underdeveloped tissue around nostril
- Abnormally small head
Vis 20 egenskaper til
- Decreased bone formation of skull
- Corners of eye widely separated
- Eye folds
- Progressively abnormally small cranium
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Bifid uvula
- Broad head shape
- Decreased depth of eye sockets
- Delayed cranial suture closure
- Depressed nasal bridge
- Frontal bossing
- Long philtrum
- Low hairline at back of neck
- Low insertion of columella
- Prominent metopic ridge
- Short nose
- Small retruded chin
- Thin red part of the upper lip
- Wide mouth
- Wry neck
Abnormality of the digestive system
- Enlarged liver
- Villous atrophy
- Liver cysts
- Omphalocele
- Periportal fibrosis
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Acid reflux
- Diarrhea
Vis 3 egenskaper til
Laboratory abnormality
- Decreased circulating cholesterol level
- Low albumin
- Type I transferrin isoform profile
- Elevated creatinine
- Abnormal urinary electrolyte concentration
- Albuminuria
- Blood in urine
- Fetal skin edema
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.18-e609d43e.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). ALG9-genet: ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/alg9
Dante Labs. ALG9-genet: ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/alg9
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker