Gen
SHH
sonic hedgehog signaling molecule
- HGNC 10848↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000164690↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6469↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 7q36.3
- Coördinaten
- Chromosoom 7: 155.799.980–155.812.463 (GRCh38)
- Exons
- 3 exons over 12,5 kb
- Eiwit
- 462 aminozuren
- Ook bekend als
- HHG1, SMMCI, TPT, TPTPS, MCOPCB5
- Eerdere symbolen
- HPE3, HLP3
- MANE Select-transcript
- ENST00000297261.7NM_000193.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees SHH en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Microftalmie, anoftalmie en coloboom
- Geïsoleerde anoftalmie, microftalmie en coloboom
Oogmissvormingen zonder andere kenmerken, waaronder nanoftalmos, veroorzaakt door veranderingen in genen zoals VSX2, RAX, MFRP, PRSS56 en andere.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Mensen met nanoftalmos (vaak door MFRP of PRSS56) hebben een verhoogd risico op hoekgesloten glaucoom en hebben regelmatige oogcontroles nodig; een genetische diagnose geeft ook inzicht in het herhalingsrisico.
Niet-verworven gecombineerd hypofysehormoondeficiëntiesyndroom
Congenitaal hypopituïtarisme wordt gekenmerkt door een tekort aan meerdere hypofysehormonen, waaronder tekorten aan somatotrofe, thyreotrofe, lactotrofe, corticotrofe of gonadotrofe cellen, als gevolg van mutaties in hypofysetranscriptiefactoren die betrokken zijn bij de ontwikkeling van de hypofyse.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van SHH
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 4,7 kb van de 12,5 kb van het gen; 1.389 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest SHH leest
83
posities in SHH waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 12,5 kb van SHH, inclusief introns, en niet alleen de 4,7 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ALDH1A3aldehyde dehydrogenase 1 family member A3Deelt 1 aandoening
- CDONcell adhesion associated, oncogene regulatedDeelt 1 aandoening
- CNOT1CCR4-NOT transcription complex subunit 1Deelt 1 aandoening
- DISP1dispatched RND transporter family member 1Deelt 1 aandoening
- FZD5frizzled class receptor 5Deelt 1 aandoening
- GLI2GLI family zinc finger 2Deelt 1 aandoening
- GLI3GLI family zinc finger 3Deelt 1 aandoening
- LHX3LIM homeobox 3Deelt 1 aandoening
- LHX4LIM homeobox 4Deelt 1 aandoening
- MFRPmembrane frizzled-related proteinDeelt 1 aandoening
- PLCH1phospholipase C eta 1Deelt 1 aandoening
- PRSS56serine protease 56Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SHH
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SHH kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal central motor function
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormal shape of midbrain
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Absent speech development
- Anxiety
Toon 30 kenmerken meer
- Aplasia of the falx cerebri
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Communication delay
- Depression
- Epilepsy
- Holoprosencephaly
- Impulsivity
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lethargy
- Limb dystonia
- Neural tube defect
- Oromotor apraxia
- Poor speech
- Short attention span
- Sleep-wake cycle disturbance
- Specific learning disability
- Abnormal septum pellucidum morphology
- Agenesis of corpus callosum
- Enlarged brain
- Hypoplasia of the pons
- Intellectual disability, mild
- Perisylvian polymicrogyria
- Rhombencephalosynapsis
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Global developmental delay
- Ventriculomegaly
Abnormality of head or neck
- Only one upper front tooth
- Prominent central ridge on roof of the mouth
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Midnasal stenosis
- Abnormally small head
- Bifid uvula
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
Toon 23 kenmerken meer
- Flat nose
- High palate
- Narrow nasal bridge
- Short philtrum
- Tented mouth
- Abnormal nasopharynx morphology
- Big calvaria
- Cleft of the mouth
- Cleft upper lip
- Frontoethmoidal encephalocele
- Lost smell
- Mono nostril
- Nasal tip, upturned
- Proboscis
- Short nose
- Abnormality of the nose
- Cleft lip
- Depressed nasal bridge
- Midface retrusion
- Pyriform aperture stenosis
- Short columella
- Torus palatinus
- Zygomatic flattening
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal vertebral morphology
- Abnormality of the ribs
- Decreased muscle tone in infant
- Generalized decreased muscle tone
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Abnormality of the skeletal system
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
Toon 3 kenmerken meer
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Poor suck
- Acid reflux
- Constipation
- Poor swallowing
- Vomiting
- Abnormal shape of the digestive system
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal hypothalamus physiology
- Abnormality of the endocrine system
- Anterior hypopituitarism
- Central diabetes insipidus
- Decreased response to growth hormone stimulation test
- Diabetes insipidus
- Early onset of puberty
- Central hypothyroidism
Toon 2 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SHH-gen: sonic hedgehog signaling molecule. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/shh
Dante Labs. SHH-gen: sonic hedgehog signaling molecule [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/shh
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken