Gén
IKBKG
inhibitor of nuclear factor kappa B kinase regulatory subunit gamma
- HGNC 5961↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000269335↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 8517↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- Xq28
- Koordináták
- X. kromoszóma: 154 547 620–154 565 033 (GRCh38)
- Exonok
- 10 exon, összesen 17,4 kb
- Fehérje
- 419 aminosav
- Más néven ismert
- IKK-gamma, NEMO, Fip3p, FIP-3, FIP3, IKKAP1, IKKG
- Korábbi jelölések
- IP2, IP1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000594239.6NM_001099857.5
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ikbkg.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a IKBKG-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
X-linked Autoinflammatory Disease
- Autoinflammatory Disease, X-Linked
An autoinflammatory syndrome characterized by the onset of systemic autoinflammation in the first months of life. Features include lymphadenopathy, hepatosplenomegaly, fever, panniculitis, and nodular skin rash. Additional manifestations may include inflammation of the optic nerve, intracranial hemorrhage, and lipodystrophy.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Ectodermal Dysplasias
- Hypohidrotic Ectodermal Dysplasia
A genetic disorder of ectoderm development characterized by malformation of ectodermal structures such as skin, hair, teeth and sweat glands. It comprises three clinically almost indistinguishable subtypes with impaired sweating as the key symptom: Christ-Siemens-Touraine (CST) syndrome (X-linked), autosomal recessive (AR), and autosomal dominant (AD) HED, as well as a fourth rare subtype with immunodeficiency as the key symptom (HED with immunodeficiency).
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Vitreoretinopathy
- Incontinentia PigmentiX-kromoszómához kötött domináns
Incontinentia pigmenti (IP) is a rare X-linked dominant multi-systemic ectodermal dysplasia usually lethal in males and presenting neonatally in females with a bullous rash along Blashko's lines (BL) followed by verrucous plaques evolving over time to hyperpigmented swirling patterns. It is further characterized by teeth abnormalities, alopecia, nail dystrophy and affects occasionally the retina and the central nervous system (CNS).
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
A 114 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Immunodeficiency Disease
A 170 hozzá kapcsolódó gén egyike
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
A IKBKG felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 17,4 kb-jából 2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1260 bázis kódolja a fehérjét.
IKBKG szekvenálása
92Nehéz
Mennyire nehéz a IKBKG rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A IKBKG nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.
Ehhez hozzájárul: a IKBKG exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.83%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.83%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.1,8%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.39%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a IKBKG exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
19
a IKBKG azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül 18 (95%) olyan régiókban van, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (18 hely)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (18 hely)
A teljes genom a IKBKG mind a 17,4 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 2 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (19)
The IKBKG variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 8
- Valószínűleg patogén 11
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_001099857.5(IKBKG):c.1167dup (p.Glu390fs) (opens in a new tab) | ectodermal dysplasia and immunodeficiency 1 and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.358C>T (p.Gln120Ter) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.373del (p.Val125fs) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.519-3_519dup (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.706C>T (p.Gln236Ter) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.766C>T (p.Arg256Ter) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.805C>T (p.Gln269Ter) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.1110del (p.Ala371fs) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.41_56dup (p.Pro20fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 33 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.262GAG[1] (p.Glu89del) (opens in a new tab) | ectodermal dysplasia and immunodeficiency 1 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.363_367del (p.Leu122fs) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.470A>C (p.Gln157Pro) (opens in a new tab) | ectodermal dysplasia and immunodeficiency 1 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.563dup (p.Glu189fs) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.574C>T (p.Gln192Ter) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.768+5G>T (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.931G>A (p.Asp311Asn) (opens in a new tab) | ectodermal dysplasia and immunodeficiency 1 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.949C>T (p.Gln317Ter) (opens in a new tab) | incontinentia pigmenti | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.1217A>T (p.Asp406Val) (opens in a new tab) | ectodermal dysplasia and immunodeficiency 1 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_001099857.5(IKBKG):c.1219A>G (p.Met407Val) (opens in a new tab) | autoinflammatory disease, X-linked | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- AICDAactivation induced cytidine deaminase2 betegséget oszt meg
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 12 betegséget oszt meg
- BCL10BCL10 immune signaling adaptor2 betegséget oszt meg
- BCL11BBCL11 transcription factor B2 betegséget oszt meg
- BLNKB cell linker2 betegséget oszt meg
- BTKBruton tyrosine kinase2 betegséget oszt meg
- C1QAcomplement C1q A chain2 betegséget oszt meg
- C1QBcomplement C1q B chain2 betegséget oszt meg
- C1QCcomplement C1q C chain2 betegséget oszt meg
- C1Scomplement C1s2 betegséget oszt meg
- C2complement C22 betegséget oszt meg
- C3complement C32 betegséget oszt meg
A(z) IKBKG génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) IKBKG gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the immune system
- Absent circulating isohemagglutinin
- Bacterial cellulitis
- Bacterial meningitis
- Complete or near-complete absence of specific antibody response to unconjugated pneumococcus polysaccharide
- Decreased immune function
- Inflammation of fat tissue
- Pneumocystis jirovecii pneumonia
- Pneumonia
Még 24 tulajdonság megjelenítése
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent bacterial meningitis
- Recurrent chest infections
- Recurrent cutaneous abscess formation
- Recurrent Giardia lamblia infection
- Recurrent pneumonia
- Recurrent sepsis
- Severe Pseudomonas aeruginosa infection
- Unusual infectious osteomyelitis
- Unusual mycobacterial infection
- Viral meningitis
- Pustular rash
- Vesicular eruption
- Bone infection
- Recurrent mucocutaneous candidiasis
- Recurrent mycobacterial infections
- Unusual molluscum contagiosum
- Autoimmunity
- Eczema
- Invasive fungal infection
- Maculopapular exanthema
- Severe cytomegalovirus infection
- Severe viral infection
- Disseminated non-tuberculous mycobacterial infection
Abnormality of head or neck
- Cone shaped front baby tooth
- Cone shaped front tooth
- Cone shaped tooth
- Failure of development of between one and six teeth
- Frontal bossing
- Peg-shaped maxillary lateral incisors
- Sparse eyebrow
- Wrinkles around the eyes
Még 14 tulajdonság megjelenítése
- Abnormality of dental shape
- Delayed eruption of baby teeth
- Delayed eruption of teeth
- Sparse scalp hair
- Abnormally small head
- Absence of scalp hair
- Cleft of the mouth
- Cleft palate
- Decreased size of tooth
- Delayed eruption of permanent teeth
- Failure of development of more than six teeth
- Impacted tooth
- Recurrent sinus disease
- Sparse eyelashes
Abnormality of the eye
- Anterior uveitis
- Chorioretinitis
- Corneal opacity
- Cross-eyed
- Optic neuritis
- Panuveitis
- Abnormally small eyeball
- Clouding of the lens of the eye
Még 6 tulajdonság megjelenítése
Abnormal cellular phenotype
- Abnormal natural killer cell physiology
- Decreased circulating antibody level
- Decreased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgG concentration
- Decreased circulating IgG2 concentration
- Abnormal circulating immunoglobulin concentration
- Increased circulating IgA concentration
- Decreased circulating IgM concentration
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Bleeding in brain
- Granulomatosis
- Increased total B cell count
- Low B cell count
- Increased total T cell count
- Low blood neutrophil count
- Elevated white blood count
- High blood eosinophil count
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). IKBKG gén: inhibitor of nuclear factor kappa B kinase regulatory subunit gamma. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ikbkg
Dante Labs. IKBKG gén: inhibitor of nuclear factor kappa B kinase regulatory subunit gamma [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ikbkg
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt