Gen
ALG9
ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase
- HGNC 15672↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000086848↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 79796↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 11q23.1
- Koordinater
- Kromosom 11: 111.782.195–111.871.581 (GRCh38)
- Exoner
- 15 exoner fordelt over 89,4 kb
- Protein
- 618 aminosyrer
- Tidligere symboler
- DIBD1
- MANE Select-transkript
- ENST00000616540.5NM_024740.2
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/alg9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs ALG9 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Polycystisk nyresygdom
En genetisk sygdom, der oftest nedarves autosomalt dominant og sjældnere autosomalt recessivt, og som er kendetegnet ved tilstedeværelsen af talrige cyster i nyrerne, der fører til terminal nyresvigt. Den autosomal dominante form er forbundet med afvigelser på det korte arm af kromosom 16. Symptomer hos patienter med den autosomal dominante form opstår typisk i middelalderen og omfatter mavesmerter, blod i urinen og højt blodtryk. Patienter kan udvikle aneurismer i hjernen og cyster i leveren. Patienter med den autosomal recessive form får tidligt i livet progressiv nyresvigt og symptomer som følge af leverfibrose. Den autosomal recessive form er forbundet med afvigelser på kromosom 6. Polycystisk nyresygdom kan også opstå som bivirkning hos patienter i nyredialyse.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Tolvaptan (Jynarque, FDA 2018) ved hurtigt progredierende ADPKD; blodtryksregulering (mål <110/75); smertebehandling; behandling af cysteinfektion; screening med hjerne-MRA for intrakranielle aneurismer; nyretransplantation ved ESRD
Bredere grupperinger
Medfødte glykosyleringsforstyrrelser
- Medfødte glykosyleringsforstyrrelser (CDG)
Et af 98 gener, der er knyttet til det
En stor gruppe arvelige tilstande, hvor sukkerkæder (glykaner) ikke dannes eller sættes korrekt på proteiner og lipider. De rammer ofte hjernen, leveren, blodets evne til at størkne, væksten og mange andre organsystemer. De fleste nedarves autosomalt recessivt, men nogle er X-bundne eller autosomalt dominante.
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er ALG9 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 6,2 kb af genets 89,4 kb; 1.857 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af ALG9
1Let
Hvor svær ALG9 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle eksonerne i ALG9 ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger til: andelen af eksonerne i ALG9 i hver type svær region
- KortlægningsbarhedStrækninger, hvor reads på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke kan spænde over. Vægt 15 %.3 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.2,8 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan tilpasses til. Vægt 10 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan beregnes scorenHver søjle er andelen af eksonbaserne i ALG9 i den pågældende type svær region. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver koster et kald med korte reads: 0, når ingen base ligger i nogen, 100, når alle baser ligger i alle.
38
positioner i ALG9, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem falder i et område, som korte reads har svært ved at finde.
Et helt genom dækker alle 89,4 kb af ALG9, inklusive introner, og ikke kun de 6,2 kb eksoner.
ClinVar pathogenic variants (39)
The ALG9 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 13
- Patogen/sandsynligvis patogen 4
- Sandsynligvis patogen 22
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_024740.2(ALG9):c.1363C>T (p.Arg455Ter) (opens in a new tab) | ALG9-associated autosomal dominant polycystic kidney disease and 2 others | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_024740.2(ALG9):c.1225del (p.Arg409fs) (opens in a new tab) | ALG9-associated autosomal dominant polycystic kidney disease | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_024740.2(ALG9):c.860A>G (p.Tyr287Cys) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_024740.2(ALG9):c.744G>A (p.Trp248Ter) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_024740.2(ALG9):c.896-2A>G (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_024740.2(ALG9):c.566-1G>A (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_024740.2(ALG9):c.1695G>A (p.Trp565Ter) (opens in a new tab) | familial cystic renal disease | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1534G>T (p.Gly512Ter) (opens in a new tab) | ALG9-associated autosomal dominant polycystic kidney disease | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1441C>T (p.Arg481Ter) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1296dup (p.Phe433fs) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1219C>T (p.Arg407Ter) (opens in a new tab) | ALG9-associated autosomal dominant polycystic kidney disease | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1173+2T>A (opens in a new tab) | Gillessen-Kaesbach-Nishimura syndrome | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1163_1164del (p.Ser388fs) (opens in a new tab) | ALG9-associated autosomal dominant polycystic kidney disease | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.992del (p.Met331fs) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.761G>A (p.Trp254Ter) (opens in a new tab) | autosomal dominant polycystic kidney disease | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.754_757del (p.Phe252fs) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.427C>T (p.Arg143Ter) (opens in a new tab) | ALG9-associated autosomal dominant polycystic kidney disease and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.126del (p.Thr43fs) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.100C>T (p.Arg34Ter) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1651G>T (p.Glu551Ter) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1605_1608del (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1602+1G>A (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1496C>G (p.Ser499Ter) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1324+2T>C (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_024740.2(ALG9):c.1209dup (p.Val404fs) (opens in a new tab) | ALG9-congenital disorder of glycosylation and 1 other | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
See all 39 with every other ALG9 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 2 sygdomme
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Deler 1 sygdom
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 sygdom
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 sygdom
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG5ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deler 1 sygdom
Træk knyttet til ALG9
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, ALG9 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of head or neck
- Beaked nose
- Little lower jaw
- Receding chin
- Short neck
- Smooth philtrum
- Thickened skin folds of neck
- Underdeveloped tissue around nostril
- Abnormally small head
Vis 20 træk mere
- Decreased bone formation of skull
- Corners of eye widely separated
- Eye folds
- Progressively abnormally small cranium
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Bifid uvula
- Broad head shape
- Decreased depth of eye sockets
- Delayed cranial suture closure
- Depressed nasal bridge
- Frontal bossing
- Long philtrum
- Low hairline at back of neck
- Low insertion of columella
- Prominent metopic ridge
- Short nose
- Small retruded chin
- Thin red part of the upper lip
- Wide mouth
- Wry neck
Abnormality of the digestive system
- Enlarged liver
- Villous atrophy
- Liver cysts
- Omphalocele
- Periportal fibrosis
- Accumulation of fluid in the abdomen
- Acid reflux
- Diarrhea
Vis 3 træk mere
Laboratory abnormality
- Decreased circulating cholesterol level
- Low albumin
- Type I transferrin isoform profile
- Elevated creatinine
- Abnormal urinary electrolyte concentration
- Albuminuria
- Blood in urine
- Fetal skin edema
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-18: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.18-8b139e39.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). ALG9-genet: ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/alg9
Dante Labs. ALG9-genet: ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/alg9
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger