Genas
SHH
sonic hedgehog signaling molecule
- HGNC 10848↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000164690↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6469↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 7q36.3
- Koordinatės
- Chromosoma 7: 155 799 980–155 812 463 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 12,5 kb
- Baltymas
- 462 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- HHG1, SMMCI, TPT, TPTPS, MCOPCB5
- Ankstesni simboliai
- HPE3, HLP3
- MANE Select transkriptas
- ENST00000297261.7NM_000193.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite SHH ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Mikroftalmija, anoftalmija ir koloboma
- Izoliuota anoftalmija, mikroftalmija ir koloboma
Akių apsigimimai be kitų požymių, įskaitant nanoftalmą, kuriuos sukelia pokyčiai tokiuose genuose kaip VSX2, RAX, MFRP, PRSS56 ir kituose.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Žmonėms, turintiems nanoftalmą (dažnai MFRP arba PRSS56), didesnė rizika susirgti uždarojo kampo glaukoma, todėl jiems reikia reguliarių akių patikrinimų. Genetinė diagnozė taip pat padeda įvertinti pasikartojimo riziką.
Nepaverstas kombinuotas hipofizės hormonų nepakankamumas
Įgimtam hipopituitarizmui būdingas kelių hipofizės hormonų nepakankamumas, įskaitant somatotrofų, tirotrofų, laktotrofų, kortikotrofų ar gonadotrofų nepakankamumą, kuris atsiranda dėl hipofizės transkripcijos faktorių, dalyvaujančių hipofizės ontogenezėje, mutacijų.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 5 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Kaip išdėstytas SHH
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,7 kb iš 12,5 kb geno; 1 389 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito SHH
83
SHH geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 12,5 kb SHH geno, įskaitant intronus, o ne tik 4,7 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ALDH1A3aldehyde dehydrogenase 1 family member A3Turi 1 bendrą būklę
- CDONcell adhesion associated, oncogene regulatedTuri 1 bendrą būklę
- CNOT1CCR4-NOT transcription complex subunit 1Turi 1 bendrą būklę
- DISP1dispatched RND transporter family member 1Turi 1 bendrą būklę
- FZD5frizzled class receptor 5Turi 1 bendrą būklę
- GLI2GLI family zinc finger 2Turi 1 bendrą būklę
- GLI3GLI family zinc finger 3Turi 1 bendrą būklę
- LHX3LIM homeobox 3Turi 1 bendrą būklę
- LHX4LIM homeobox 4Turi 1 bendrą būklę
- MFRPmembrane frizzled-related proteinTuri 1 bendrą būklę
- PLCH1phospholipase C eta 1Turi 1 bendrą būklę
- PRSS56serine protease 56Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su SHH
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SHH, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal central motor function
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormal shape of midbrain
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Absent speech development
- Anxiety
Rodyti dar 30 savybių
- Aplasia of the falx cerebri
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Communication delay
- Depression
- Epilepsy
- Holoprosencephaly
- Impulsivity
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lethargy
- Limb dystonia
- Neural tube defect
- Oromotor apraxia
- Poor speech
- Short attention span
- Sleep-wake cycle disturbance
- Specific learning disability
- Abnormal septum pellucidum morphology
- Agenesis of corpus callosum
- Enlarged brain
- Hypoplasia of the pons
- Intellectual disability, mild
- Perisylvian polymicrogyria
- Rhombencephalosynapsis
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Global developmental delay
- Ventriculomegaly
Abnormality of head or neck
- Only one upper front tooth
- Prominent central ridge on roof of the mouth
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Midnasal stenosis
- Abnormally small head
- Bifid uvula
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
Rodyti dar 23 savybių
- Flat nose
- High palate
- Narrow nasal bridge
- Short philtrum
- Tented mouth
- Abnormal nasopharynx morphology
- Big calvaria
- Cleft of the mouth
- Cleft upper lip
- Frontoethmoidal encephalocele
- Lost smell
- Mono nostril
- Nasal tip, upturned
- Proboscis
- Short nose
- Abnormality of the nose
- Cleft lip
- Depressed nasal bridge
- Midface retrusion
- Pyriform aperture stenosis
- Short columella
- Torus palatinus
- Zygomatic flattening
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal vertebral morphology
- Abnormality of the ribs
- Decreased muscle tone in infant
- Generalized decreased muscle tone
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Abnormality of the skeletal system
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
Rodyti dar 3 savybių
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Poor suck
- Acid reflux
- Constipation
- Poor swallowing
- Vomiting
- Abnormal shape of the digestive system
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Rodyti dar 2 savybių
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal hypothalamus physiology
- Abnormality of the endocrine system
- Anterior hypopituitarism
- Central diabetes insipidus
- Decreased response to growth hormone stimulation test
- Diabetes insipidus
- Early onset of puberty
- Central hypothyroidism
Rodyti dar 2 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SHH genas: sonic hedgehog signaling molecule. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/shh
Dante Labs. SHH genas: sonic hedgehog signaling molecule [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/shh
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites